1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի հիմնական տարբերությունը գելային էլեկտրոֆորեզի վրա սպիտակուցների բաժանման համար օգտագործվող հատկություններն են: 1D գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է միայն սպիտակուցները՝ ելնելով մոլեկուլային քաշից, մինչդեռ 2D գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է սպիտակուցները՝ ելնելով դրա իզոէլեկտրական կետից և մոլեկուլային քաշից:
Սպիտակուցների տարանջատումը գելային էլեկտրոֆորեզով սպիտակուցները բնութագրելու կարևոր տեխնիկա է: Սպիտակուցներն ունեն տարբեր հատկություններ. Հետևաբար, տարանջատումը ավելի բարդ է՝ համեմատած ԴՆԹ-ի տարանջատման հետ Ագարոզայի գելային էլեկտրոֆորեզի միջոցով:
Ի՞նչ է 1D գելային էլեկտրոֆորեզը:
1D գելային էլեկտրոֆորեզը, որը նաև հայտնի է որպես միաչափ գելային էլեկտրոֆորեզ, սպիտակուցների բաժանման մեթոդ է՝ հիմնված մոլեկուլային քաշի վրա:Սպիտակուցների տարանջատումը հիմնականում տեղի է ունենում պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզի միջոցով: Գելային էլեկտրոֆորեզի գաղափարի հիման վրա մոլեկուլները բաժանվում են իրենց մոլեկուլային քաշի և լիցքի հատկության հիման վրա:
Հետևաբար, սպիտակուցներին միատեսակ լիցք հաղորդելու համար նատրիումի դոդեցիլ սուլֆատով (SDS) բուժումը կատարվում է մինչև գելային էլեկտրոֆորեզը: SDS-ը դենատուրացնում է սպիտակուցները և ապահովում է միատեսակ բացասական լիցք սպիտակուցի վրա. երբ էլեկտրական դաշտի կիրառումը տեղի է ունենում, սպիտակուցները գաղթում են դեպի դրական տերմինալ՝ ելնելով իրենց մոլեկուլային քաշից: Այսպիսով, առանձնացման ժամանակ դիտարկվում է միայն մեկ սեփականություն. Ահա թե ինչու այս մեթոդը կոչվում է 1D գելային էլեկտրոֆորեզ:
Նկար 01. 1D գելային էլեկտրոֆորեզ
1D գելային էլեկտրոֆորեզի ժամանակ սպիտակուցները բաժանվում են՝ ելնելով դրանց մոլեկուլային քաշից: Այս առումով, ցածր քաշի մոլեկուլները ավելի արագ են գաղթում գելում՝ համեմատած բարձր մոլեկուլային քաշի սպիտակուցների հետ: Այսպիսով, բարձր քաշով սպիտակուցները մնում են հորերի մոտ։
Ի՞նչ է 2D գելային էլեկտրոֆորեզը:
2D գելային էլեկտրոֆորեզը կամ երկչափ գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է սպիտակուցները՝ հիմնվելով երկու հատկությունների վրա: Երկու հատկությունները սպիտակուցի իզոէլեկտրական կետն են և մոլեկուլային քաշը: Սպիտակուցների տարանջատման այս մեթոդը մեծացնում է սպիտակուցների տարանջատման լուծումը: Սպիտակուցի իզոէլեկտրական կետը կախված է pH-ից, որի դեպքում սպիտակուցը չեզոք է:
Նկար 02. 2D գելային էլեկտրոֆորեզ
Այսպիսով, 2D գելային էլեկտրոֆորեզում սպիտակուցին թույլատրվում է գործել ֆիքսված pH գրադիենտով առաջին հարթությունում: Երկրորդ հարթությունում սպիտակուցները բաժանվում են ուղղահայաց կամ հորիզոնական պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզի միջոցով: Այսպիսով, սպիտակուցները բաժանվում են ըստ իրենց մոլեկուլային քաշի երկրորդ հարթությունում:
Բացի այդ, գելային էլեկտրոֆորեզի այս մեթոդը մեծացնում է սպիտակուցների տարանջատման լուծունակությունը: Հետեւաբար, առանձնացված սպիտակուցներն ավելի մաքուր են։ Այնուամենայնիվ, տեխնիկայի արժեքը շատ ավելի բարձր է, քան միաչափ գելային էլեկտրոֆորեզը:
Որո՞նք են նմանությունները 1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի միջև:
- Երկու տեխնիկան էլ առանձնացնում են սպիտակուցները:
- Հետևաբար, դրանք կարևոր են սպիտակուցները բնութագրելու համար:
Ո՞րն է տարբերությունը 1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի միջև:
1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի հիմնական տարբերությունն այն է, որ 1D գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է սպիտակուցները՝ հիմնվելով միայն մոլեկուլային քաշի վրա, մինչդեռ 2D գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է սպիտակուցները՝ հիմնվելով և՛ իզոէլեկտրական կետի, և՛ մոլեկուլային քաշի վրա: 1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի միջև այս հիմնական տարբերության պատճառով սպիտակուցների տարանջատման լուծումը և երկու տեխնիկայի արժեքը նույնպես տարբերվում են:2D գելային էլեկտրոֆորեզը ցույց է տալիս բարձր լուծում, քան 1D գելային էլեկտրոֆորեզը: Այնուամենայնիվ, 2D գելային էլեկտրոֆորեզն ավելի թանկ է, քան 1D գելային էլեկտրոֆորեզը:
Ստորև ինֆոգրաֆիկայում ամփոփված է 1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի տարբերությունը:
Ամփոփում – 1D vs 2D գելային էլեկտրոֆորեզ
Սպիտակուցների տարանջատումը հիմնված է բազմաթիվ գործոնների վրա: 1D գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է սպիտակուցները՝ հիմնվելով միայն մոլեկուլային քաշի վրա: Այնուամենայնիվ, երկչափ կամ 2D գելային էլեկտրոֆորեզը մեծացնում է սպիտակուցի տարանջատման լուծումը: Ավելին, 2D գելային էլեկտրոֆորեզը բաժանում է սպիտակուցները՝ հիմնվելով իզոէլեկտրական կետի և մոլեկուլային քաշի վրա: Հետևաբար, այս տվյալները կարևոր են սպիտակուցների վերամշակման և պրոտեոմիկայի ոլորտում:Այսպիսով, սա 1D և 2D գելային էլեկտրոֆորեզի միջև եղած տարբերության ամփոփումն է։
