Քսիլեն ցիանոլի և բրոմֆենոլ կապույտի հիմնական տարբերությունն այն է, որ 1% ագարոզայի գելում քսիլեն ցիանոլն ավելի դանդաղ է ներգաղթում, մինչդեռ բրոմֆենոլ կապույտն ավելի արագ է արտագաղթում:
Քսիլենային ցիանոլը և բրոմֆենոլ կապույտը կարևոր են որպես գունային մարկերներ, որոնք կարող են օգտագործվել ագարոզայի գելի էլեկտրոֆորեզի և պոլիակրիլամիդային գելային էլեկտրոֆորեզի գործընթացի մոնիտորինգի համար:
Ի՞նչ է Xylene Cyanol?
Քսիլենային ցիանոլը էլեկտրաֆորետիկ գունային մարկեր է կամ հետևող ներկ: Այն օգտակար է ագարոզային գելային էլեկտրոֆորեզի և պոլիակրիլամիդային գելային էլեկտրոֆորեզի գործընթացի մոնիտորինգի համար: Երբ այս նյութը խառնվում է նմուշի հետ, այս նյութի կոնցենտրացիան սովորաբար դառնում է մոտ 0:005% -ից մինչև 0.03%: Որոշ հոմանիշներ, որոնք մենք կարող ենք օգտագործել քսիլեն ցիանոլի համար, ներառում են Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF և այլն:
Այս միացության քիմիական բանաձևն է C25H27N2NaO 6S2 Քսիլեն ցիանոլի մոլային զանգվածը 538,61 գ/մոլ է: Այս նյութը կարող է գաղթել մոտ 4-5 կիլոբազային զույգ ԴՆԹ-ի բեկորներով 1% ագարոզայի գելերում: Այնուամենայնիվ, դա կախված է այն բուֆերից, որը մենք օգտագործում ենք: Սովորաբար, քսիլեն ցիանոլը 6% պոլիակրիլամիդ գելի վրա կարող է գաղթել մոտ 140 բազային զույգ ԴՆԹ-ի բեկորների արագությամբ: Մյուս կողմից, այն կարող է գաղթել 20% դենատուրացնող պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզում՝ 25 հիմք օլիգոնուկլեոտիդով:
Քսիլեն ցիանոլի ջրածնային կապի դոնորների թիվը 2 մ է, իսկ ջրածնային կապի ընդունողների թիվը՝ 8։ Այս միացության պտտվող կապերի քանակը կարող է տրվել որպես 7։ Քսիլենցիանոլի բարդությունը կարելի է նկարագրել 1120 աստիճան։ Այն ունի որոշակի կապի ստերեոկենտրոնի քանակը 1.
Ի՞նչ է բրոմֆենոլ կապույտը:
Բրոմոֆենոլ կապույտը օգտակար pH ցուցանիշ է, որն օգտակար է որպես էլեկտրոֆորետիկ գունավոր մարկեր և ներկ: Այն ունի քիմիական անվանումը 3', 3", 5', 5"-tetrabromofenolsulfonphthalein, BPB: Այս միացության քիմիական բանաձևն է C19H10Br4O5 S. Այս միացության մոլային զանգվածը 669,96 գ/մոլ է։ Այն անհոտ է, և դրա խտությունը կարելի է տալ 2,2 գ/մլ: Նրա հալման ջերմաստիճանը 273 աստիճան է, իսկ եռմանը՝ 279 աստիճան Ցելսիուս։ Մենք կարող ենք այն պատրաստել՝ դանդաղորեն ավելացնելով ավելցուկ բրոմ սառցադաշտային քացախաթթվի ֆենոլսուլֆոնֆթալեինի տաք լուծույթին։
Բրոմֆենոլ կապույտը օգտակար է որպես թթու-բազային ցուցիչ pH 3,0-ից 4,6 միջակայքում: Այն կարող է դեղինից փոխվել pH 3.0-ի pH 4.6-ի դեպքում: Ընդ որում, դա շրջելի ռեակցիա է։ Կառուցվածքային առումով բրոմֆենոլ կապույտը նման է ֆենոլֆթալեինին։
Բացի այդ, մենք կարող ենք օգտագործել այն որպես գունային մարկեր ագարոզայի գելային էլեկտրոֆորեզի և պոլիակրիլամիդային գելային էլեկտրոֆորեզի գործընթացը վերահսկելու համար: Այս նյութը կարող է բացասական լիցք կրել միջին pH-ի դեպքում, որտեղ այն կարող է գաղթել նույն ուղղությամբ, ինչ ԴՆԹ-ն կամ գելում առկա սպիտակուցը: Միգրացիայի արագությունը կարող է տարբեր լինել՝ կախված գելի խտությունից և բուֆերային կազմից: Այնուամենայնիվ, տիպիկ 1% ագարոզայի գելում 1 անգամ TAE բուֆերում կամ TBE բուֆերում այս նյութը գաղթում է նույն արագությամբ, ինչ մոտ 300 բազային զույգ ունեցող ԴՆԹ-ի հատվածը:
Ի՞նչ տարբերություն կա քսիլեն ցիանոլի և բրոմֆենոլ կապույտի միջև:
Քսիլեն ցիանոլը և բրոմֆենոլ կապույտը կարևոր գունային մարկերներ են: Քսիլեն ցիանոլի և բրոմֆենոլ կապույտի հիմնական տարբերությունն այն է, որ 1% ագարոզայի գելում քսիլեն ցիանոլն ավելի դանդաղ է ներգաղթում, մինչդեռ բրոմֆենոլ կապույտն ավելի արագ է արտագաղթում:
Ստորև ներկայացված է քսիլեն ցիանոլի և բրոմֆենոլ կապույտի միջև եղած տարբերությունը աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue
Քսիլենային ցիանոլը և բրոմֆենոլ կապույտը կարևոր են որպես գունային մարկերներ, որոնք օգտագործվում են ագարոզայի գելի էլեկտրոֆորեզի և պոլիակրիլամիդային գելի էլեկտրոֆորեզի գործընթացի մոնիտորինգի համար: Քսիլեն ցիանոլի և բրոմֆենոլ կապույտի հիմնական տարբերությունն այն է, որ 1% ագարոզայի գելում քսիլեն ցիանոլն ավելի դանդաղ է ներգաղթում, մինչդեռ բրոմֆենոլ կապույտն ավելի արագ է արտագաղթում: