Մոտիվի և տիրույթի հիմնական տարբերությունն այն է, որ մոտիվը ինքնուրույն կայուն չէ, մինչդեռ տիրույթը անկախ կայուն է:
Սպիտակուցները կարևոր կենսաբանական մակրոմոլեկուլներ են, որոնք առկա են մեր մարմնում: Մյուս կողմից, գենի գենետիկ կոդը որոշելու է սպիտակուցի ամինաթթուների հաջորդականությունը: Ավելին, սպիտակուցներն ունեն առաջնային, երկրորդային և երրորդական կառուցվածքներ։ Առաջնային կառուցվածքը պոլիպեպտիդային շղթայի ամինաթթուների հաջորդականությունն է։ Երբ պոլիպեպտիդային շղթաները ծալվում են միմյանց հետ, այն կազմում է սպիտակուցի երկրորդական կառուցվածքը։ Երկրորդական կառույցներին են պատկանում ալֆա խխունջները, բետա թերթերը և գերերկրորդական կառուցվածքները։Սուպեր-երկրորդային տարրերի որոշակի խմբավորումներ հայտնի են որպես սպիտակուցային մոտիվներ: Սպիտակուցի երրորդական կառուցվածքը վերաբերում է նրա եռաչափ կառուցվածքին, որը որոշում է սպիտակուցի գործառույթը: Դոմենը սպիտակուցի մոլեկուլի ծալված հատված է, որը գնդաձեւ է և ունի դիսկրետ ֆունկցիա։ Դա սպիտակուցի հիմնարար ֆունկցիոնալ և եռաչափ կառուցվածքն է։
Ի՞նչ է մոտիվը?
Մոտիվը սպիտակուցների գերերկրորդային տարրերի որոշակի խմբավորում է, ինչպիսիք են ալֆա պարույրները և բետա կառուցվածքները: Դրանք մի տեսակ նախշեր են, որոնք առկա են տարբեր սպիտակուցներում: Մոտիվները նկարագրում են երկրորդական կառուցվածքային տարրերի ծալովի նախշերը և դրանց փոխազդեցությունները: Այս ծալովի նախշերը կայունանում են նմանատիպ կապերով, որոնք առկա են երրորդական կառույցներում: Այնուամենայնիվ, դրանք այնքան բարդ չեն, որքան երրորդական կառույցները:
Նկար 01. Մոտիվ
Սրանք սպիտակուցների երկրորդական կառուցվածքների պարզ համակցություններ են: Մոտիվն ինքնին կայուն չէ։ Ավելին, մոտիվները բացատրում են սպիտակուցի կառուցվածքը, բայց չեն կանխատեսում սպիտակուցի գործառույթը: Սպիտակուցի մոտիվների օրինակներ են բետա-ալֆա-բետա մոտիվը, հունական բանալի մոտիվը, բետա տակառը, բետա-մանդրի մոտիվը և այլն:
Ի՞նչ է տիրույթը:
Դոմենը սպիտակուցի հիմնարար, ֆունկցիոնալ և եռաչափ միավոր է: Այն կատարում է որոշակի գործառույթ. Մեկ սպիտակուցը կարող է ունենալ մի քանի տարբեր տիրույթներ: Յուրաքանչյուր տիրույթ անկախ միավոր է: Գնդաձեւ կառուցվածք է։ Այն պատասխանատու է որոշակի գործառույթի կամ փոխազդեցության համար: Դոմենները կարող են օգտագործվել չբնութագրված սպիտակուցի գործառույթը ենթադրելու համար: Սպիտակուցը վերլուծելիս անհրաժեշտ է հաշվի առնել, քանի որ տիրույթները սպիտակուցի ֆունկցիոնալ միավորներն են:
Նկար 02. Պիրուվատ կինազայի երեք տարբեր տիրույթներ
Դոմենները շատ կայուն և կոմպակտ կառուցվածքներ են: Դրանք հեշտությամբ կարելի է տարբերել այլ շրջաններից։ Պիրուվատ կինազը ունի երեք տարբերակիչ տիրույթ, ինչպես ցույց է տրված նկար 02-ում: Դոմենի երկարությունը կարող է տարբեր լինել, և միջին երկարությունը կազմում է 100 ամինաթթու: Յուրաքանչյուր տիրույթ պարունակում է հիդրոֆոբ միջուկ, որը կառուցված է երկրորդական կառուցվածքային միավորներից: Մի քանի տիրույթներ միասին կազմում են սպիտակուցի երրորդական կառուցվածքը:
Որո՞նք են նմանությունները մոտիվների և տիրույթի միջև:
- Մոտիվը և դոմենը սպիտակուցի մոլեկուլներում առկա միավորներ են:
- Օգտակար են սպիտակուցային ընտանիքները դասակարգելիս:
Ո՞րն է տարբերությունը մոտիվի և տիրույթի միջև:
Մոտիվը սպիտակուցների գերերկրորդային տարրերի որոշակի խմբավորում է, ինչպիսիք են ալֆա պարույրները և բետա կառուցվածքները, մինչդեռ դոմենը սպիտակուցի ֆունկցիոնալ միավորն է:Ավելին, մոտիվը երկրորդական կառույց է, մինչդեռ տիրույթը պատասխանատու է սպիտակուցի երրորդական կառուցվածքի համար: Ավելին, տիրույթը անկախ միավոր է, ի տարբերություն մոտիվի։ Նաև տիրույթը պատկերում է սպիտակուցի գործառույթը, մինչդեռ մոտիվը՝ ոչ: Սրանք հիմնական տարբերություններն են մոտիվների և տիրույթի միջև: Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ներկայացնում է մոտիվների և տիրույթի միջև տարբերությունը աղյուսակային տեսքով:
Ամփոփում – Motif vs Domain
Մոտիվը սպիտակուցի մոլեկուլի երկրորդական կառուցվածքների դասավորությունն է։ Այն սովորաբար ինքնին կայուն չէ, ի տարբերություն տիրույթի։ Դոմենը սպիտակուցի ինքնուրույն կայուն կառուցվածք է: Հետեւաբար, այն կարող է լինել սպիտակուցի մի մաս կամ ամբողջական մոլեկուլ: Այն սպիտակուցի եռաչափ հիմնարար ֆունկցիոնալ միավոր է: Ավելին, այն ունի գործառույթ, և դա ինքնուրույն միավոր է։Մոտիվը կարող է լինել տիրույթի մի մասը։ Բայց տիրույթը չի կարող լինել մոտիվի մաս: Սա է տարբերությունը մոտիվների և տիրույթի միջև:
