Հիմնական տարբերություն – Գել էլեկտրոֆորեզ ընդդեմ SDS Էջ
Գելային էլեկտրոֆորեզը տեխնիկա է, որն առանձնացնում է մակրոմոլեկուլները էլեկտրական դաշտում: Մոլեկուլային կենսաբանության մեջ տարածված մեթոդ է՝ ԴՆԹ-ն, ՌՆԹ-ն և սպիտակուցները խառնուրդներից առանձնացնելը՝ ըստ դրանց մոլեկուլային չափերի: SDS Page-ը գելային էլեկտրոֆորեզի տեսակ է, որն օգտագործվում է սպիտակուցները սպիտակուցային խառնուրդից առանձնացնելու համար՝ ելնելով դրանց չափերից: Գելային էլեկտրոֆորեզը տերմին է, որն օգտագործվում է ԴՆԹ-ի, ՌՆԹ-ի և սպիտակուցի բաժանման համար կիրառվող նորմալ տեխնիկայի համար, մինչդեռ SDS Page-ը գելային էլեկտրոֆորեզի մեկ տեսակ է: Սա գել էլեկտրոֆորեզի և SDS էջի հիմնական տարբերությունն է:
Ի՞նչ է գելային էլեկտրոֆորեզը:
Գելային էլեկտրոֆորեզը տարածված մեթոդ է, որն օգտագործվում է լաբորատորիաներում լիցքավորված մոլեկուլները, ինչպիսիք են ԴՆԹ-ն, ՌՆԹ-ն, սպիտակուցները և այլն, դրանց խառնուրդներից առանձնացնելու համար: Գելային էլեկտրոֆորեզում օգտագործվում է գել: Այն գործում է որպես մոլեկուլային մաղ: Գել էլեկտրոֆորեզում օգտագործվող գելերի երկու տեսակ կա՝ ագարոզա և պոլիակրիլամիդ: Գելի և գելի պատրաստման ընտրությունը կարևոր գործոններ են, որոնք պետք է հաշվի առնել գելային էլեկտրոֆորեզում, քանի որ գելի ծակոտիների չափը պետք է ուշադիր կառավարվի՝ գել էլեկտրոֆորեզի միջոցով մոլեկուլների լավ բաժանման համար: Գելային էլեկտրոֆորեզը ունի էլեկտրական դաշտ, որը կապված է գելի երկու ծայրերին: Գելի մի ծայրը դրական լիցք է ցույց տալիս, իսկ մյուս ծայրը բացասական լիցքավորված է։
ԴՆԹ-ն և ՌՆԹ-ն բացասական լիցքավորված մոլեկուլներ են: Երբ դրանք բեռնվում են գելի մեջ գելի բացասական ծայրից և կիրառվում են էլեկտրական դաշտի վրա, նրանք գաղթում են գելի ծակոտիների միջով դեպի դրական լիցքավորված գելի ծայրը:Միգրացիայի արագությունը կախված է լիցքից և մոլեկուլի չափից։ Ավելի փոքր մոլեկուլները հեշտությամբ անցնում են գելի ծակոտիների միջով, քան ավելի մեծ մոլեկուլները: Այսպիսով, փոքր մոլեկուլները երկար ճանապարհ են անցնում գելի միջով, իսկ ավելի մեծ մոլեկուլները՝ կարճ տարածություն: Գելի վրա մոլեկուլների շարժը դիտարկելու համար օգտագործվում են ներկերի հատուկ տեսակներ։ Էլեկտրական դաշտը կիրառվում է որոշակի ժամանակահատվածում և կանգ է առնում մոլեկուլների կորուստը կանխելու և մոլեկուլները իրենց շարժվող դիրքերում պահելու համար: Գելի մեջ կարելի է նկատել տարբեր շերտեր: Այս շերտերը ներկայացնում են տարբեր չափերի մոլեկուլներ: Հետևաբար, գելային էլեկտրոֆորեզը օգտակար է մոլեկուլները տարբերելու համար՝ ըստ դրանց չափերի։
Գելային էլեկտրոֆորեզը ներառված է տարբեր մեթոդների մեջ՝ որպես մոլեկուլային կենսաբանության նախապատրաստական տեխնիկա, ինչպիսիք են PCR, RFLP, կլոնավորում, ԴՆԹ-ի հաջորդականացում, հարավային բլոթինգ, գենոմի քարտեզագրում և այլն:
Նկար 01. Ագարոզայի գելի էլեկտրոֆորեզ
Ի՞նչ է SDS էջը:
Նատրիումի դոդեցիլսուլֆատ պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզը (SDS Page) գելային էլեկտրոֆորեզի տեսակ է, որն օգտագործվում է սպիտակուցները առանձնացնելու համար: Երբ գելային էլեկտրոֆորեզն օգտագործվում է սպիտակուցները առանձնացնելու համար, անհրաժեշտ է հատուկ բուժում, քանի որ սպիտակուցները բացասական լիցքավորված չեն, ինչպես ԴՆԹ-ն և ՌՆԹ-ն և չեն տեղափոխվում դեպի դրական վերջ կամ բացասական վերջ: Այսպիսով, սպիտակուցները դենատուրացված են և ծածկվում են բացասական լիցքով մինչև գելային էլեկտրոֆորեզը: Այն կատարվում է լվացքի միջոցի միջոցով, որը կոչվում է նատրիումի դոդեցիլ սուլֆատ (SDS): Գելային էլեկտրոֆորեզը, որն օգտագործում է SDS և պոլիակրիլամիդ գել օժանդակ միջավայրի համար, հայտնի է որպես SDS Page: Այս տեխնիկան սովորաբար օգտագործվում է կենսաքիմիայի, գենետիկայի, դատաբժշկական և մոլեկուլային կենսաբանության մեջ:
SDS էջի ընթացքում սպիտակուցները խառնվում են SDS-ի հետ: SDS-ը սպիտակուցները բացում է գծային ձևի և ծածկում դրանք բացասական լիցքով, որը համաչափ է նրանց մոլեկուլային զանգվածին:Բացասական լիցքի պատճառով սպիտակուցի մոլեկուլները գաղթում են դեպի գելի դրական լիցքի ծայրը և բաժանվում՝ ըստ իրենց մոլեկուլային զանգվածների։ SDS Page-ում պոլիակրիլամիդն օգտագործվում է որպես գելի ամուր հենարան: Սպիտակուցների իրական տարանջատումը հիմնականում կախված է գելի հատկություններից։ Հետևաբար, պոլիակրիլամիդի գելի պատրաստումը պետք է ուշադիր արվի և օգտագործվի պոլիակրիլամիդի ճիշտ կոնցենտրացիաներ: Պոլիակրիլամիդային գելերը ցույց են տալիս բարձր լուծում, քան ագարոզայի գելերը: Հետևաբար, SDS էջը համարվում է սպիտակուցի առանձնացման բարձր լուծաչափի տեխնիկա:
SDS էջը դենատուրացնող գելային էլեկտրոֆորեզի տեսակ է: Այն ունի հիմնական սահմանափակում սպիտակուցի վերլուծության մեջ: Քանի որ SDS-ը դենատուրացնում է սպիտակուցները մինչև տարանջատումը, այն թույլ չի տալիս հայտնաբերել ֆերմենտային ակտիվությունը, սպիտակուցների կապակցման փոխազդեցությունները, սպիտակուցային կոֆակտորները և այլն:
Նկար 02. SDS էջ
Ո՞րն է տարբերությունը գել էլեկտրոֆորեզի և SDS էջի միջև:
Գել էլեկտրոֆորեզ ընդդեմ SDS Էջ |
|
| Գելային էլեկտրոֆորեզը մեթոդ է, որն իրականացվում է մակրոմոլեկուլները էլեկտրական դաշտի միջոցով առանձնացնելու համար: | SDS Page-ը բարձր լուծաչափով գելային էլեկտրոֆորեզի մեթոդ է, որն օգտագործվում է սպիտակուցները բաժանելու համար՝ հիմնվելով դրանց զանգվածի վրա: |
| Գել վազք | |
| Այն կարող է իրականացվել հորիզոնական կամ ուղղահայաց եղանակով: | SDS էջը միշտ աշխատում է ուղղահայաց: |
| Բաժանման հիմք | |
| Բաժանումը տեղի է ունենում ըստ լիցքավորման և չափի։ | Սպիտակուցների տարանջատումը տեղի է ունենում ըստ զանգվածի և լիցքի: |
| Բանաձև | |
| Ագարոզայի գելային էլեկտրոֆորեզն ունի ցածր խտություն, իսկ պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզը՝ ավելի բարձր թույլատրելիություն | SDS էջն ավելի լավ լուծում ունի: |
| Դենատուրացիա | |
| Գելային էլեկտրոֆորեզը ներառում է ինչպես դենատուրացնող, այնպես էլ չդենատուրացնող տեխնիկա: | SDS էջը դենատուրացնում է սպիտակուցները մինչև տարանջատումը: |
Ամփոփում – Գել էլեկտրոֆորեզ ընդդեմ SDS Էջ
Գելային էլեկտրոֆորեզը տարածված մեթոդ է, որն օգտագործվում է ԴՆԹ-ի, ՌՆԹ-ի և սպիտակուցների բաժանման և վերլուծության համար՝ հիմնվելով դրանց չափի և լիցքի վրա: Գել էլեկտրոֆորեզի երկու հիմնական տեսակ կա՝ ագարոզա գելային էլեկտրոֆորեզ և պոլիակրիլամիդ գել էլեկտրոֆորեզ: Ագարոզայի գելերը հիմնականում օգտագործվում են նուկլեինաթթուների տարանջատման համար; երբ ավելի բարձր լուծաչափ է պահանջվում, օգտագործվում են պոլիակրիլամիդ գելեր:SDS Page-ը գելային էլեկտրոֆորեզի տեսակ է, որը սովորաբար օգտագործվում է սպիտակուցների բարդ խառնուրդները առանձնացնելու համար: Այն համարվում է սպիտակուցների առանձնացման բարձր լուծաչափի տեխնիկա: Սա է տարբերությունը գելային էլեկտրոֆորեզի և SDS էջի միջև:
