Հիմնական տարբերություն – Exome vs Transcriptome
Գենը պարունակում է իր ներսում կոդավորող և ոչ կոդավորող շրջաններ: Կոդավորող հաջորդականությունները հայտնի են որպես էկզոններ, իսկ ոչ կոդավորող հաջորդականությունները՝ ինտրոններ։ Գենի էկզոնների նուկլեոտիդային հաջորդականությունը ներկայացնում է գենի գենետիկ կոդը՝ հատուկ սպիտակուցը սինթեզելու համար։ Այսպիսով, էկզոնները մնում են mRNA մոլեկուլում: Գենոմի ընդհանուր էկզոնային շրջանը հայտնի է որպես էքսոմ, և դա գենոմի կարևոր մասն է: Գենների գենետիկ կոդը վերածվում է mRNA մոլեկուլի գենետիկ կոդի, որն անհրաժեշտ է սպիտակուցի արտադրության համար։ Բջջում կամ բջջային պոպուլյացիայի մեջ միաժամանակ արտագրված mRNA-ի ամբողջ մոլեկուլները հայտնի են որպես տրանսկրիպտոմ:Էքսոմի և տրանսկրիպտոմի հիմնական տարբերությունն այն է, որ էկզոմը ներկայացնում է գենոմի էկզոնային շրջանների հաջորդականությունները, մինչդեռ տրանսկրիպտոմը ներկայացնում է տվյալ պահին բջջի կամ հյուսվածքի ընդհանուր mRNA-ն::
Ի՞նչ է Exome?
Գենները կազմված են էկզոններից, ինտրոններից և կարգավորող հաջորդականություններից։ Էկզոնները գենային շրջաններ են, որոնք տրանսկրիպցիայի ընթացքում տառադարձվում են mRNA հաջորդականության: Ինտրոնները և այլ ոչ կոդավորող շրջանները հանվում են տառադարձման ժամանակ: Էկզոնների նուկլեոտիդային հաջորդականությունը որոշում է գենի գենետիկ կոդը, որը սինթեզում է իր կողմից կոդավորված հատուկ սպիտակուցը: Սպիտակուցի mRNA-ում մնում են միայն էկզոնները: Գենոմում էկզոնների հավաքածուն հայտնի է որպես օրգանիզմի էքսոմ: Այն ներկայացնում է գենոմի մի մասը, որն արտահայտվում է գեներում։ Մարդկանց մոտ էկզոմը կազմում է գենոմի 1%-ը: Սա մարդու գենոմի սպիտակուցը կոդավորող մասն է։
Նկար 01. Exome
Ի՞նչ է Տրանսկրիպտոմը:
Տրանսկրիպտոմը բոլոր սպիտակուցային և ոչ կոդավորող տառադարձումների (ՌՆԹ) հավաքածուն է տվյալ հյուսվածքում: Տրանսկրիպտոմը ներկայացնում է մՌՆԹ-ի ընդհանուր մոլեկուլների հավաքածու, որոնք արտահայտված են բջջի կամ հյուսվածքի գեների կողմից: Բջջի տրանսկրիպտոմը կարող է տարբերվել մեկ այլ բջիջի տրանսկրիպտոմի հետ: Տրանսկրիպտոմը նույնպես դինամիկ է. այն փոխվում է ժամանակի հետ՝ ի պատասխան ինչպես ներքին, այնպես էլ արտաքին գրգռիչների: Նույնիսկ նույն հյուսվածքի կամ բջիջի նույն տեսակի ներսում տրանսկրիպտոմը կարող է փոխվել մի քանի րոպեից հետո:
Տրանսկրիպտոմը տարբերվում է օրգանիզմի էքսոմից: Տրանսկրիպտոմը ներառում է միայն արտահայտված էկզոմային հաջորդականությունները։ Թեև բջջի էքսոմը մնում է նույնը, տրանսկրիպտոմը տարբերվում է բջիջների միջև, քանի որ գենի արտահայտությունը նույնը չէ բոլոր բջիջների կամ հյուսվածքների համար: Միայն էական գեներն են արտահայտված տարբեր բջիջներում և հյուսվածքներում։Գենային արտահայտությունը հյուսվածքների կամ բջիջների տեսակի հատուկ գործընթաց է: Այն կարգավորվում է տարբեր գործոններով, ներառյալ շրջակա միջավայրի գործոնները: Հետևաբար, տրանսկրիպտոմը կարող է տարբերվել արտաքին միջավայրի պայմաններից կախված:
Transcriptome-ն օգտագործվում է որպես պրոտեոմիկայի ուսումնասիրությունների նախադրյալ: Բոլոր սպիտակուցները ստացվում են mRNA հաջորդականություններից: Թարգմանական փոփոխությունները կարող են հանգեցնել սպիտակուցների փոփոխությունների: Այնուամենայնիվ, տրանսկրիպտոմը կարևոր հիմնական տեղեկատվություն է տալիս պրոտեոմիական ուսումնասիրությունների համար:
Գծապատկեր 02. Սաղմնային ցողունային բջիջների տրանսկրիպտոմ
Ո՞րն է տարբերությունը Exome-ի և Transcriptome-ի միջև:
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome-ը գեների սպիտակուցային կոդավորման շրջանի հավաքածու է: | Տրանսկրիպտոմը բոլոր տրանսկրիպացված ՌՆԹ-ի հավաքածուն է, ներառյալ mRNA: |
| Նմուշ | |
| Exome-ն ուսումնասիրվում է ԴՆԹ-ի նմուշի միջոցով: | Տրանսկրիպտոմը ուսումնասիրվում է ՌՆԹ-ի նմուշի միջոցով: |
| Ուսումնառության մեթոդ | |
| Ամբողջ էկզոմի հաջորդականությունը էկզոմի ուսումնասիրության մեթոդն է: | ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը տրանսկրիպտոմի ուսումնասիրության մեթոդն է: |
Ամփոփում – Exome vs Transcriptome
Էկզոնները գեների կոդավորող հաջորդականություններն են և որոշում են սպիտակուցների mRNA հաջորդականությունները: Այս կոդավորող հաջորդականությունների (էկզոնների) հավաքածուն հայտնի է որպես օրգանիզմի էքսոմ։ Գեները տառադարձվում են mRNA մոլեկուլների՝ նախքան սպիտակուցներ ստեղծելը: Բջջի կամ հյուսվածքի ընդհանուր mRNA մոլեկուլները ցանկացած պահի հայտնի են որպես տրանսկրիպտոմ:Տրանսկրիպտոմը ներկայացնում է այն գեները, որոնք ցանկացած պահի ակտիվորեն արտահայտվում են mRNA-ում: Տրանսկրիպտոմը հատուկ է բջիջներին և հյուսվածքներին և ազդում է շրջակա միջավայրի պայմանների վրա: Սա է էքսոմի և տրանսկրիպտոմի տարբերությունը։
