I խմբի և II խմբի ինտրոնների հիմնական տարբերությունն այն է, որ I խմբի ինտրոններում միացման ռեակցիան սկսվում է գուանոզինի կոֆակտորով, մինչդեռ II խմբի ինտրոններում միացման ռեակցիան սկսվում է ներքին ադենոզինով:
Pre-mRNA-ն առաջնային տառադարձումն է, որն ունի և՛ ինտրոններ, և՛ էկզոններ: Pre-mRNA-ն պետք է վերածվի mRNA-ի մինչև թարգմանությունը: ՌՆԹ-ի զուգավորումը կամ նախամՌՆԹ-ի միացումը նման հետտրանսկրիպցիոն մոդիֆիկացիաներից մեկն է: ՌՆԹ-ի միացման ժամանակ ինտրոնները հեռացվում են նախամՌՆԹ մոլեկուլից, իսկ էկզոնները միանում են իրար։ I և II խմբի ինտրոնները ինքնահոսվող ինտրոններ են: Նրանք բաժանվում են նախնական mRNA մոլեկուլից՝ առանց որևէ այլ ֆերմենտի օգնության:Հետևաբար, դրանք ՌՆԹ ֆերմենտներ կամ ռիբոզիմներ են, որոնք կատալիզացնում են իրենց զուգավորումը նախա-ՌՆԹ-ից: Ավելին, նրանք հնարավորություն ունեն գործելու որպես շարժական տարրեր։ Միացման ժամանակ տեղի են ունենում տրանս-էսթերիֆիկացման մի շարք ռեակցիաներ՝ ինտրոնը կտրելու և էկզոնները կապելու նպատակով։ Այս ռիբոզիմները առկա են բոլոր երեք տիրույթներում, ներառյալ բակտերիաները, արխեաները և էուկարիոտները:
Ի՞նչ են I խմբի ինտրոնները:
I խմբի ինտրոնները ինքնասպառվող ռիբոզիմների մի տեսակ են, որոնք հայտնաբերված են բակտերիաներում, բակտերիոֆագներում և էուկարիոտներում (օրգանական և միջուկային գենոմներ): Դրանք հայտնաբերված են էական գեներում։ Նրանք ի վիճակի են կատալիզացնել իրենց զուգավորումը նախնական mRNA մոլեկուլից: I խմբի ինտրոնները կարող են ունենալ մի քանի հարյուրից երեք հազար նուկլեոտիդ: Ավելին, դրանք օրգանիզմների միջև հաջորդականության փոքր նմանություն են ցուցաբերում:
Նկար 01. I խմբի ինտրոններ
Երկրորդական կառույցները խիստ պահպանված են չորս կարճ շրջաններում: Գոյություն ունեն զուգավորման երկու տրանսեսթերֆիկացման ռեակցիայի փուլ: I խմբի ինտրոնները սկսում են միացման մեխանիզմը գուանոզինի կոֆակտորի 3' հիդրոքսիլի նուկլեոֆիլ գրոհով 5P միացման տեղում:
Ի՞նչ են II խմբի ինտրոնները:
II խմբի ինտրոնները ինքնազատվող ինտրոնների տեսակ են, որոնք հայտնաբերված են բոլոր երեք տիրույթներին պատկանող օրգանիզմներում։ Դրանք ռիբոզիմներ են, որոնք կատալիզացնում են իրենց զուգավորման ռեակցիաները նախա-ՌՆԹ-ից: Դրանք հայտնաբերված են rRNA, tRNA և սպիտակուցը կոդավորող գեներում: Բայց դրանք չեն հայտնաբերվել միջուկային գենոմներում, ի տարբերություն I խմբի ինտրոնների։
Նկար 02. II խմբի ինտրոններ
II խմբի ինտրոնները կատալիզացնում են միացումը երկու տրանսէստերիֆիկացման քայլերի միջոցով, որոնք նման են I խմբի ինտրոններին:Այս ֆերմենտները սկսում են միաձուլման ռեակցիան 5' միացման հանգույցի վրա ճյուղային տեղամասի ադենոզինի 2' OH-ի նուկլեոֆիլ հարձակումով: Միացման ռեակցիաների ժամանակ II խմբի ինտրոնները կազմում են լարիատի նման կառուցվածք: Ավելին, ինտրոնի միացումը տեղի է ունենում GTP-ի բացակայության դեպքում:
Որո՞նք են նմանությունները I և II խմբի ինտրոնների միջև:
- I խմբի և II խմբի ինտրոնները ՌՆԹ-ի երկու տեսակի ֆերմենտներ են՝ ռիբոզիմներ, որոնք կատալիզացնում են իրենց զուգավորումը տարբեր մեխանիզմներով:
- Դրանք խոշոր ռիբոզիմներ են։
- Երկուսն էլ հայտնաբերվել են բոլոր երեք տիրույթներում:
- Դրանք շարժական տարրեր են։
- Ավելին, դրանք հայտնաբերվել են rRNA, tRNA և սպիտակուցը կոդավորող գեներում:
- Երկու ֆերմենտներն էլ օգտագործվում են որպես գործիք կենսատեխնոլոգիայի և մոլեկուլային բժշկության մեջ՝ նպատակային գեների նոկաուտի/թոկման, գեների փոխանցման կամ գենային թերապիայի համակարգերի համար:
Ո՞րն է տարբերությունը I խմբի և II խմբի ինտրոնների միջև:
I խմբի ինտրոնները ռիբոզիմներ են, որոնք հայտնաբերված են բակտերիաներում, բակտերիոֆագներում և էուկարիոտիկ օրգանական և միջուկային գենոմներում: II խմբի ինտրոնները ռիբոզիմներ են, որոնք հայտնաբերված են բակտերիաներում, արխեաներում և էուկարիոտիկ օրգանելներում։ Ավելին, I խմբի ինտրոնները սկսում են միաձուլման ռեակցիա՝ գուանոզին կոֆակտորի 3' հիդրոքսիլի նուկլեոֆիլային հարձակման միջոցով 5P միացման վայրում, մինչդեռ II խմբի ինտրոնները սկսում են միացման ռեակցիա՝ ադենոզինի ճյուղային տեղամասի 2' OH-ի նուկլեոֆիլ գրոհով: 5′ միաձուլման հանգույց. Այսպիսով, սա է I խմբի և II խմբի ինտրոնների հիմնական տարբերությունը:
Ավելին, II խմբի ինտրոնները միացման ժամանակ կազմում են լարիատի նման կառուցվածք, մինչդեռ I խմբի ինտրոնները չեն ձևավորվում: Այսպիսով, սա ևս մեկ էական տարբերություն է I խմբի և II խմբի ինտրոնների միջև: Բացի այդ, I խմբի ինտրոնները հայտնաբերվել են էուկարիոտների միջուկային գենոմներում, մինչդեռ II խմբի ինտրոնները չեն հայտնաբերվել էուկարիոտների միջուկային գենոմներում:
Ստորև ինֆոգրաֆիկայում թվարկված են I և II խմբի ինտրոնների տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – I խումբ ընդդեմ II խմբի Ինտրոններ
I և II խմբի ինտրոնները մեծ ռիբոզիմներ են, որոնք կատալիզացնում են տրանսէստերիֆիկացման ռեակցիա՝ առաջնային տառադարձումից ինտրոնները դուրս հանելու համար: Դրանք հանդիպում են բոլոր երեք տիրույթներում։ Նրանք երկուսն էլ շարժական գենետիկ տարրեր են: Ավելին, դրանք օգտագործվում են որպես գործիք կենսատեխնոլոգիայի և մոլեկուլային բժշկության մեջ։ Այնուամենայնիվ, I խմբի ինտրոնները սկսում են միաձուլման ռեակցիան գուանոզինային կոֆակտորի 3' OH-ի նուկլեոֆիլային հարձակման միջոցով 5P միացման տեղում: Սակայն II խմբի ինտրոնները սկսում են միաձուլման ռեակցիան 5' միացման հանգույցի վրա ճյուղային տեղամասի ադենոզինի 2' OH-ի նուկլեոֆիլ գրոհով: Ավելին, II խմբի ինտրոնները միացման ժամանակ կազմում են լարային նման կառուցվածք, մինչդեռ I խմբի ինտրոնները չեն կազմում լարիատի նման կառուցվածք:Այսպիսով, սա I խմբի և II խմբի ինտրոնների միջև եղած տարբերության ամփոփումն է։