Հիմնական տարբերություն – քրոմոսոմային քայլք ընդդեմ ցատկելու
Քրոմոսոմային քայլքը և քրոմոսոմային թռիչքը երկու տեխնիկական գործիքներ են, որոնք օգտագործվում են մոլեկուլային կենսաբանության մեջ՝ քրոմոսոմների վրա գեները տեղորոշելու և գենոմների ֆիզիկական քարտեզագրման համար: Քրոմոսոմով քայլելը տեխնիկա է, որն օգտագործվում է գենոմային գրադարանում թիրախ գենը կլոնավորելու համար՝ գենոմային գրադարանի հարակից կլոնների կրկնակի մեկուսացման և կլոնավորման միջոցով: Քրոմոսոմային ցատկումը քրոմոսոմային քայլքի հատուկ տարբերակ է, որը հաղթահարում է քրոմոսոմային քայլելու բեկման կետերը: Քրոմոսոմային քայլքը կարող է միայն հաջորդականացնել և քարտեզագրել քրոմոսոմների փոքր երկարությունները, մինչդեռ քրոմոսոմային թռիչքը թույլ է տալիս քրոմոսոմների մեծ մասերի հաջորդականությունը:Սա է հիմնական տարբերությունը քրոմոսոմային քայլքի և քրոմոսոմային թռիչքի միջև:
Ի՞նչ է քրոմոսոմային քայլքը:
Քրոմոսոմային քայլքը գործիք է, որն ուսումնասիրում է քրոմոսոմների անհայտ հաջորդականության շրջանները՝ օգտագործելով համընկնող սահմանափակող բեկորներ: Քրոմոսոմով քայլելու ժամանակ հայտնի գենի մի մասը օգտագործվում է որպես զոնդ և շարունակվում է քարտեզագրվող կամ հաջորդականացվող քրոմոսոմի ամբողջ երկարությունը բնութագրելով: Սա անցնում է մարկերից մինչև թիրախային երկարությունը: Քրոմոսոմային քայլում յուրաքանչյուր համընկնող բեկորների ծայրերը օգտագործվում են հիբրիդացման համար՝ հաջորդ հաջորդականությունը բացահայտելու համար:
Զոնդերը պատրաստվում են կլոնավորված ԴՆԹ-ի ծայրամասային մասերից և դրանք ենթակլոնավորվում: Այնուհետև դրանք օգտագործվում են հաջորդ համընկնող հատվածը գտնելու համար: Այս բոլոր համընկնող հաջորդականությունները օգտագործվում են քրոմոսոմի գենետիկ քարտեզը կառուցելու և թիրախ գեները գտնելու համար։ Դա ԴՆԹ-ի երկար հատվածների վերլուծության մեթոդ է վերակառուցված գենոմային գրադարանից փոքր համընկնող բեկորների միջոցով:
Քրոմոսոմով քայլելու տեխնիկա – Քայլեր
-
ԴՆԹ-ի հատվածի մեկուսացում, որը պարունակում է հայտնի գեն կամ մարկեր թիրախ գենի մոտ
- Ընտրված հատվածի սահմանափակման քարտեզի պատրաստում և հատվածի վերջնական շրջանի ենթակլոնավորում՝ որպես զոնդ օգտագործելու համար
- Զոնդի հիբրիդացում հաջորդ համընկնող բեկորով
- 1-ին հատվածի սահմանափակման քարտեզի պատրաստում և 1-ին հատվածի վերջնամասի ենթակլոնավորում՝ հաջորդ համընկնվող հատվածի նույնականացման համար որպես զոնդ օգտագործելու համար:
- Զոնդի հիբրիդացում հաջորդ համընկնող բեկորով 2
- Պատրաստ 2-ի սահմանափակման քարտեզի պատրաստում և հատված 2-ի վերջի շրջանի ենթակլոնավորում՝ հաջորդ համընկնվող հատվածի նույնականացման համար զոնդ ծառայելու համար
Վերոհիշյալ քայլերը պետք է շարունակվեն մինչև թիրախային գենը կամ հաջորդականության ընդհանուր երկարության մինչև 3' վերջը:
Նկար 01. Քրոմոսոմային քայլելու տեխնիկա
Քրոմոսոմային քայլքը ցիտոգենետիկայի կարևոր ասպեկտ է բազմաթիվ օրգանիզմների SNP-ների հայտնաբերման և գենետիկորեն փոխանցվող հիվանդությունների վերլուծության և համապատասխան գեների մուտացիաների հայտնաբերման գործում:
Ի՞նչ է քրոմոսոմային թռիչքը:
Քրոմոսոմային թռիչքը մեթոդ է, որն օգտագործվում է մոլեկուլային կենսաբանության մեջ՝ օրգանիզմների գենոմների ֆիզիկական քարտեզագրման համար: Այս տեխնիկան ներդրվել է հաղթահարելու քրոմոսոմային քայլքի արգելքը, որն առաջացել է կլոնավորման գործընթացում ԴՆԹ-ի կրկնվող հատվածները հայտնաբերելուց հետո: Ուստի քրոմոսոմային թռիչքի տեխնիկան կարելի է համարել որպես քրոմոսոմային քայլելու հատուկ տարբերակ։ Այն արագ մեթոդ է, համեմատած քրոմոսոմային քայլքի հետ և հնարավորություն է տալիս շրջանցել ԴՆԹ-ի կրկնվող հաջորդականությունները, որոնք հակված չեն կլոնավորվել քրոմոսոմային քայլելու ընթացքում:Քրոմոսոմային թռիչքը նեղացնում է թիրախային գենի և գենոմի քարտեզագրման համար հասանելի հայտնի մարկերների միջև եղած բացը:
Քրոմոսոմային ցատկման գործիքը սկսվում է հատուկ սահմանափակող էնդոնուկլեազներով հատուկ ԴՆԹ-ի կտրումով և բեկորների միացումով շրջանաձև օղակների մեջ: Այնուհետև հայտնի հաջորդականությունից նախագծված այբբենարան օգտագործվում է շրջանաձև օղակները հաջորդականացնելու համար: Այս այբբենարանը հնարավորություն է տալիս ցատկել և հաջորդականացնել այլընտրանքային եղանակով: Հետևաբար, այն կարող է շրջանցել ԴՆԹ-ի կրկնվող հաջորդականությունները և արագ քայլել քրոմոսոմով՝ թիրախ գենը որոնելու համար:
Կիստիկական ֆիբրոզ հիվանդության համար կոդավորող գենի հայտնաբերումը կատարվել է քրոմոսոմային ցատկման գործիքի միջոցով: Միասին քրոմոսոմային թռիչքը և քայլելը կարող են բարելավել գենոմի քարտեզագրման գործընթացը:
Նկար 02. քրոմոսոմային թռիչք
Ո՞րն է տարբերությունը քրոմոսոմով քայլելու և ցատկելու միջև:
Քրոմոսոմային քայլք ընդդեմ ցատկելու |
|
| Քրոմոսոմը գործիք է, որն օգտագործվում է մոլեկուլային կենսաբանության մեջ՝ գենոմի քարտեզագրման և հատուկ գեների տեղորոշման համար: | Chromosome jumping-ը գործիք է, որն օգտագործվում է գենոմների ֆիզիկական քարտեզագրման և քրոմոսոմներում թիրախ գեների արագ հայտնաբերման համար: |
| Հաջորդականության համեմատական երկարություններ | |
| Միայն փոքր բեկորները կարող են կլոնավորվել քրոմոսոմային քայլքով: | Քրոմոսոմների ավելի մեծ երկարությունները կարելի է քարտեզագրել քրոմոսոմային թռիչքով: |
| Կլոնավորում կրկնվող ԴՆԹ քրոմոսոմներում | |
| Քրոմոսոմով քայլելու տեխնիկան դժվարությամբ է քայլում քրոմոսոմներում հայտնաբերված ԴՆԹ-ի կրկնվող հաջորդականությունների միջով: | Այն հնարավորություն է տալիս շրջանցել ԴՆԹ-ի կրկնվող հաջորդականությունները: Հետևաբար, հաջորդականության ընթացքում դրանք գտնելիս դժվարություն չկա: |
| Գործընթացների վրա ազդող գործոններ | |
| Գործընթացի հաջողությունը կախված է գենոմի չափից և այն հեռավորությունից, որը պետք է «քայլել» հայտնի գենոմային դիրքից դեպի ցանկալի գեն: | Հաջողությունը կախված չէ մարկերից թիրախ հեռավորության գենոմի չափից: |
| Չկլոնավորված ԴՆԹ-ի ազդեցությունները | |
| Քրոմոսոմային քայլքը կարող է դադարեցվել ԴՆԹ-ի չկլոնավորված բեկորներով: | Ամենացածր նոտան, որը կարող են խաղալ piccolos-ը, D4 է: |
| Հայտնի հաջորդականության անհրաժեշտություն | |
| Գործընթացը սկսվում է թիրախին մոտ գտնվող հայտնի գենից: | Գործընթացը պահանջում է հայտնի հատված այբբենարանի ձևավորման համար: |
Ամփոփում – Քրոմոսոմային քայլք ընդդեմ ցատկելու
Քրոմոսոմային քայլքը հաճախ կիրառվում է, երբ հայտնի է, որ որոշակի գեն գտնվում է քրոմոսոմում նախկինում կլոնավորված գենի մոտ, և հնարավոր է այն նույնացնել գենոմային գրադարանից հարակից գենոմային կլոնների կրկնակի մեկուսացման միջոցով: Այնուամենայնիվ, երբ քրոմոսոմային քայլելու տեխնիկայի ընթացքում հայտնաբերվում են ԴՆԹ-ի կրկնվող շրջաններ, գործընթացը չի կարող շարունակվել: Այսպիսով, տեխնիկան այդ կետից կոտրվում է: Քրոմոսոմային թռիչքը մոլեկուլային կենսաբանական գործիք է, որը հաղթահարում է գենոմների քարտեզագրման այս սահմանափակումը: Այն շրջանցում է ԴՆԹ-ի այս կրկնվող շրջանները, որոնք դժվար է կլոնավորել և օգնում է գենոմների ֆիզիկական քարտեզագրմանը: Սա է քրոմոսոմային քայլելու և ցատկելու հիմնական տարբերությունը։
