NGS-ի և WGS-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS) զանգվածաբար զուգահեռ երկրորդ սերնդի հաջորդականության տեխնոլոգիա է, որն ունի բարձր թողունակություն, էժան և արագ, մինչդեռ ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը (WGS) Բջջի ամբողջ գենոմային ԴՆԹ-ի վերլուծության համապարփակ մեթոդ մեկ ժամանակում՝ օգտագործելով հաջորդականության մեթոդներ, ինչպիսիք են Sanger հաջորդականությունը, որսորդական հրացանի մոտեցումը կամ բարձր թողունակության NGS հաջորդականությունը:
Վերջին մի քանի տասնամյակների ընթացքում մարդկանց և այլ կենդանիների գենոմի ըմբռնումը զանգվածաբար աճել է արագ հաջորդականության տեխնիկայի և բիոինֆորմատիկայի գործիքների հայտնաբերման շնորհիվ: Սովորական հաջորդականության տեխնիկան, ինչպիսին է Sanger-ի հաջորդականությունը, ունեին իրենց սահմանափակումները, որոնք պահանջում էին արագ հաջորդականության նոր մեթոդների մշակում, ինչպիսիք են հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS) և նանոպորների հաջորդականությունը:Ամբողջ գենոմի հաջորդականության (WGS) տեխնիկան վերջին մոտեցումն է, որն արդեն օգտագործվում է բազմաթիվ գենոմային հետազոտական նախագծերում, ինչպիսիք են Genomic Անգլիայի, Մեծ Բրիտանիայի 100,000 գենոմային նախագիծը: Այսպիսով, NGS-ը և WGS-ը հաջորդականության երկու մեթոդ են, որոնք ներկայումս ներառված են բազմաթիվ գենոմային նախագծերում:
Ի՞նչ է NGS-ը:
NGS-ը (հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը) զանգվածային զուգահեռ երկրորդ սերնդի հաջորդականության տեխնոլոգիա է, որն ունի բարձր թողունակություն, ցածր գնով և արագ: Հաջորդ սերնդի հաջորդականության հստակ սահմանում չկա: Բայց մենք կարող ենք հստակ տարբերակել այն սովորական մազանոթների վրա հիմնված հաջորդականության տեխնիկայից: Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը թույլ է տալիս 1 միլիոն բազային զույգից մեծ ընդհանուր չափով ԴՆԹ մոլեկուլի հաջորդականությունը մեկ փորձի ընթացքում: Այն առաջարկում է աննախադեպ արագություն և բարձր թողունակության տարբերակներ, ինչպիսիք են մի քանի անհատների ԴՆԹ-ի միևնույն ժամանակ հաջորդականությունը թույլ տալը: Սա ձեռք է բերվում առանձին հաջորդականության ռեակցիաների ծավալը փոքրացնելու միջոցով: Ավելին, սա նաև սահմանափակում է գործիքների չափերը և նվազագույնի է հասցնում ռեակտիվների արժեքը մեկ ռեակցիայի համար:
Նկար 01. NGS հարթակներ
NGS-ը կարճ ընթերցման հաջորդականության մեթոդ է, որն արդեն հեղափոխել է կենսաբանական հետազոտությունների դաշտը: Ավելին, NGS-ը կիրառվում է տարբեր ոլորտներում, ինչպիսիք են de novo գենոմի հաջորդականությունը, ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը, տրանսկրիպտոմի անալիզը, փոքր ՌՆԹ-ի և միկրոՌՆԹ-ի հաջորդականությունը, նպատակային վերահաշվարկը և ամբողջ էքսոմի հաջորդականությունը::
Ի՞նչ է WGS-ը:
WGS (ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը) բջիջի ամբողջ գենոմային ԴՆԹ-ի վերլուծության համապարփակ մեթոդ է մեկ ժամանակում՝ օգտագործելով հաջորդականության մեթոդներ, ինչպիսիք են Sanger-ի հաջորդականությունը, որսորդական հրացանի մոտեցումը կամ բարձր թողունակության NGS հաջորդականությունը: Այն նաև հայտնի է որպես ամբողջական գենոմի հաջորդականություն կամ ամբողջական գենոմի հաջորդականություն: Ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը ենթադրում է օրգանիզմի ամբողջ քրոմոսոմային ԴՆԹ-ի, ինչպես նաև միտոքոնդրիումներում գտնվող ԴՆԹ-ի, իսկ բույսերի համար՝ քլորոպլաստում գտնվող ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը մեկ անգամ:WGS-ը գիտնականներին հնարավորություն է տալիս կարդալ ԴՆԹ-ի ամբողջական փաթեթը կազմող բոլոր տառերի ճշգրիտ հաջորդականությունը: Ակնկալվում է, որ WGS-ն, օգտագործելով NGS հարթակը, կհեղափոխի կլինիկական կարգավորումը:
Նկար 02. WGS ընդդեմ հիերարխիկ որսորդական հրացանի հաջորդականության
Ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը ներկայացվել է կլինիկական խնամքին 2014 թվականին: Ավելին, WGS-ի կիրառումը ներառում է գեների հաջորդականություն SNP մակարդակում՝ ասոցիացիայի ուսումնասիրություններում ֆունկցիոնալ տարբերակները, անհատականացված բժշկության, էվոլյուցիոն կենսաբանության, համեմատական գենոմի վերլուծության մեջ ֆունկցիոնալ տարբերակները մատնանշելու համար:, մուտացիաների և վերադասավորումների ուսումնասիրություններ, հազվագյուտ տարբերակների ասոցիացիայի ուսումնասիրություններ և հիվանդության նկատմամբ զգայունության և դեղերի արձագանքի կանխատեսում։
Որո՞նք են նմանությունները NGS-ի և WGS-ի միջև:
- NGS-ը և WGS-ը հաջորդականության երկու տեխնիկա են:
- Երկու տեխնիկան էլ հաջորդականացնում է ԴՆԹ-ն կամ ՌՆԹ-ն:
- Այս տեխնիկան նոր և հուսալի է:
- Դրանք երկուսն էլ օգտագործվում են հիվանդությունների ախտորոշման և դեղերի հայտնաբերման համար:
Ո՞րն է տարբերությունը NGS-ի և WGS-ի միջև:
NGS-ը զանգվածաբար զուգահեռ երկրորդ սերնդի հաջորդականության տեխնոլոգիա է, որն ունի բարձր թողունակություն, ցածր գնով և արագ, մինչդեռ WGS-ը բջջի ամբողջ գենոմային ԴՆԹ-ի վերլուծության համապարփակ մեթոդ է մեկ ժամանակում՝ օգտագործելով հաջորդականության մեթոդները, ինչպիսիք են. ինչպես Sanger հաջորդականությունը, որսորդական հրացանի մոտեցումը կամ բարձր թողունակության NGS հաջորդականությունը: Այսպիսով, սա NGS-ի և WGS-ի հիմնական տարբերությունն է: Ավելին, NGS-ը բաղկացած է միայն երկրորդ սերնդի հաջորդականության մեթոդներից, մինչդեռ WGS-ը բաղկացած է առաջին, երկրորդ և երրորդ սերունդների հաջորդականացման մեթոդներից:
Հետևյալ աղյուսակը ներկայացնում է NGS-ի և WGS-ի միջև եղած տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – NGS vs WGS
Վերջին տասնամյակների ընթացքում տարբեր հաջորդականության տեխնիկաներ սովորաբար կիրառվում են ժամանակակից մոլեկուլային հետազոտություններում: Եվ նույնիսկ դրանք շատ հզոր գործիքներ են բազմաթիվ կլինիկական կիրառությունների համար: NGS-ը և WGS-ը հաջորդականության երկու մեթոդներ են, որոնք ներկայումս ներառված են բազմաթիվ գենոմային նախագծերում: NGS-ը երկրորդ սերնդի հաջորդականացման տեխնոլոգիա է, որն ունի բարձր թողունակություն, էժան և արագ: Մյուս կողմից, WGS-ը բջիջի ամբողջ գենոմային ԴՆԹ-ի կամ ամբողջական գենոմային ԴՆԹ-ի վերլուծության մեթոդ է մեկ ժամանակում՝ օգտագործելով հաջորդականության մեթոդներ, ինչպիսիք են Sanger-ի հաջորդականությունը, որսորդական հրացանի մոտեցումը կամ բարձր թողունակության NGS հաջորդականությունը: Այսպիսով, սա NGS-ի և WGS-ի միջև տարբերության ամփոփումն է:
