Հիմնական տարբերություն – Alpha Helix ընդդեմ բետա ծալքավոր թերթ
Ալֆա պարույրները և բետա ծալքավոր թիթեղները պոլիպեպտիդային շղթայում ամենատարածված երկու երկրորդական կառուցվածքներն են: Այս երկու կառուցվածքային բաղադրիչները պոլիպեպտիդային շղթայի ծալման գործընթացի առաջին հիմնական քայլերն են: Alpha Helix-ի և Beta Pleated Sheet-ի հիմնական տարբերությունը դրանց կառուցվածքում է. նրանք ունեն երկու տարբեր ձևեր՝ կոնկրետ աշխատանք կատարելու համար։
Ինչ է Alpha Helix?
Ալֆա պարույրը ամինաթթուների մնացորդների աջակողմյան կծիկ է պոլիպեպտիդային շղթայի վրա: Ամինաթթուների մնացորդների շրջանակը կարող է տատանվել 4-ից 40 մնացորդ:Վերևի կծիկի C=O խմբի թթվածնի և ստորին կծիկի N-H խմբի ջրածնի միջև առաջացած ջրածնային կապերն օգնում են կծիկը միասին պահել։ Վերոնշյալ եղանակով շղթայում յուրաքանչյուր չորս ամինաթթվի մնացորդի վրա ձևավորվում է ջրածնային կապ: Այս միատեսակ նախշը տալիս է նրան որոշակի առանձնահատկություններ, ինչպիսիք են կծիկի հաստությունը և թելադրում է յուրաքանչյուր ամբողջական պտույտի երկարությունը պարույրի առանցքի երկայնքով: Ալֆա պարույրի կառուցվածքի կայունությունը կախված է մի քանի գործոններից:
Օ ատոմները կարմիր, N ատոմները կապույտ, և ջրածնային կապերը՝ որպես կանաչ կետագծեր
Ի՞նչ է բետա ծալքավոր թերթիկը:
Բետա ծալքավոր թերթիկը, որը նաև հայտնի է որպես բետա թերթ, համարվում է որպես սպիտակուցների երկրորդական կառուցվածքի երկրորդ ձև: Այն պարունակում է բետա թելեր, որոնք կողային միացված են առնվազն երկու կամ երեք ողնաշարային ջրածնային կապերով՝ ձևավորելով ոլորված, ծալքավոր թիթեղ, ինչպես ցույց է տրված նկարում:Բետա շղթան պոլիպեպտիդային շղթայի մի հատված է. դրա երկարությունը ընդհանուր առմամբ հավասար է 3-ից 10 ամինաթթուների, ներառյալ ողնաշարը ընդլայնված հաստատման մեջ:
4-շղթա հակազուգահեռ β թերթի հատված կատալազի ֆերմենտի բյուրեղային կառուցվածքից:
ա) ցույց է տալիս հակազուգահեռ ջրածնային կապերը (կետավոր) պեպտիդային NH և CO խմբերի միջև հարակից շղթաների վրա: Սլաքները ցույց են տալիս շղթայի ուղղությունը, իսկ էլեկտրոնային խտության ուրվագծերը ուրվագծում են ոչ H ատոմները: O ատոմները կարմիր գնդիկներ են, N ատոմները կապույտ են, իսկ H ատոմները բաց են թողնվել պարզության համար. կողային շղթաները ցուցադրվում են միայն առաջին կողային շղթայի C ատոմին (կանաչ)
բ) կենտրոնական երկու β թելերի եզրային տեսք
Բետա ծալքավոր թիթեղներում պոլիպեպտիդային շղթաներն անցնում են միմյանց կողքով:Այն ստացել է «ծալքավոր թերթ» անվանումը՝ կառուցվածքի ալիքային տեսքի պատճառով։ Նրանք միմյանց կապված են ջրածնային կապերով։ Այս կառուցվածքը թույլ է տալիս ձևավորել ավելի շատ ջրածնային կապեր՝ ձգելով պոլիպեպտիդային շղթան:
Ո՞րն է տարբերությունը Alpha Helix-ի և Beta Pleated Sheet-ի միջև:
Ալֆա խխունջի և բետա ծալքավոր թերթիկի կառուցվածքը
Alpha Helix:
Այս կառուցվածքում պոլիպեպտիդային ողնաշարը սերտորեն կապված է երևակայական առանցքի շուրջ՝ որպես պարուրաձև կառուցվածք: Այն նաև հայտնի է որպես պեպտիդային շղթայի ուղղաձիգ դասավորություն։
Ալֆա պարույրի կառուցվածքի ձևավորումը տեղի է ունենում, երբ պոլիպեպտիդային շղթաները ոլորվում են պարույրի մեջ: Սա հնարավորություն է տալիս շղթայի բոլոր ամինաթթուներին միմյանց հետ ձևավորել ջրածնային կապեր (կապ թթվածնի մոլեկուլի և ջրածնի մոլեկուլի միջև): Ջրածնային կապերը թույլ են տալիս խխունջին պահել պարուրաձև ձևը և տալիս է ամուր կծիկ: Այս պարուրաձև ձևը ալֆա խխունջը շատ ուժեղ է դարձնում:
Ջրածնային կապերը նշվում են դեղին կետերով:
Բետա ծալքավոր թերթ՝
Երբ պոլիպեպտիդային շղթայի (շղթաների) երկու կամ ավելի բեկորներ համընկնում են միմյանց հետ՝ միմյանց հետ ստեղծելով ջրածնային կապերի շարք, կարելի է գտնել հետևյալ կառուցվածքները. Դա կարող է տեղի ունենալ երկու եղանակով. զուգահեռ դասավորություն և հակազուգահեռ դասավորություն։
Կառուցվածքի օրինակներ
Ալֆա խխունջ. եղունգները կամ ոտքերի եղունգները կարելի է վերցնել որպես ալֆա խխունջի կառուցվածքի օրինակ:
Բետա ծալքավոր թերթ. փետուրների կառուցվածքը նման է բետա ծալքավոր թերթիկի կառուցվածքին:
Կառուցվածքի առանձնահատկությունները՝
Ալֆա պարույր. Ալֆա պարույրի կառուցվածքում կա 3,6 ամինաթթու յուրաքանչյուր պտույտի մեջ:Բոլոր պեպտիդային կապերը տրանս և հարթ են, իսկ պեպտիդային կապերի N-H խմբերը ուղղված են նույն ուղղությամբ, որը մոտավորապես զուգահեռ է պարույրի առանցքին։ Բոլոր պեպտիդային կապերի C=O խմբերը ուղղված են հակառակ ուղղությամբ, և դրանք զուգահեռ են պարույրի առանցքին։ Յուրաքանչյուր պեպտիդային կապի C=O խումբը կապված է պեպտիդային կապի N-H խմբի հետ՝ առաջացնելով ջրածնային կապ։ Բոլոր R- խմբերը ուղղված են դեպի դուրս՝ պարույրից:
Բետա ծալքավոր թերթ. Բետա ծալքավոր թերթիկի յուրաքանչյուր պեպտիդային կապ հարթ է և ունի տրանս-կոնֆորմացիա: Հարակից շղթաներից պեպտիդային կապերի C=O և N-H խմբերը գտնվում են նույն հարթության վրա և ուղղվում են միմյանց՝ ստեղծելով ջրածնային կապ նրանց միջև: Ցանկացած շղթայի բոլոր R- խմբերը կարող են հայտնվել թերթի հարթության վերևում և ներքևում:
Սահմանումներ.
Երկրորդական կառուցվածք. այն ծալովի սպիտակուցի ձև է, որը պայմանավորված է նրա ողնաշարի ամիդային և կարբոնիլ խմբերի միջև ջրածնային կապով:
