Պայմերի և պրոմոութորի հիմնական տարբերությունն այն է, որ պրայմերը կոմերցիոնորեն սինթեզված ԴՆԹ-ի կարճ հաջորդականություն է, որն օգտագործվում է ՊՇՌ-ում թիրախ ԴՆԹ-ի հաջորդականության ուժեղացման համար, մինչդեռ պրոմոտորը ԴՆԹ-ի հատուկ հաջորդականություն է, որն ապահովում է ՌՆԹ-ի համար ապահով սկզբնական միացման տեղ: պոլիմերազ և տրանսկրիպցիոն գործոններ՝ տրանսկրիպցիան սկսելու համար։
Պրայմերն ու պրոմոտորը ԴՆԹ-ի հաջորդականության երկու տեսակ են: Primer-ը ԴՆԹ-ի փոքր հատված է, որն անհրաժեշտ է պոլիմերազային շղթայական ռեակցիայի (PCR) համար: Այն ունի կարճ նուկլեոտիդային հաջորդականություններ, որոնք լրացնում են ԴՆԹ-ի շղթայի կողային ծայրին: Գոյություն ունեն երկու տեսակի այբբենարան, և դրանք գործում են որպես ԴՆԹ-ի նոր շղթաների սինթեզի մեկնարկային կետեր:Ի հակադրություն, պրոմոտորը ԴՆԹ-ի հատուկ հաջորդականություն է, որը գտնվում է գենի տրանսկրիպցիայի մեկնարկի վայրի վերևում: Այն ուղղակիորեն փոխազդում է տառադարձման մեխանիզմի բաղադրիչների հետ, ինչպիսիք են ՌՆԹ պոլիմերազը և տրանսկրիպցիոն գործոնները՝ ԴՆԹ-ի տրանսկրիպցիան վերահսկելու համար: Հետևաբար, ՌՆԹ պոլիմերազը և տրանսկրիպցիոն այլ գործոնները կապվում են խթանող հաջորդականության հետ և սկսում տրանսկրիպցիան:
Ի՞նչ է այբբենարանը:
Պայմերները ԴՆԹ-ի կարճ հաջորդականություններ են, որոնք նախատեսված են թիրախային ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների ուժեղացման համար: Կառուցվածքային առումով նրանք ունեն կարճ նուկլեոտիդային հաջորդականություններ, որոնք լրացնում են ԴՆԹ-ի կրկնակի շղթաների կողային ծայրերը: Նրանք սովորաբար ունեն մոտ 20 նուկլեոտիդների երկարություն: PCR-ի ժամանակ Taq պոլիմերազը կատալիզացնում է նուկլեոտիդների ավելացումը նախապես գոյություն ունեցող նուկլեոտիդային հաջորդականության մեջ: Այսպիսով, այբբենարանները ծառայում են որպես նոր թելերի սինթեզի մեկնարկային կետեր: Taq պոլիմերազը գործում է միայն 5'-ից 3' ուղղությամբ: Հետևաբար, ԴՆԹ-ի սինթեզը նույնպես տեղի է ունենում նույն 5'-ից 3' ուղղությամբ: Քանի որ ԴՆԹ-ն կրկնակի շղթա է, PCR-ում անհրաժեշտ են երկու տեսակի պրայմերներ:Դրանք հայտնի են որպես առաջնային և հակադարձ այբբենարան՝ հիմնված ԴՆԹ-ի սինթեզի ընթացքում այբբենարանի երկարացման ուղղության վրա:
Նկար 01. այբբենարաններ
Առաջային այբբենարան կռվում է հակազգայուն ԴՆԹ շղթայով և սկսում է գենի + շղթայի սինթեզը 5'-ից 3' ուղղությամբ: Այն ունի կարճ նուկլեոտիդային հաջորդականություն, որը լրացնում է հակազգայական շղթայի 3-կողային ծայրին: Հակադարձ այբբենարանը զտվում է զգայական շղթայի հետ և սկսում է կոդավորող շղթայի լրացուցիչ շղթայի սինթեզը, որը հանդիսանում է գենի մի շղթա 5'-ից 3' ուղղությամբ: Այսպիսով, հակադարձ այբբենարանը նախագծված է որպես լրացնող կոդավորման շղթայի 3' ծայրին: Ե՛վ հակադարձ, և՛ առաջնային այբբենարանները կարևոր են թիրախավորված կամ հետաքրքրված ԴՆԹ-ի որոշակի շրջանների միլիոնավորից միլիարդավոր պատճենների արտադրության համար:
Ի՞նչ է խթանողը:
Պրոմոտորը ԴՆԹ-ի հաջորդականություն է, որը գտնվում է գենի տրանսկրիպցիան սկսելու վայրի վերևում կամ 5' վերջում: Այն ապահովում է կապող տեղ ՌՆԹ պոլիմերազի և որոշ կարգավորող տարրերի համար՝ գենի տրանսկրիպցիան սկսելու համար: Դա կարգավորող հաջորդականություն է, որն անհրաժեշտ է գենը միացնելու կամ անջատելու համար: Պրոմոտորում կա նուկլեոտիդային հատուկ հաջորդականություն: Այն կարող է ունենալ 100–1000 բազային զույգ։ Խթանիչը ցույց է տալիս տառադարձման ուղղությունը: Ավելին, այն ցույց է տալիս իմաստային շարանը, որը պետք է արտագրվի:
Նկար 02. Գենի խթանող
Գոյություն ունեն խթանող տարրերի երեք տեսակ՝ հիմնական պրոմոութեր, պրոքսիմալ պրոմոուտեր և հեռավոր պրոմոութեր: Հիմնական խթանիչը խթանողի նվազագույն մասն է, որն անհրաժեշտ է տառադարձումը սկսելու համար:Այն գտնվում է սկզբնական կոդոնին առավել մոտակայքում: TATA տուփը պահպանված շրջան է, որը հայտնաբերված է բազմաթիվ էուկարիոտների միջուկի խթանիչներում: Այն հայտնաբերվել է 25-ից 35 բազային զույգեր վերագրանցման մեկնարկի վայրից վեր: Պրոկսիմալ պրոմոութերը ավելի շատ հայտնաբերվում է առանցքային պրոմոուտերի վերևում: Ընդհանուր առմամբ, այն գտնվում է 250 բազային զույգերով դեպի սկզբնական կոդոն և պարունակում է առաջնային կարգավորող տարրեր: Դիստալ պրոմոութերը հայտնաբերվում է դեպի պրոքսիմալ պրոմոութեր հոսանքին հակառակ և այն պարունակում է լրացուցիչ կարգավորող տարրեր: Բակտերիաների խթանիչները ունեն երկու կարճ հաջորդականության տարրեր իրենց պրոմոդերներում: TATAAT-ը կոնսենսուսային հաջորդականությունն է, որը գտնվում է բակտերիալ խթանիչի -10-ում, մինչդեռ TTGACA-ն կոնսենսուսային հաջորդականությունն է -35-ում: Դրանք հայտնի են որպես -10 տարր և -35 տարր։
Որո՞նք են նմանությունները Primer-ի և Promoter-ի միջև:
- Primer-ը և խթանիչը ԴՆԹ-ի երկու տեսակի հաջորդականություն են:
- Դրանք կազմված են նուկլեոտիդային հաջորդականություններից։
- Եվ այբբենարանը և խթանիչը կարևոր են գեների արտահայտման համար:
Ո՞րն է տարբերությունը Primer-ի և Promoter-ի միջև:
Primer-ը կարճ նուկլեոտիդային հաջորդականություն է, որը նախատեսված է թիրախային ԴՆԹ-ի ուժեղացման համար: Ի հակադրություն, պրոմոտորը հատուկ կարգավորող ԴՆԹ-ի հաջորդականություն է, որը հայտնաբերված է գենի տրանսկրիպցիայի մեկնարկի վայրի վերևում: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է այբբենարանի և խթանողի միջև: Այբբենարանները ունեն մոտ 20 բազային զույգ երկարություն, մինչդեռ պրոմոութերը կարող է ունենալ 100-1000 բազային զույգ: Ֆունկցիոնալ առումով, պրայմերները ծառայում են որպես նոր շղթայի սինթեզի մեկնարկային հաջորդականություն, մինչդեռ խթանողները վերահսկում են գենի տրանսկրիպցիան՝ ապահովելով կապող վայրեր ՌՆԹ պոլիմերազի և տրանսկրիպցիոն այլ գործոնների համար::
Ավելին, պրոմոտորը սահմանվում է որպես տառադարձության ուղղություն և ցույց է տալիս գենի զգայական շարանը: Կառուցվածքային առումով, այբբենարանը կարճ, միաշղթա ԴՆԹ-ի հաջորդականություն է, մինչդեռ պրոմոտորը երկար երկշղթա ԴՆԹ-ի հաջորդականություն է:
Ստորև բերված տեղեկատվական գրաֆիկը աղյուսակում է ավելի շատ համեմատություններ՝ կապված այբբենարանի և պրոմոութերի տարբերության հետ:
Ամփոփում – Primer vs Promoter
Պայմերները կարճ նուկլեոտիդային հաջորդականություններ են, որոնք լրացնում են թիրախ ԴՆԹ-ի երկշղթայի կողային ծայրերը: PCR-ում օգտագործվում են երկու տեսակի պրայմերներ. Նրանք ծառայում են որպես նոր թելերի սինթեզի մեկնարկային հաջորդականություն։ Այբբենարանները կոմերցիոն նախագծված են, և դրանք ջերմաստիճանի կայուն հաջորդականություններ են: Մյուս կողմից, պրոմոութերը գենի կարգավորիչ հաջորդականություն է, որը գտնվում է վերևում դեպի տառադարձման մեկնարկի վայր: Խթանողները վերահսկում են գեների արտագրումը: Նրանք ապահովում են կապող վայրեր ՌՆԹ պոլիմերազի և տրանսկրիպցիոն գործոնների համար՝ տրանսկրիպցիան սկսելու համար: Այսպիսով, սա այբբենարանի և խթանողի միջև տարբերության ամփոփումն է:
