MLVA-ի և MLST-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ MLVA-ն օգտագործում է իրար հետ կրկնվող ԴՆԹ-ի պոլիմորֆիզմը՝ մանրէաբանական տեսակները բնութագրելու համար, մինչդեռ MLST-ն օգտագործում է բազմաթիվ տնային գեների ներքին բեկորների ԴՆԹ-ի պոլիմորֆիզմը՝ մանրէաբանական տեսակները բնութագրելու համար:
Մանրէաբանական տիպավորումը սովորաբար օգտագործվում է վարակի աղբյուրը և ուղիները որոշելու համար: Այն հաստատում կամ բացառում է բռնկումները: Մանրէաբանական տիպավորումը նաև հետևում է առողջապահության հետ կապված պաթոգենների խաչաձև փոխանցմանը և ճանաչում վիրուսային շտամները: Ավելին, մանրէաբանական տիպավորումը գնահատում է ախտածին մանրէաբանական տեսակների դեմ պայքարի միջոցառումների արդյունավետությունը:MLVA և MLST երկու մոլեկուլային կենսաբանական տեխնիկա են, որոնք օգտագործվում են մանրէների տիպավորման մեջ:
Ի՞նչ է MLVA?
Multiple loci VNTR վերլուծությունը (MLVA) մոլեկուլային կենսաբանական մեթոդ է, որն օգտագործում է իրար հաջորդող ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների պոլիմորֆիզմը՝ մանրէների տեսակները բնութագրելու համար: Սա մեթոդ է, որն օգտագործվում է որոշակի մանրէաբանական տեսակների գենետիկական վերլուծության համար:
ՄԼՎԱ-ի առաջին քայլի ընթացքում յուրաքանչյուր թիրախային VNTR տեղակայում ուժեղացվում է PCR-ի միջոցով՝ կողային շրջանին հատուկ պրայմերներով: Այնուհետև ստացված բեկորները չափերով բաժանվում են էլեկտրոֆորեզով մազանոթային սեկվենսերի վրա: Յուրաքանչյուր տեղանքի գենոտիպավորումը և յուրաքանչյուր նմուշից ստացված արդյունքները թույլ են տալիս բնութագրել միկրոօրգանիզմը, որի տեսակը հայտնի է: Այն նաև թույլ է տալիս նույնականացնել ենթատեսակները ալելային մուտքագրման և MLVA տվյալների բազաների հետ համեմատելու միջոցով:
Նկար 01. MLVA
Այս MLVA մեթոդն ավելի ընտրովի է, քան MLST մեթոդը: Ավելին, MLVA մեթոդը չի պահանջում ԴՆԹ-ի հաջորդականության քայլ: Այսպիսով, այն հնարավորություն է տալիս տարբերակել մոտ ենթատեսակները կամ կլոնալ տեսակները։
Ի՞նչ է MLST?
Multilocus sequence typing-ը (MLST) տեխնիկա է, որն օգտագործում է բազմաթիվ տնային գեների ներքին բեկորների ԴՆԹ-ի հաջորդականության պոլիմորֆիզմը՝ մանրէաբանական տեսակները բնութագրելու համար: MLST-ը գենետիկական անալիզի մեթոդ է բազմաթիվ տեղամասերի տիպավորման համար:
Գծապատկեր 02. MLST
Սա հաջորդականության տպագրման տեսակ է, որն օգտագործվում է որպես մանրէաբանական տեսակների տարբեր շտամներ տարբերելու համար հղման մեթոդ: Այս մեթոդը հիմնված է տնային տնտեսության գեների հաջորդականության վրա:Տնային տնտեսության գեները սովորաբար կոդավորում են մանրէաբանական նյութերի հիմնական սպիտակուցները, ինչպիսիք են բակտերիան: Տնային տնտեսության գեների այս հաջորդականությունները ժամանակի ընթացքում կայուն պոլիմորֆիզմ ներկայացնելու առանձնահատկություն ունեն: Հետևաբար, տնային տնտեսության գեների հաջորդականության տարբերությունները բավականաչափ բավարար են շտամները միմյանցից տարբերելու համար: Ավելին, MLST-ի առաջին սխեման, որը մշակվել է, Neisseria meningitidis-ն էր՝ մենինգոկոկային մենինգիտի և սեպտիկեմիայի հարուցիչը: Իր ներդրման օրվանից MLST-ն օգտագործվել է ոչ միայն մարդու պաթոգենների, այլև բույսերի հարուցիչների համար:
Որո՞նք են նմանությունները MLVA-ի և MLST-ի միջև:
- MLVA և MLST երկու մոլեկուլային կենսաբանական տեխնիկա են, որոնք օգտագործվում են մանրէների տիպավորման մեջ:
- Երկու տեխնիկան էլ կարող են օգտագործվել մանրէների ֆիլոգենետիկ վերլուծության համար:
- Երկու տեխնիկան էլ հիմնված է գենետիկ պոլիմորֆիզմի վրա։
- Դրանք կարող են օգտագործվել մարդու հիվանդությունների հայտնաբերման համար, որոնք առաջացնում են մանրէաբանական պաթոգեններ:
- Երկու տեխնիկան էլ պետք է իրականացվի հմուտ մոլեկուլային կենսաբանների կողմից:
Ո՞րն է տարբերությունը MLVA-ի և MLST-ի միջև:
MLVA-ն տեխնիկա է, որն օգտագործում է իրար հետ կրկնվող ԴՆԹ-ի հաջորդականության պոլիմորֆիզմը՝ մանրէների տեսակները բնութագրելու համար: Մինչդեռ, MLST-ը տեխնիկա է, որն օգտագործում է բազմաթիվ տնային գեների ներքին բեկորների ԴՆԹ-ի հաջորդականության պոլիմորֆիզմը՝ մանրէաբանական տեսակները բնութագրելու համար: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է MLVA-ի և MLST-ի միջև: Ավելին, MLVA մեթոդն ավելի ընտրովի է, քան MLST մեթոդը:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ներկայացնում է MLVA-ի և MLST-ի միջև եղած տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – MLVA vs MLST
MLVA և MLST երկու մոլեկուլային կենսաբանական տեխնիկա են, որոնք օգտագործվում են մանրէների տիպավորման մեջ: MLVA-ն օգտագործում է իրար հետ կրկնվող ԴՆԹ-ի հաջորդականության պոլիմորֆիզմը՝ մանրէաբանական տեսակները բնութագրելու համար, մինչդեռ MLST-ն օգտագործում է բազմաթիվ տնային գեների ներքին բեկորների ԴՆԹ-ի հաջորդականության պոլիմորֆիզմը՝ մանրէաբանական տեսակները բնութագրելու համար:Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է MLVA-ի և MLST-ի միջև:
