Կցիչի և ադապտորի հիմնական տարբերությունն այն է, որ կապակցիչը չունի համակցված ծայրեր, մինչդեռ ադապտերն ունի մեկ համակցված ծայր:
ԴՆԹ-ի կապակցումը ԴՆԹ-ի երկու մոլեկուլների միացման գործընթացն է՝ ձևավորելով ֆոսֆոդիստերային կապեր։ ԴՆԹ լիգազ կոչվող ֆերմենտը կատալիզացնում է այս ռեակցիան։ Դա կարևոր քայլերից մեկն է ժամանակակից մոլեկուլային կենսաբանական ոլորտներում, ինչպիսիք են ռեկոմբինանտ ԴՆԹ տեխնոլոգիան և ԴՆԹ կլոնավորումը: Կապակցման արդյունավետությունը կախված է կապվելիք ԴՆԹ-ի մոլեկուլների ծայրերից: Կան երկու տեսակի ԴՆԹ ծայրեր՝ կպչուն և բութ ծայրեր: Կապակցման արդյունավետությունը բարձր է կպչուն ծայրերով, քան բութ ծայրերով: Եթե թիրախ ԴՆԹ-ի մոլեկուլներն ունեն բութ ծայրեր, ապա օգտակար կլինեն մոլեկուլները, որոնք կոչվում են ադապտերներ կամ կապողներ:Ադապտերները և կապակցիչները քիմիապես սինթեզված օլիգոնուկլեոտիդային մոլեկուլներ են, որոնք օգնում են ԴՆԹ-ի կապակցմանը: Նրանք ունեն նաև ներքին սահմանափակման վայրեր: Ադապտորն ունի մեկ կպչուն ծայր և մեկ բութ ծայր, մինչդեռ կապողն ունի երկու բութ ծայր:
Ի՞նչ է Linker-ը:
Լինկերը քիմիապես սինթեզված օլիգոնուկլեոտիդային հաջորդականություն է, որը կրկնակի շղթա է: Linker-ն ունի երկու բութ ծայր: Linker-ն օգտագործվում է ԴՆԹ-ի մոլեկուլները միացնելու համար, որոնք ունեն բութ ծայրեր դեպի վեկտորները: Այն պարունակում է մեկ կամ մի քանի ներքին սահմանափակման կայքեր: Այս սահմանափակման կայքերն աշխատում են որպես սահմանափակող ֆերմենտների ճանաչման վայրեր:
Նկար 01. կապող
Կապակցումից հետո ԴՆԹ-ն կրկին սահմանափակվում է սահմանափակող ֆերմենտներով՝ միաձուլվող ծայրեր առաջացնելու համար: EcoRI-կապակցիչները և sal-I կապակցիչները սովորաբար օգտագործվում են կապողներ:
Ի՞նչ է ադապտորը:
Ադապտերը երկշղթա օլիգոնուկլեոտիդային հաջորդականություն է, որն օգտագործվում է ԴՆԹ-ի երկու մոլեկուլները միմյանց կապելու համար: Այն կարճ հաջորդականություն է՝ մեկ բութ ծայրով և մեկ կպչուն կամ համակցված ծայրով։ Հետևաբար, այն բաղկացած է մի ծայրով միաշղթա պոչից, որը բարձրացնում է ԴՆԹ-ի կապակցման արդյունավետությունը։
Նկար 02. ԴՆԹ-ի կապում ադապտորի միջոցով
Ավելին, ադապտերն ունի ներքին սահմանափակման կայքեր: Հետևաբար, կապակցումից հետո ԴՆԹ-ն կարող է սահմանափակվել համապատասխան սահմանափակող ֆերմենտներով՝ նոր դուրս ցցված վերջնամաս ստեղծելու համար: Ադապտերների մեկ թերությունն այն է, որ երկու ադապտերները կարող են ձևավորել մթնեցնող սարքեր՝ հիմքը զուգակցելով իրենց հետ: Սրանից կարելի է խուսափել՝ բուժելով դրանք ալկալային ֆոսֆատազ կոչվող ֆերմենտի միջոցով:
Որո՞նք են նմանությունները Linker-ի և Adaptor-ի միջև:
- Եվ կապողն ու ադապտերը երկշղթա կարճ օլիգոնուկլեոտիդային հաջորդականություններ են:
- Նրանք ունեն ներքին սահմանափակումների կայքեր։
- Ավելին, դրանք քիմիական սինթեզված ԴՆԹ մոլեկուլներ են և սինթետիկ մոլեկուլներ են։
- Նրանք կարող են կապել ԴՆԹ-ի երկու մոլեկուլներ։
- Կապակցիչների և ադապտատորների կապակցումից հետո ԴՆԹ-ն կրկին սահմանափակվում է սահմանափակող ֆերմենտներով՝ կպչուն ծայրեր առաջացնելու համար:
Ո՞րն է տարբերությունը Linker-ի և Adaptor-ի միջև:
Ա միացնողը քիմիապես սինթեզված կարճ օլիգոնուկլեոտիդային դուպլեքս է՝ երկու բութ ծայրերով: Ադապտերը քիմիապես սինթեզված կարճ օլիգոնուկլեոտիդային դուպլեքս է՝ մեկ կպչուն ծայրով և մեկ բութ ծայրով: Այսպիսով, սա կապող և ադապտորի հիմնական տարբերությունն է: Ավելին, ադապտերները կարող են ձևավորել դիմերներ, մինչդեռ կապիչները չեն ձևավորում դիմերներ: Այսպիսով, սա ևս մեկ էական տարբերություն է կապող և ադապտորի միջև:
Ստորև ներկայացված է կապող և ադապտեր տարբերությունների ամփոփում աղյուսակային տեսքով:
Ամփոփում – Linker vs Adaptor
Լինկերը և ադապտերը քիմիապես սինթեզված օլիգոնուկլեոտիդների երկու տեսակ են, որոնք օգտակար են բութ ծայրամասային ԴՆԹ-ի կապակցման համար: Linker-ն ունի երկու բութ ծայր, մինչդեռ ադապտերն ունի մեկ բութ և մեկ համակցված ծայր: Այսպիսով, սա կապող և ադապտորի հիմնական տարբերությունն է: Դրանք երկկողմանի մոլեկուլներ են, որոնք ունեն ներքին սահմանափակման վայրեր: Դրանք լայնորեն օգտագործվում են ռեկոմբինանտ ԴՆԹ տեխնոլոգիայի և ԴՆԹ կլոնավորման մեջ։