CDS-ի և ORF-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ CDS-ն այն գենի իրական նուկլեոտիդային հաջորդականությունն է, որը վերածվում է սպիտակուցի, մինչդեռ ORF-ը ԴՆԹ-ի հաջորդականության մի հատված է, որը սկսվում է թարգմանության մեկնարկի վայրից (սկիզբային կոդոն) և ավարտվում է թարգմանության դադարեցման կայք (դադարի կոդոն):
Գենն ունի կոդավորման հաջորդականություն (CDS): Այն բաղկացած է գենի ընդհանուր էկզոններից և մեկնարկային կոդոնից և ստոպ կոդոնից։ Դա գենի իրական մասն է, որը թարգմանում և արտադրում է սպիտակուցը: Բաց ընթերցման շրջանակը կամ ORF-ը նուկլեոտիդային հաջորդականություն է, որը գտնվում է մեկնարկային կոդոնի և կանգառի կոդոնի միջև: ORF-ի ներսում չկա կանգառի կոդոն, որն ընդհատում է գենետիկ կոդը, որը վերածվում է սպիտակուցի:Պրոկարիոտների մոտ գենի CDS-ը և ORF-ը նույնն են:
Ի՞նչ է CDS-ը:
CDS կամ կոդավորման հաջորդականությունը գենի այն մասն է, որն իրականում վերածվում է սպիտակուցի: Այն բաղկացած է էկզոններից և երկու կոդոններից, որոնք հայտնի են որպես AUG կոդոն և ստոպ կոդոն: CDS-ը չի պարունակում երկու Untranslated շրջաններ՝ 5' UTR և 3 UTR: Ավելին, ինտրոնները ներառված չեն CDS-ում:
Նկար 01. Կոդավորման հաջորդականություն
Երբ համեմատվում է անհատի ամբողջ գենոմի հետ, կոդավորող հաջորդականությունները փոքր մասն են կազմում: Կոդավորող հաջորդականությունը բաղկացած է սպիտակուցի ամինաթթուների հաջորդականությունը կազմելու համար անհրաժեշտ նուկլեոտիդային հաջորդականությունից: Հետևաբար, CDS-ները կենտրոնացված էկզոններ են, որոնք կարելի է բաժանել նուկլեոտիդային եռյակների կամ կոդոնների: Կոդոնները առաջացնում են ամինաթթուներ։
Ի՞նչ է ORF-ը:
Բաց ընթերցման շրջանակը կամ ORF-ը նուկլեոտիդային հաջորդականության շարունակական ձգումն է, որը սկսվում է մեկնարկային կոդոնով և ավարտվում վերջնակետով:Պարզ բառերով, ORF-ը վերաբերում է նուկլեոտիդային հաջորդականության շրջանին, որը գտնվում է սկզբնական և վերջակետ կոդոնների միջև: Միջանկյալում չկա կանգառի կոդոն, որն ընդհատում է ORF-ը: Նուկլեոտիդային հաջորդականությունը մեկնարկային և վերջակետ կոդոնների միջև կոդավորում է ամինաթթուները: Ընդհանուր առմամբ, մեկնարկային կոդոնը ATG է, մինչդեռ կանգառի կոդոններն են TAG, TAA և TGA: ORF-ը տալիս է ֆունկցիոնալ սպիտակուց, երբ արտագրվում և թարգմանվում է: Հետևաբար, ORF-ն ներառում է մեկնարկային կոդոն, մի քանի կոդոններ միջին շրջանում և կանգառ կոդոն: Հետաքրքիր է, որ ORF-ն ունի երկարություն, որը կարելի է բաժանել երեքի:
Նկար 02. Բաց ընթերցման շրջանակ
Պրոկարիոտներում, քանի որ ինտրոններ չկան, ORF-ը գենի կոդավորող հաջորդականությունն է, որն ուղղակիորեն տրանսկրիպվում է mRNA-ի: Հետևաբար, CDS-ն և PRF-ը նույնն են պրոկարիոտների մոտ: Պրոկարիոտների մեջ գեներ փնտրելիս հեշտ է հայտնաբերել ORF-ը և գտնել գեն պրոկարիոտների մեջ:Էուկարիոտներում, քանի որ կան ինտրոններ, ORF-ը կոդոնների հաջորդականությունն է, որը ձևավորվում է մշակումից կամ ՌՆԹ-ի միացումից հետո։ ORF-ը ապացույց է, որն օգնում է գենի կանխատեսմանը, քանի դեռ ORF-ը հավանաբար գենի մի մասն է:
Որո՞նք են նմանությունները CDS-ի և ORF-ի միջև:
- Պրոկարիոտներում CDS-ը և ORF-ը նույնն են:
- Երկուսն էլ ունեն մեկնարկային կոդոն և վերջակետ:
- Նրանք ունեն մի շարք նուկլեոտիդներ, որոնք կարելի է բաժանել երեքի:
- Երբ նրանք թարգմանում են, նրանք արտադրում են ամինաթթուների հաջորդականություններ:
Ո՞րն է տարբերությունը CDS-ի և ORF-ի միջև:
CDS-ը գենի իրական մասն է, որը վերածվում է սպիտակուցի, մինչդեռ ORF-ը ԴՆԹ-ի հատվածն է մեկնարկային կոդոնի և կանգառի կոդոնի միջև: Այսպիսով, սա CDS-ի և ORF-ի հիմնական տարբերությունն է: Ավելին, CDS-ը չի պարունակում ինտրոններ, բայց ORF-ը կարող է պարունակել ինտրոններ: CDS-ն ամբողջությամբ տառադարձվում է ամբողջական mRNA հաջորդականության, մինչդեռ ORF-ը կարող է լինել mRNA հաջորդականության մաս:Այսպիսով, սա ևս մեկ տարբերություն է CDS-ի և ORF-ի միջև:
Ներքևում ինֆոգրաֆիական աղյուսակները կողք կողքի ցույց են տալիս CDS-ի և ORF-ի միջև եղած տարբերությունները:
Ամփոփում – CDS ընդդեմ ORF
CDS-ը և ORF-ը գենի երկու կարևոր մասերն են: CDS-ն վերաբերում է ԴՆԹ-ի իրական հատվածին, որը վերածվում է սպիտակուցի: ORF-ը ԴՆԹ-ի հաջորդականություն է, որը սկսվում է «ATG» մեկնարկային կոդոնով և ավարտվում երեք վերջնացիոն կոդոններից որևէ մեկով (TAA, TAG կամ TGA): ORF-ը կարող է լինել գենի ամբողջական mRNA-ի մի մասը: Այնուամենայնիվ, գենի կոդավորող հաջորդականությունը տառադարձվում է mRNA-ի ամբողջական հաջորդականությանը: Բոլոր CDS-ները ORF են: Բայց ոչ բոլոր ORF-ներն են CDS: Այսպիսով, սա ամփոփում է CDS-ի և ORF-ի միջև եղած տարբերությունը:
