Մոլեկուլային դոկինգի և գնահատման հիմնական տարբերությունն այն է, որ կցումը երկու մոլեկուլների միջև կապակցման կապը որոշելու համար օգտագործվող տեխնիկան է, մինչդեռ գնահատումը որոշակի դիրքի գնահատման գործընթաց է՝ հաշվելով բարենպաստ միջմոլեկուլային փոխազդեցությունների քանակը:
Մոլեկուլային կցում և միավորում տերմիններն օգտագործվում են մոլեկուլային մոդելավորման ոլորտում։ Մոլեկուլային մոդելավորումը տեխնիկա է, որն օգտագործվում է տվյալ նյութում տարբեր մոլեկուլների հնարավոր դասավորությունները որոշելու համար։ Այս տեխնիկան կարևոր է նոր կայուն միացություններ ստեղծելու համար:
Ի՞նչ է մոլեկուլյար դոկինգը:
Մոլեկուլային դոկինգը թեկնածու լիգանդի ընկալիչին միանալու հաշվողական մոդելավորում է:Այս մեթոդը կանխատեսում է մեկ մոլեկուլի նախընտրելի կողմնորոշումը մյուս մոլեկուլին, երբ կապված են միմյանց հետ՝ կայուն բարդույթ ստեղծելու համար: Այս տեխնիկայից ստացված արդյունքները կարող են օգտագործվել երկու մոլեկուլների միջև ասոցիացիայի կամ կապակցման ուժը կանխատեսելու համար: Այստեղ կարևոր է նաև մոլեկուլային գնահատման ֆունկցիան։
Նկար 01. Պարզ դիագրամ, որը ցույց է տալիս մոլեկուլային փոխազդեցության գործընթացը կենսաբանական համակարգերում
Ընդհանուր առմամբ, այս տեխնիկան հաշվի է առնում կենսաբանորեն համապատասխան մոլեկուլները, ինչպիսիք են սպիտակուցները, պեպտիդները, նուկլեինաթթուները, ածխաջրերը և լիպիդները: Այս մոլեկուլները շատ կարևոր են, և նրանք կարևոր դեր են խաղում մեր մարմնում ազդանշանի փոխանցման մեխանիզմներում: Հետևաբար, երկու մոլեկուլների կողմնորոշումը, որոնք պատրաստվում են կապվել այս ազդանշանի հաղորդման գործընթացի համար, ազդում է այստեղ արտադրվող ազդանշանի տեսակի վրա:Դա նշանակում է; մոլեկուլային միացումը կարևոր է կենսաբանական համակարգերում ազդանշանի փոխակերպման ընթացքում արտադրվող ազդանշանի ուժը և տեսակը որոշելու համար:
Ավելին, կառուցվածքի վրա հիմնված դեղերի նախագծման համար կարևոր են մոլեկուլային դոկավորման տեխնիկան: Դա պայմանավորված է փոքր մոլեկուլների, օրինակ՝ լիգանդների, համապատասխան կապակցման տեղամասի հետ կապելու նրա կանխատեսելիությամբ:
Ի՞նչ է մոլեկուլային գնահատումը:
Մոլեկուլային գնահատումը մաթեմատիկական ֆունկցիայի մի տեսակ է, որն օգտակար է մոլեկուլային կցման առաջընթացը գնահատելու համար: Հաշվարկային քիմիայի բնագավառում միավորման գործառույթները օգտագործվում են երկու մոլեկուլների միջև կապակցման կապը կանխագուշակելու համար՝ միացման գործընթացից հետո: Օրինակ, եթե մենք ունենք մասնիկների դեղամիջոցի փոքր մոլեկուլ և կա կենսաբանական թիրախ, ինչպիսին է սպիտակուցը, մենք կարող ենք գնահատել դեղամիջոցի մերձեցումը կապող վայրի նկատմամբ: Ավելին, մոլեկուլային միավորը կարող է օգտագործվել երկու սպիտակուցների կամ սպիտակուցի և ԴՆԹ մոլեկուլների միջև միջմոլեկուլային փոխազդեցությունները կանխատեսելու համար:
Գծապատկեր 02. Միավորների գնահատման գործառույթը համառոտ
Մոլեկուլային գնահատման հիմնական կիրառումը դեղերի նախագծման գործընթացներում է, օրինակ՝ վիրտուալ զննում, դե նոր դիզայն, կապարի օպտիմալացում և այլն:
Ո՞րն է տարբերությունը մոլեկուլային ամրացման և գնահատման միջև:
Մոլեկուլային ամրացումը և գնահատումը կարևոր են մոլեկուլային մոդելավորման մեջ: Մոլեկուլային դոկինգի և գնահատման հիմնական տարբերությունն այն է, որ դոկավորումը տեխնիկա է, որն օգտագործվում է երկու մոլեկուլների միջև կապակցման կապը որոշելու համար, մինչդեռ գնահատումը որոշակի դիրքի գնահատման գործընթաց է՝ հաշվելով բարենպաստ միջմոլեկուլային փոխազդեցությունների քանակը:
Հետևյալ ինֆոգրաֆիկան ամփոփում է մոլեկուլային ամրացման և գնահատման միջև եղած տարբերությունը:
Ամփոփում – Մոլեկուլային ամրացում ընդդեմ միավորների
Մոլեկուլային ամրացումը և գնահատումը կարևոր են մոլեկուլային մոդելավորման մեջ: Մոլեկուլային դոկինգի և գնահատման հիմնական տարբերությունն այն է, որ դոկավորումը տեխնիկա է, որն օգտագործվում է երկու մոլեկուլների միջև կապակցման կապը որոշելու համար, մինչդեռ գնահատումը որոշակի դիրքի գնահատման գործընթաց է՝ հաշվելով բարենպաստ միջմոլեկուլային փոխազդեցությունների քանակը:
