Օլիգոպեպտիդների և պոլիպեպտիդների հիմնական տարբերությունն այն է, որ օլիգոպեպտիդները պարունակում են ամինաթթուների քիչ մնացորդներ, մինչդեռ պոլիպեպտիդները պարունակում են մեծ թվով ամինաթթուների մնացորդներ:
Օլիգոպեպտիդներ և պոլիպեպտիդներ տերմինները պատկանում են սպիտակուցների կատեգորիային: Պեպտիդները ամինաթթուների կարճ շղթաներ են։ Ամինաթթուները միմյանց հետ կապվում են պեպտիդային կապերի միջոցով: Հետևաբար, մենք կարող ենք դասակարգել այս պեպտիդները՝ ըստ այդ պեպտիդներում առկա ամինաթթուների քանակի: Օրինակ՝ դիպեպտիդներ, տրիպեպտիդներ, տետրապեպտիդներ, օլիգոպեպտիդներ և պոլիպեպտիդներ։
Ի՞նչ է օլիգոպեպտիդը:
Օլիգոպեպտիդը ամինաթթուների շղթա է, որը պարունակում է փոքր քանակությամբ ամինաթթուներ յուրաքանչյուր մոլեկուլում:Մենք հաճախ այդ մոլեկուլները անվանում ենք «պեպտիդներ», որպես ընդհանուր տերմին: Այս պեպտիդային մոլեկուլներում առկա ամինաթթուների մնացորդների թիվը կարող է տատանվել երկուից մինչև քսան ամինաթթուների միջև: Օլիգոպեպտիդները կարող են ներառել նաև որոշ փոքր պեպտիդային ձևեր, ինչպիսիք են դիպեպտիդները, տրիպեպտիդները և այլն: Բնության մեջ հանդիպող օլիգոպեպտիդների որոշ ընդհանուր օրինակներ ներառում են միկրովիրիդինը, ցիանոպեպտոլինները, միկրոցիստինները և այլն:
Նկար 01. Տրիպեպտիդի կառուցվածքը
Այս օլիգոպեպտիդները արտադրվում են ոչ ռիբոսոմային պեպտիդների սինթազներով կամ NRPS-ով: Բայց կան որոշ բացառություններ։ Օրինակ, ցիկլամիդները և միկրովիրիդինը սինթեզվում են ռիբոսոմային ուղիներով: Օլիգոպեպտիդների մեկուսացման գործընթացը ներառում է օլիգոպեպտիդների հարստացում, մաքրում և նույնականացում: Նույնականացման գործընթացի համար մենք կարող ենք օգտագործել գելային քրոմատագրություն, HPLC, HPLC-զանգվածային սպեկտրոսկոպիա, իոնափոխանակման քրոմատոգրաֆիա և այլն:
Ի՞նչ է պոլիպեպտիդը
Պոլիպեպտիդը ամինաթթուների մնացորդների շղթա է, որը պարունակում է մեծ քանակությամբ ամինաթթուներ: Սպիտակուցը պարունակում է մեկ կամ մի քանի պոլիպեպտիդ շղթաներ: Այս պոլիպեպտիդային շղթաներում ամինաթթուները միմյանց հետ կապված են պեպտիդային կապերի միջոցով, որոնք կովալենտային քիմիական կապերի տեսակ են։ Յուրաքանչյուր պոլիպեպտիդային շղթա պարունակում է երկու տերմինալ՝ N-տերմինալ և C-տերմինալ: N-տերմինալը ամինո-տերմինալն է, որն ավարտվում է ազատ ամինո խմբով, մինչդեռ C-տերմինալը կարբոքսիլ-տերմինալն է, որն ավարտվում է ազատ կարբոքսիլ խմբով: Պեպտիդում առկա ամինաթթուների հաջորդականությունը որոշվում է mRNA-ի կոդոններով, որոնք ներգրավված են պոլիպեպտիդի կամ սպիտակուցի արտադրության մեջ՝ ձևանմուշի շարանը թարգմանելու միջոցով:
Ըստ սպիտակուցի պոլիպեպտիդների քանակի և դասավորության՝ գոյություն ունեն սպիտակուցային կառուցվածքների չորս հիմնական տեսակներ՝
- Առաջնային կառուցվածք – Սպիտակուցի առաջնային կառուցվածքը պարունակում է մեկ պոլիպեպտիդ շղթա, որն ունի դիսուլֆիդային կամուրջներ նույն շղթայի որոշ ամինաթթուների միջև, ինչը կազմում է ծալովի կառուցվածք:
- Երկրորդական կառուցվածք – Սպիտակուցի երկրորդական կառուցվածքն ունի երկու հիմնական ձև՝ ալֆա-խխունջի կառուցվածք և բետա-թերթի կառուցվածք:
Նկար 02. Ալֆա պարույրի կառուցվածք
- Երրորդական կառուցվածք – Սա շատ ծալովի ցանցային կառուցվածք է: Այս կառուցվածքը շատ կարևոր է, քանի որ այն որոշում է սպիտակուցի գործառույթը:
- Չորրորդական կառուցվածք – Սա երկու կամ երեք պոլիպեպտիդային շղթաներից կազմված խիստ բարդ կառուցվածք է, որոնք կապված են միմյանց հետ:
Ո՞րն է տարբերությունը օլիգոպեպտիդի և պոլիպեպտիդի միջև:
Օլիգոպեպտիդները և պոլիպեպտիդները սպիտակուցների երկու տարբեր կատեգորիաներ են: Նրանք տարբերվում են միմյանցից՝ կախված սպիտակուցի մոլեկուլներում առկա ամինաթթուների մնացորդների քանակից։Հետևաբար, օլիգոպեպտիդի և պոլիպեպտիդի միջև հիմնական տարբերությունն այն է, որ օլիգոպեպտիդները պարունակում են ամինաթթուների մի քանի մնացորդներ, մինչդեռ պոլիպեպտիդները պարունակում են մեծ քանակությամբ ամինաթթուների մնացորդներ:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ամփոփում է օլիգոպեպտիդի և պոլիպեպտիդի միջև եղած տարբերությունը:
Ամփոփում – Օլիգոպեպտիդ ընդդեմ պոլիպեպտիդ
Օլիգոպեպտիդները և պոլիպեպտիդները սպիտակուցների երկու տարբեր կատեգորիաներ են: Նրանք տարբերվում են միմյանցից՝ կախված այս սպիտակուցային մոլեկուլներում առկա ամինաթթուների մնացորդների քանակից։ Այսինքն, օլիգոպեպտիդի և պոլիպեպտիդի միջև հիմնական տարբերությունն այն է, որ օլիգոպեպտիդները պարունակում են ամինաթթուների մի քանի մնացորդներ, մինչդեռ պոլիպեպտիդները պարունակում են մեծ քանակությամբ ամինաթթուների մնացորդներ:
