EcoRI-ի և HindIII սահմանափակող ֆերմենտների միջև հիմնական տարբերությունն այն է, որ EcoRI-ն II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է E. coli-ից, մինչդեռ HindIII-ը II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է Haemophilus influenza-ից:
Սահմանափակման ֆերմենտը կամ սահմանափակող էնդոնուկլեազը ֆերմենտ է, որը ԴՆԹ-ն բաժանում է բեկորների՝ ԴՆԹ-ի մոլեկուլում գտնվող հատուկ ճանաչման վայրերում (սահմանափակման վայրեր): Այս սահմանափակող ֆերմենտները հայտնաբերված են բակտերիաներում և արխեաներում: Նրանք պաշտպանական մեխանիզմ են ապահովում ներխուժող վիրուսների դեմ: Սահմանափակող ֆերմենտները հիմնականում դասակարգվում են հինգ տարբեր տեսակների` տիպ I, տիպ II, տիպ III, IV և տիպ V:EcoRI-ն և HindIII-ը երկու սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք պատկանում են II տիպի սահմանափակող ֆերմենտների խմբին:
Ի՞նչ են EcoRI սահմանափակող ֆերմենտները:
EcoRI-ն II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է E.coli տեսակներից: Այն սահմանափակող ֆերմենտ է, որը ԴՆԹ-ի կրկնակի պարույրները բաժանում է բեկորների հատուկ տեղամասերում: EcoRI-ն նույնպես սահմանափակում-փոփոխման համակարգի մաս է կազմում։ EcoRI-ն առաջին ֆերմենտն էր, որն ի սկզբանե մեկուսացված էր E. coli տեսակի RY13 շտամից: Այն օգտագործվում է որպես սահմանափակող ֆերմենտ մոլեկուլային կենսաբանության մեջ։ EcoRI-ն ստեղծում է 4 նուկլեոտիդային կպչուն ծայրեր՝ AATT-ի 5' ծայրային ծայրերով: EcoRI-ն կտրում է ԴՆԹ-ն հատուկ ճանաչման G↓AATTC հաջորդականությամբ: Այն ունի CTTAA↓G-ի պալինդրոմային կոմպլեմենտար հաջորդականությունը: Ավելին, այս սահմանափակող ֆերմենտը պատկանում է II P տիպի (պալինդրոմային սպեցիֆիկություն) ենթադասին։ Իր առաջնային կառուցվածքում EcoRI-ն իր ակտիվ վայրում պարունակում է PD. D/EXK մոտիվը, ինչպես շատ այլ սահմանափակող ֆերմենտներ:
Նկար 01. EcoRI
EcoRI սահմանափակող ֆերմենտը 31 կԴա հզորությամբ հոմոդիմեր է: Այն պարունակում է α/β ճարտարապետության մեկ գլոբուլային տիրույթ։ Յուրաքանչյուր ենթաբաժին պարունակում է մի օղակ, որը դուրս է գալիս գնդային տիրույթից և կապվում է ԴՆԹ-ի շուրջը: Այս ֆերմենտը կարող է բյուրեղացվել այն հաջորդականությամբ, որը սովորաբար կտրում է: Ավելին, EcoRI սահմանափակող ֆերմենտը օգտագործվում է մոլեկուլային գենետիկական տեխնիկայի լայն տեսականիում, ներառյալ կլոնավորումը, ԴՆԹ-ի ցուցադրումը և ԴՆԹ-ի in-vitro պայմանների ջնջման բաժինները:
Ի՞նչ են HindIII սահմանափակող ֆերմենտները:
HindIII-ը II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է Haemophilus influenza-ի տեսակներից: Այն կտրում է ԴՆԹ-ի AACCTT պալինդրոմային հաջորդականությունը Mg2+ կոֆակտորի առկայության դեպքում հիդրոլիզի միջոցով:AA'S-ի (5'A↓ACCTT3' և 3'TTCGA↓A5') այս որոշակի հաջորդականության ճեղքումը հանգեցնում է ԴՆԹ-ի մոլեկուլի վրա, որը կոչվում է կպչուն ծայրեր: Այս ֆերմենտը հայտնաբերված է պրոկարիոտ օրգանիզմներում, ինչպիսիք են բակտերիաները: Բակտերիաներն օգտագործում են այս ֆերմենտը որպես պաշտպանական մեխանիզմ այնպիսի վիրուսների դեմ, ինչպիսիք են բակտերիոֆագները:
Նկար 02. Հինդի III
Կառուցվածքային առումով HindIII-ը հոմոդիմեր է: Այն պարունակում է ընդհանուր կառուցվածքային միջուկ, որը բաղկացած է չորս β թերթերից և մեկ α պարույրներից, ինչպես II սահմանափակող ֆերմենտների այլ տեսակներ: Այս ֆերմենտի մոլեկուլային զանգվածը 34,9 կԴա է։ Ավելին, HindIII-ը շատ օգտակար է ժամանակակից մոլեկուլային կենսաբանական գիտափորձերում, ինչպիսիք են ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը և քարտեզագրումը:
Որո՞նք են նմանությունները EcoRI-ի և HindIII սահմանափակող ֆերմենտների միջև:
- EcoRI և HindIII երկու սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք պատկանում են II տիպի սահմանափակող ֆերմենտների խմբին:
- EcoRI-ն և HindIII-ը հայտնաբերվել են 1970-ականների սկզբին:
- EcoRI և HindIII երկուսն էլ պարունակում են PD.. D/EXK ամինաթթուների հաջորդականության մոտիվը:
- Երկու սահմանափակող ֆերմենտներն էլ կատարում են ԴՆԹ-ի շատ հատուկ տրոհում:
- Այս սահմանափակող ֆերմենտներին անհրաժեշտ է Mg2+ որպես կոֆակտոր իրենց հատուկ գործունեության համար:
- ԴՆԹ-ն կտրելուց հետո դրանք կպչուն ծայրեր են առաջացնում։
- Դրանք շատ օգտակար բաղադրիչներ են ժամանակակից մոլեկուլային կենսաբանական հետազոտություններում:
Ո՞րն է տարբերությունը EcoRI-ի և HindIII սահմանափակող ֆերմենտների միջև:
EcoRI-ն II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է E.coli տեսակներից, մինչդեռ HindIII-ը II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է Haemophilus influenza տեսակներից: Այսպիսով, սա EcoRI-ի և HindIII-ի հիմնական տարբերությունն է:Ավելին, EcoRI-ն կտրում է ԴՆԹ-ն հատուկ ճանաչման G↓AATTC հաջորդականությամբ, մինչդեռ HindIII-ը կտրում է ԴՆԹ-ն հատուկ ճանաչման A↓ACCTT հաջորդականությամբ:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ներկայացնում է EcoRI-ի և HindIII-ի տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – EcoRI vs HindIII սահմանափակող ֆերմենտներ
EcoRI-ն և HindIII-ը երկու սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք պատկանում են II տիպի p ենթադասին: Նրանք կատարում են ԴՆԹ-ի շատ կոնկրետ ճեղքում: EcoRI-ն II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է E.coli տեսակներից, մինչդեռ HindIII-ը II տիպի սահմանափակող ֆերմենտ է, որը մեկուսացված է Haemophilus influenza տեսակներից: Այսպիսով, սա ամփոփում է EcoRI-ի և HindIII-ի միջև եղած տարբերությունը:
