Սպիտակուցի ենթամիավորի և տիրույթի հիմնական տարբերությունն այն է, որ սպիտակուցային ենթամիավորը սպիտակուցի առանձին պոլիպեպտիդ շղթա է, որը հավաքվում է այլ պոլիպեպտիդային շղթաների հետ՝ ձևավորելով սպիտակուցային համալիր, մինչդեռ սպիտակուցային տիրույթը պոլիպեպտիդային շղթայի հարակից շրջանն է։ սպիտակուց, որը հաճախ ինքնուրույն ծալվում է կոմպակտ, տեղային և կիսանկախ միավորի մեջ։
Սպիտակուցային ենթամիավորը և դոմենը մուլտիմերային սպիտակուցի շատ կարևոր մասեր են: Սպիտակուցները պոլիպեպտիդներից պատրաստված պոլիմերներ են: Յուրաքանչյուր պոլիպեպտիդ շղթա ձևավորվում է մոնոմերից, որը հայտնի է որպես ամինաթթու: Բարդ սպիտակուցը պարունակում է հստակ կառուցվածքային միավորներ, ինչպիսիք են ենթամիավորները, տիրույթները, մոտիվը և ծալքը:Բարդ սպիտակուցի այս կառուցվածքային միավորները չափազանց կարևոր են նրա կառուցվածքի և, ի վերջո, ֆունկցիայի համար:
Ի՞նչ է սպիտակուցային ենթամիավորը:
Սպիտակուցային ենթամիավորը սպիտակուցի առանձին պոլիպեպտիդ շղթա է, որը հավաքվում է այլ պոլիպեպտիդային շղթաների հետ՝ ձևավորելով սպիտակուցային համալիր: Կառուցվածքային կենսաբանության մեջ սպիտակուցի ենթամիավորը սպիտակուցի մեկ մոլեկուլ է, որը համախմբվում է այլ սպիտակուցային մոլեկուլների հետ՝ ձևավորելով սպիտակուցային համալիր։ Բնականաբար առաջացող սպիտակուցներն ունեն համեմատաբար փոքր թվով ենթամիավորներ, ինչպիսիք են հեմոգլոբինը և ԴՆԹ պոլիմերազը: Հետեւաբար, դրանք կոչվում են օլիգոմերային: Մյուս սպիտակուցները բաղկացած են մեծ թվով ենթամիավորներից, ուստի դրանք բնութագրվում են որպես մուլտիմերիկ։ Օրինակ, միկրոխողովակները և ցիտոկմախքի այլ սպիտակուցները մուլտիմերիկ են: Մուլտիմերային սպիտակուցի ենթամիավորները կարող են լինել նույնական (հոմոլոգ) կամ բացարձակապես տարբեր (հետերոլոգ):
Նկար 01. Սպիտակուցի ենթամիավոր
Որոշ մուլտիմերային սպիտակուցներում մեկ ենթամիավորը կարող է լինել կատալիտիկ ենթամիավոր: Մյուս կողմից, մյուսը կարգավորող ստորաբաժանում է։ Կատալիտիկ ենթամիավորի գործառույթը կատալիզացնում է ֆերմենտային ռեակցիան, մինչդեռ կարգավորող ենթամիավորի գործառույթը հեշտացնում կամ արգելակում է նրա գործունեությունը: Ֆերմենտը, որը կազմված է և՛ կատալիտիկ, և՛ կարգավորող ենթամիավորներից, երբ հավաքվում է, սովորաբար կոչվում է հոլոֆերմենտ: Օրինակ՝ I դասի ֆոսֆոինոզիտիդ 3-կինազի ֆերմենտը ունի p110 կատալիտիկ ենթամիավոր և p85 կարգավորող ենթամիավոր: Ավելին, յուրաքանչյուր ենթամիավորի համար սպիտակուցը պետք է ունենա մեկ գեն։ Դա պայմանավորված է նրանով, որ ենթամիավորը կազմված է առանձին պոլիպեպտիդային շղթայից, որն ունի մեկ կոդավորող գեն:
Ի՞նչ է սպիտակուցային տիրույթը:
Սպիտակուցային տիրույթը սպիտակուցի պոլիպեպտիդային շղթայի հարակից շրջանն է, որը հաճախ ինքնուրույն ծալվում է կոմպակտ, տեղային և կիսաանկախ միավորների:Սպիտակուցի տիրույթը հայտնի է նաև որպես սպիտակուցի պոլիպեպտիդային շղթայի տարածք, որն ինքնակայուն է և ծալվում է մնացածից անկախ: Նրանք սպիտակուցի մեջ հստակ կառուցվածքային և ֆունկցիոնալ միավոր են: Սովորաբար, տիրույթները պատասխանատու են որոշակի ֆունկցիայի կամ փոխազդեցության համար, որը նպաստում է սպիտակուցի ընդհանուր դերին: Օրինակ, SH3 տիրույթը մոտ 50 ամինաթթուների մնացորդներ է: Դրանք հանդիպում են սպիտակուցների տարբեր տեսականիում՝ ներառյալ ադապտերային սպիտակուցները, ֆոֆատիդիլինոզիտոլ3-կինազները, ֆոսֆոլիպազները և միոզինները: Այս SH3 տիրույթները ներգրավված են սպիտակուցի և սպիտակուցի փոխազդեցության մեջ:
Նկար 02. Սպիտակուցային տիրույթներ
Դոմենների երկարությունը տատանվում է 50 ամինաթթուից մինչև 250 ամինաթթու: Ամենակարճ տիրույթները, ինչպիսիք են ցինկի մատը, կայունացվում են մետաղական իոնների և դիսուլֆիդային կամուրջների միջոցով:Դոմենը հաճախ արտադրում է ֆունկցիոնալ միավորներ, ինչպիսին է կալմոդուլինի կալցիումին կապող EF ձեռքի տիրույթը: Ավելին, տիրույթները կարող են փոխանակվել գենետիկական ինժեներիայի միջոցով մեկ սպիտակուցի միջև մյուսը` քիմերային սպիտակուցներ ստանալու համար:
Որո՞նք են նմանությունները սպիտակուցային ենթամիավորի և տիրույթի միջև:
- Սպիտակուցային ենթամիավորը և տիրույթը մուլտիմերային սպիտակուցի կառուցվածքային միավորներ են:
- Երկուսն էլ կազմված են ամինաթթուներից։
- Դրանք կապված են «պոլիպեպտիդային շղթա» տերմինի հետ:
- Ավելին, նրանք երկուսն էլ չափազանց կարևոր են սպիտակուցի ընդհանուր գործառույթի համար:
Ո՞րն է տարբերությունը սպիտակուցային ենթամիավորի և տիրույթի միջև:
Սպիտակուցային ենթամիավորը սպիտակուցի առանձին պոլիպեպտիդ շղթա է, որը հավաքվում է այլ պոլիպեպտիդային շղթաների հետ՝ ձևավորելով սպիտակուցային համալիր: Մյուս կողմից, սպիտակուցային տիրույթը սպիտակուցի պոլիպեպտիդային շղթայի հարակից շրջանն է, որը հաճախ ինքնուրույն ծալվում է կոմպակտ, տեղային և կիսաանկախ միավորների:Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է սպիտակուցային ենթամիավորի և տիրույթի միջև: Ավելին, սպիտակուցային ենթամիավորը չափերով ավելի մեծ է, քան սպիտակուցային տիրույթը:
Հետևյալ աղյուսակը ամփոփում է սպիտակուցի ենթամիավորի և տիրույթի տարբերությունը աղյուսակային տեսքով:
Ամփոփում – Սպիտակուցի ենթամիավոր ընդդեմ տիրույթի
Սպիտակուցների շինանյութերը ամինաթթուներն են: Սպիտակուցները ձևավորվում են ամինաթթուների խտացումից: Սպիտակուցի կառուցվածքները տատանվում են տասնյակից մինչև մի քանի հազար ամինաթթուների չափերով: Սպիտակուցի կառուցվածքը կայունանում է ոչ կովալենտային փոխազդեցությամբ, ինչպիսիք են ջրածնային կապերը, իոնային կապերը, Վան դեր Վալսի ուժերը, հիդրոֆոբ կապերը և կովալենտային փոխազդեցությունները, ինչպիսիք են դիսուլֆիդային կապերը: Բարդ սպիտակուցը պարունակում է հստակ կառուցվածքային միավորներ, ինչպիսիք են ենթամիավորները, տիրույթները, մոտիվը և ծալքը: Սպիտակուցի ենթամիավորը սպիտակուցի առանձին պոլիպեպտիդ շղթա է, որը հավաքվում է այլ պոլիպեպտիդային շղթաների հետ՝ ձևավորելով սպիտակուցային համալիր։ Մյուս կողմից, սպիտակուցային տիրույթը սպիտակուցի պոլիպեպտիդային շղթայի մի շրջան է, որն ինքնակայուն է և ծալվում է մնացածից անկախ:Այսպիսով, սա սպիտակուցային ենթամիավորի և տիրույթի միջև եղած տարբերության ամփոփումն է։
