ՌՆԹ պոլիմերազի միջուկի և հոլոֆերմենտի հիմնական տարբերությունն այն է, որ ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը ֆերմենտ է, որը չունի սիգմա գործոն, մինչդեռ ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոեզիմը ֆերմենտ է, որը բաղկացած է սիգմա գործոնից:
Բակտերիաներում տրանսկրիպցիան գործընթաց է, որտեղ բակտերիալ ԴՆԹ-ի մի հատվածը պատճենվում է նոր սինթեզված mRNA շղթայի մեջ՝ օգտագործելով ՌՆԹ պոլիմերազ ֆերմենտը: Այս գործընթացը տեղի է ունենում երեք հիմնական փուլերով՝ մեկնարկ, երկարացում և ավարտ: Բակտերիալ ՌՆԹ պոլիմերազը կազմված է 6 ենթամիավորներից։ ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը բաղկացած է β, β′, α2 և ω ենթամիավորներից: Այս ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը վերածվում է հոլոֆերմենտի, երբ σ (sigma) գործոնը կապված է միջուկի ֆերմենտի հետ:ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը և հոլոեզիմը բակտերիալ ՌՆԹ պոլիմերազային ֆերմենտի երկու ձև են:
Ի՞նչ է ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը:
ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը ֆերմենտ է, որը մասնակցում է բակտերիաների տրանսկրիպցիային, որը զերծ է սիգմա գործոնից: Այն բաղկացած է 5 ենթամիավորներից, որոնք նշանակված են որպես β, β′, α2 և ω: Այս ֆերմենտը բակտերիաների և ֆագային ԴՆԹ խթանողներից հատուկ տրանսկրիպցիա չի նախաձեռնում: Դա պայմանավորված է նրանով, որ այն չի ճանաչում որևէ կոնկրետ բակտերիաների կամ ֆագային ԴՆԹ խթանողներ: Այնուամենայնիվ, այս ֆերմենտը պահպանում է ՌՆԹ-ն արտագրելու ունակությունը ոչ հատուկ մեկնարկային հաջորդականություններից: Ավելին, այս ֆերմենտին սիգմա գործոնի ավելացումը թույլ է տալիս ֆերմենտին սկսել ՌՆԹ-ի սինթեզը հատուկ բակտերիաների և ֆագերի խթանողներից: ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկային ֆերմենտի մոլեկուլային քաշը մոտավորապես 400 կԴա է։
Նկար 01. ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկ
Հիմնական ֆերմենտը պարունակում է ՌՆԹ պոլիմերազի կատալիտիկ հատկություններ: α ենթամիավորը հոմոդիմեր է, որն ունի 36,5 կԴա չափ։ Այն կոդավորված է rpoA գենով: Այս ենթամիավորի գործառույթներն են՝ RNAP-ի հավաքումը, փոխազդեցությունը ԴՆԹ-ի հետ և տրանսկրիպցիոն կարգավորման գործոնները։ Β ենթամիավորը ունի 150,4 կԴա չափ։ Այն կոդավորված է rpoB գենով: Այս ենթամիավորի գործառույթներն են ԴՆԹ-ի և ՌՆԹ-ի միացումը, ՌՆԹ-ի սինթեզը, NTP-ի կապը, RMP-ի միացման վայրը և σ գործոնի կապը: β' ենթամիավորը ունի 155 կԴա չափ, և այն կոդավորված է rpoC գենով: Այս ենթամիավորի գործառույթներն են՝ ԴՆԹ-ի միացումը, ՌՆԹ-ի սինթեզը, կատալիտիկ Mg2+ համակարգումը, ppGpp կապող տեղամաս 1 և σ գործոնի կապը: Ավելին, ω գործոնը ունի 10,2 կԴա չափ և կոդավորված է rpoZ գենով: ω գործոնի ֆունկցիան RNAP ծալվող և ppGpp կապող տեղամաս 1 է։
Ի՞նչ է ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտը:
ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտը կազմված է հատուկ բաղադրիչից, որը հայտնի է որպես սիգմա գործոն, բացի β, β', α2 և ω ենթամիավորներից:Սիգմա գործոնի պատճառով ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոէնզիմը կարող է ճանաչել խթանողներին: Սիգմա գործոնը նաև օգնում է ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտի ճիշտ տեղադրմանը և սկզբնական վայրում արձակելուն: Երբ սիգմա գործոնը կատարում է իր պահանջվող և հատուկ գործառույթը, այն անջատվում է ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտից, մինչդեռ ՌՆԹ պոլիմերազի կատալիտիկ մասը (β, β', α2 և ω) մնում է ԴՆԹ-ում և շարունակում է տրանսկրիպցիան::
Նկար 02. ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտ
Սիգմա գործոնների թիվը տատանվում է բակտերիաների տեսակների միջև: E. coli-ն ունի յոթ սիգմա գործոն: Ավելին, սիգմա գործոններն առանձնանում են իրենց բնորոշ մոլեկուլային կշիռներով։ Օրինակ, σ70-ը 70 կԴա մոլեկուլային քաշով սիգմա գործոնն է:Տարբեր սիգմա գործոններ օգտագործվում են բակտերիաների կողմից շրջակա միջավայրի տարբեր պայմաններում: Տարբեր σ գործոնների օրինակներ ներառում են. σ19, σ24, σ18, ս32, σ38 և ս54
Որո՞նք են նմանությունները ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկի և հոլոֆերմենտի միջև:
- ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը և հոլոֆերմենտը բակտերիալ ՌՆԹ պոլիմերազային ֆերմենտի երկու ձև են:
- Երկու ձևերն էլ մասնակցում են բակտերիաների տրանսկրիպցիային:
- Նրանք ունեն ենթամիավորներ։
- Սրանք սպիտակուցային մոլեկուլներ են՝ կազմված ամինաթթուներից։
Ո՞րն է տարբերությունը ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկի և հոլոֆերմենտի միջև:
ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը ֆերմենտ է, որը չունի սիգմա գործոն, մինչդեռ ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոենզիմը ֆերմենտ է, որը բաղկացած է սիգմա գործոնից: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է ՌՆԹ պոլիմերազի միջուկի և հոլոենզիմի միջև: Ավելին, ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը հիմնականում մասնակցում է տրանսկրիպցիայի երկարացման քայլին, մինչդեռ ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտը հիմնականում կատալիզացնում է տրանսկրիպցիայի մեկնարկային փուլում:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ներկայացնում է տարբերությունները ՌՆԹ պոլիմերազի միջուկի և հոլոֆերմենտի միջև աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկ ընդդեմ հոլոենզիմի
Բակտերիալ ՌՆԹ պոլիմերազը ԴՆԹ-ից կախված ֆերմենտ է, որը բաղկացած է բազմաբնույթ ստորաբաժանումներից: Այն մասնակցում է բակտերիաների տրանսկրիպցիային։ Այն գեների արտահայտման հիմնական ֆերմենտն է և կարգավորման թիրախ: ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը և հոլոեզիմը բակտերիալ ՌՆԹ պոլիմերազային ֆերմենտի երկու ձև են: ՌՆԹ պոլիմերազային միջուկը չունի սիգմա գործոն, մինչդեռ ՌՆԹ պոլիմերազային հոլոֆերմենտը բաղկացած է սիգմա գործոնից։ Այսպիսով, սա ամփոփում է տարբերությունը ՌՆԹ պոլիմերազի միջուկի և հոլոֆերմենտի միջև:
