Ալֆա և բետա պարույրի հիմնական տարբերությունը կախված է ջրածնային կապի տեսակից, որը նրանք ձևավորում են այս կառուցվածքները զարգացնելու ժամանակ: Ալֆա պարույրները կազմում են ներմոլեկուլային ջրածնային կապեր, իսկ բետա պարույրները՝ միջմոլեկուլային ջրածնային կապեր։
Բարդ սպիտակուցներն ունեն չորս կառուցվածքային կազմակերպչական մակարդակ՝ առաջնային, երկրորդային, երրորդային և չորրորդական: Սպիտակուցների երկրորդական կառուցվածքները կազմում են պեպտիդային շղթաները տարբեր կողմնորոշմամբ։ Պեպտիդային շղթաները բաղկացած են ամինաթթուների հաջորդականություններից, որոնք կապված են պեպտիդային կապերով։ Հետևաբար, սպիտակուցներում կան երկու հիմնական երկրորդական կառուցվածքներ՝ ալֆա պարույր և բետա պարույր: Բացի այդ, կան այլ երկրորդական կառույցներ, որոնք կոչվում են բետա շրջադարձ և մազակալի կառուցվածքներ:Հիմնականում այս հոդվածը կենտրոնանում է ալֆա և բետա պարույրի միջև եղած տարբերության վրա:
Ինչ է Alpha Helix?
Սպիտակուցներն ունեն կազմակերպման չորս կառուցվածքային մակարդակ: Դրանցից ալֆա պարույրը սպիտակուցների ամենատարածված երկրորդական կառուցվածքն է: Եվ այս կառույցը հայտնվում է որպես ձող, որը պտտվում է կենտրոնական առանցքի շուրջ: Ավելին, ալֆա պարույրը աջակողմյան պարույր է: Այնուամենայնիվ, կարող էին լինել նաև ձախակողմյան խխունջներ: Այստեղ պեպտիդային կապերը ձևավորվում են ամինո-տերմինալից մինչև կարբոքսի-տերմինալ: Ամինաթթուները միմյանց հետ կապվում են այս պեպտիդային կապերի միջոցով: Ներմոլեկուլային ջրածնային կապերը ալֆա պարույրի ձևավորման հիմնական պատճառն են։
Նկար 01. Ալֆա խխունջ
Ալֆա պարույրի դասավորությունը կախված է սպիտակուցի հիդրոֆիլ և հիդրոֆոբ բնույթից:Եթե ամինաթթուների հաջորդականությունը բաղկացած է մեծ թվով հիդրոֆիլ R (փոփոխական) խմբերից, ապա R խմբերը կողմնորոշվում են դեպի ջրային փուլ։ Եթե փոփոխական խմբերը հիդրոֆոբ են, ապա դրանք դուրս կգան շրջակա միջավայրի հիդրոֆոբ փուլ: Երկու սցենարի դեպքում R խմբերը կարծես դուրս են գալիս պտուտակավոր կառուցվածքից: Այս կառուցվածքային բնութագրերի շնորհիվ ալֆա խխունջն ավելի դիմացկուն է մուտացիաների նկատմամբ։ Այսպիսով, ջրածնային կապերի առկայությունը կայունացնում է ալֆա պարույրի կառուցվածքը։ Ալֆա պարույրում միջինը 3,6 մնացորդ կա մեկ պտույտի մեջ, քանի որ ջրածնային կապերի զարգացման համար պահանջվում է 3,6 մնացորդ: Որոշ կառուցվածքային սպիտակուցներ, ինչպիսիք են կոլագենը և կերատինը, հարուստ են ալֆա պարույրներով:
Ի՞նչ է Beta Helix-ը:
Բետա պարույրը սպիտակուցի երկրորդ ամենատարածված կառուցվածքն է: Չնայած այն այնքան տարածված չէ, որքան ալֆա պարույրը, սակայն բետա պարույրների առկայությունը նույնպես մեծ դեր է խաղում սպիտակուցի կառուցվածքում: Բետա պարույրի ձևավորումը տեղի է ունենում երկու բետա թերթերի միջոցով, որոնք դասավորված են կամ զուգահեռ ձևով կամ հակազուգահեռ ձևով:Այդ թերթերն այնուհետև ձևավորվում են պտուտակաձև կառուցվածքի: Միջմոլեկուլային ջրածնային կապերը երկու թիթեղների միջև օգնում են բետա պարույրի ձևավորմանը:
Նկար 02. Beta Helix
Բետա պարույրները կարող են լինել և՛ աջակողմյան, և՛ ձախակողմյան՝ կախված դրանց կապման ձևերից: Բետա պարույր ձևավորելիս երկու բետա թերթերի փոփոխական խմբերը կդասավորվեն պարույրի միջուկում: Հետևաբար, բետա թերթեր կազմող խմբերի մեծամասնությունն ունեն հիդրոֆոբ ֆունկցիաներ։
Ի տարբերություն ալֆա պարույրի, 17 մնացորդներ կազմում են մեկ պտույտ բետա պարույրներում: Մետաղական իոններն ունեն բետա պարույրի ձևավորումն ակտիվացնելու հատկություն։ Ալֆա պարույրի նման, ջրածնային կապերն ապահովում են բետա պարույրի կառուցվածքը պահպանելու համար: Կարբոնախիդրազ ֆերմենտը և պեկտատ լիազը երկու սպիտակուցներ են, որոնք հարուստ են բետա պարույրներով:
Որո՞նք են նմանությունները Alpha-ի և Beta Helix-ի միջև:
- Ալֆան և բետա պարույրը սպիտակուցների երկու երկրորդական կառուցվածքներ են:
- Ամինաթթուները երկու երկրորդական կառուցվածքների մոնոմերներն են:
- Ավելին, ալֆա և բետա պարույրների քիմիական բաղադրիչներն են ածխածինը, ջրածինը, թթվածինը, ազոտը և ծծումբը:
- Նաև, երկու երկրորդական կառույցները վերածվում են ավելի բարձր մակարդակի կազմակերպության:
- Ավելին, երկուսն էլ կայունացվում են ջրածնային կապերով։
- Երկու կառույցներում էլ հիդրոֆոբությունը որոշվում է ամինաթթուների R խմբերի առկայությամբ:
Ո՞րն է տարբերությունը Ալֆայի և Բետա պարույրի միջև:
Ալֆա և բետա պարույրի հիմնական տարբերությունը ջրածնային կապի տեսակն է, որը նրանք ցույց են տալիս: Ալֆա պարույրը ցույց է տալիս ներմոլեկուլային ջրածնային կապ, մինչդեռ բետա պարույրը ցույց է տալիս միջմոլեկուլային ջրածնային կապ:Բացի այդ, ալֆա խխունջը ձևավորում է աջակողմյան պարույր, մինչդեռ բետա պարույրը կարող է ձևավորել և՛ աջ, և՛ ձախ: Այսպիսով, սա նաև էական տարբերություն է ալֆա և բետա պարույրի միջև:
Ավելին, ալֆա և բետա պարույրի միջև հետագա տարբերությունն այն է, որ ալֆա պարույրի ձևավորումը տեղի է ունենում ամինաթթուների հաջորդականության շրջադարձով, մինչդեռ բետա պարույրի ձևավորման ժամանակ երկու բետա թերթերը՝ զուգահեռ կամ հակազուգահեռ, կապված են. ձևավորել պտուտակավոր կառուցվածքը։
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ներկայացնում է ավելի շատ տեղեկատվություն ալֆա և բետա պարույրի միջև տարբերության վերաբերյալ:
Ամփոփում – Ալֆա ընդդեմ բետա խխունջ
Եվ ալֆա պարույրները և բետա պարույրները կարևոր են բարդ սպիտակուցային կառուցվածքների հայտնաբերման և հանգուցալուծման համար: Երկու տեսակներն էլ սպիտակուցների երկրորդական կառուցվածքներ են։Այնուամենայնիվ, ալֆա պարույրը ամինաթթուների հաջորդականությունների պարուրաձև շրջադարձ է: Ի հակադրություն, բետա պարույրի ձևավորումը տեղի է ունենում զուգահեռ կամ հակազուգահեռ բետա թերթերի ջրածնային կապի միջոցով: Ավելին, ջրածնի կապը ներմոլեկուլային է ալֆա պարուրաձև ձևով, մինչդեռ ջրածնային կապը միջմոլեկուլային է բետա պարուրաձև ձևով: Բացի այդ, այս երկու կառույցներն էլ ունեն R խումբ, որը որոշում է սպիտակուցի հիդրոֆոբությունը։ Այսպիսով, սա ամփոփում է ալֆա և բետա պարույրի միջև եղած տարբերությունը:
