LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների հիմնական տարբերությունն այն է, որ LTR ռետրոտրանսպոզոնները ռետրոտրանսպոզոնների մի տեսակ են, որոնք ունեն երկար տերմինալ կրկնություններ իրենց կառուցվածքում, մինչդեռ ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները ռետրոտրանսպոզոնների մի տեսակ են, որոնք չունեն երկար տերմինալ կրկնություններ: իրենց կառուցվածքով։
Ռետրոտրանսպոզոնները (I դասի փոխադրվող տարրեր կամ տրանսպոզոններ ՌՆԹ-ի միջանկյալ նյութերի միջոցով) գենետիկ բաղադրիչի տեսակ է, որը կարող է պատճենել և տեղադրվել գենոմային տարբեր վայրերում: Նրանք դա անում են՝ ՌՆԹ-ն ետ վերածելով ԴՆԹ-ի՝ հակադարձ տրանսկրիպցիա կոչվող գործընթացի միջոցով՝ օգտագործելով ՌՆԹ-ի տրանսպոզիցիոն միջանկյալ նյութը:Գոյություն ունեն ռետրոտրանսպոզոնների երկու հիմնական տեսակ՝ LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոններ
Ի՞նչ են LTR ռետրոտրանսպոզոնները:
LTR ռետրոտրանսպոզոնները ռետրոտրանսպոզոնների տեսակ են, որոնք ունեն երկար տերմինալ կրկնություններ իրենց կառուցվածքում: Կրկնվող ԴՆԹ-ի երկար շղթաներ կարելի է գտնել LTR ռետրոտրանսպոզոնի յուրաքանչյուր ծայրում: Դրանք հայտնի են որպես երկար տերմինալ կրկնողություններ (LTR): Յուրաքանչյուր LTR ունի մի քանի հարյուր բազային զույգ երկարություն: LTR ռետրոտրանսպոզոնները սովորաբար ավելի քան 5 կիլոբազա երկարություն ունեն: Ավելին, երկար տերմինալների միջև կան գեներ, որոնք կարող են տառադարձվել ռետրովիրուսային գեների gag-ին և pol-ին համարժեք: Այս գեները համընկնում են այնպես, որ նրանք կոդավորում են պրոթեզերոն, որը սովորաբար վերամշակում է ստացված տառադարձումը ֆունկցիոնալ գենային արտադրանքի:
Նկար 01. LTR ռետրոտրանսպոզոններ
Retrotransposons-ի Gag գենը արտադրում է արտադրանք, որն ասոցացվում է այլ ռետրոտրանսպոզոնների տրանսկրիպտների հետ՝ ձևավորելով վիրուսանման մասնիկներ: Pol գենը արտադրում է արտադրանք, որոնք ներառում են ֆերմենտներ, ինչպիսիք են հակադարձ տրանսկրիպտազը, ինտեգրազը և ռիբոնուկլեազ H տիրույթները: Հակադարձ տրանսկրիպտազ ֆերմենտը կատարում է ռետրոտրանսպոզոնային ԴՆԹ-ի հակադարձ տրանսկրիպցիան։ Ինտեգրազ ֆերմենտը ռետրոտրանսպոզոնային ԴՆԹ-ն ինտեգրում է էուկարիոտական գենոմի ԴՆԹ-ին: Ռիբոնուկլեազ H տիրույթները օգտակար են ՌՆԹ-ի միջանկյալ նյութերի միջև ֆոսֆոդիստերային կապերը ճեղքելու համար: LTR ռետրոտրանսպոզոնները նաև կոդավորում են տառադարձումները tRNA կապող վայրերով, որպեսզի նրանք կարողանան բավականին հեշտությամբ ենթարկվել հակադարձ տրանսկրիպցիայի: Ավելին, քանի որ ռետրոտրանսպոզոնը պարունակում է էուկարիոտիկ գենոմի տեղեկատվություն, այն կարող է իր պատճենները տեղադրել էուկարիոտ բջջի գենոմային այլ վայրերում:
Ի՞նչ են ոչ-LTR ռետրոտրանսպոզոնները:
Ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները ռետրոտրանսպոզոնների տեսակ են, որոնք չունեն երկար տերմինալ կրկնություններ իրենց կառուցվածքում:LTR ռետրոտրանսպոզոնների նման, ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները նույնպես պարունակում են հակադարձ տրանսկրիպտազի, ՌՆԹ կապող սպիտակուցի, նուկլեազի և երբեմն էլ ռիբոնուկլեազ H տիրույթների գեներ։ Բայց նրանք չունեն երկար տերմինալային կրկնություններ. փոխարենը, նրանք ունեն կարճ կրկնություններ, որոնք կարող են ունենալ իրար կողքի հիմքերի շրջված կարգ: ՌՆԹ կապող սպիտակուցները կապվում են ՌՆԹ-ի տրանսպոզիցիոն միջանկյալ նյութին, իսկ նուկլեազները կոտրում են ֆոսֆոդիստերային կապերը նուկլեինաթթուների նուկլեոտիդների միջև։
Նկար 02. LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոններ
Չնայած դրանք ռետրոտրանսպոզոններ են, նրանք չեն կարող իրականացնել հակադարձ տրանսկրիպցիա՝ օգտագործելով ՌՆԹ միջանկյալ նյութը նույն կերպ, ինչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները: Դա պայմանավորված է նրանով, որ ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները չեն պարունակում հաջորդականություններ, որոնք կապում են tRNA-ն: Հետևաբար, ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնը, որը տառադարձվում է mRNA-ի և վերածվում սպիտակուցների, գործում է որպես հակադարձ տրանսկրիպտազ:Հակադարձ տրանսկրիպտազը ստեղծում է ոչ LTR ռետրոտրանսպոսոնի ՌՆԹ-ի ԴՆԹ-ի պատճենը, որը կարող է ինտեգրվել գենոմի մեջ նոր տեղամասում: Ավելին, ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները բաժանվում են երկու տեսակի՝ LINEs (երկար միջուկային միջուկային տարրեր) և SINE (կարճ միջուկային միջուկային տարրեր):
Որո՞նք են նմանությունները LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների միջև:
- LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները ռետրոտրանսպոզոնների երկու հիմնական տեսակներն են:
- Երկու տեսակներն էլ պարունակում են գեներ այնպիսի ֆերմենտների համար, ինչպիսիք են հակադարձ տրանսկրիպտազը, ՌՆԹ կապող սպիտակուցը, նուկլեազը և ռիբոնուկլեազ H տիրույթները:
- Դրանք կարելի է գտնել մարդու գենոմում:
- Երկու տեսակներն էլ կարևոր են էվոլյուցիոն տեսանկյունից:
Ո՞րն է տարբերությունը LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների միջև:
LTR ռետրոտրանսպոզոններն իրենց կառուցվածքում ունեն երկար տերմինալ կրկնողություններ, մինչդեռ ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոններին իրենց կառուցվածքում բացակայում են երկար տերմինալ կրկնությունները:Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների միջև: Ավելին, LTR ռետրոտրանսպոզոններն ունեն երկար ուղիղ կրկնություններ, որոնք իրենց կրկնվող հիմքերի ընդամենը մեկ հաջորդականություն են: Մյուս կողմից, ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոններն ունեն կարճ կրկնություններ, որոնք կարող են ունենալ իրար կողքի հիմքերի շրջված կարգ:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ներկայացնում է LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – LTR ընդդեմ ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների
LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները ռետրոտրանսպոզոնների երկու հիմնական տեսակներն են: LTR ռետրոտրանսպոզոնները իրենց կառուցվածքում ունեն երկար տերմինալ կրկնություններ, մինչդեռ ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնները չունեն երկար տերմինալ կրկնություններ իրենց կառուցվածքում։ Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է LTR և ոչ LTR ռետրոտրանսպոզոնների միջև:
