Բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման հիմնական տարբերությունն այն է, որ բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման ժամանակ անհրաժեշտ է կոտրել բջջային պատը չոր սառույցի կամ հեղուկ ազոտի մեջ հյուսվածքը մանրացնելով, որպեսզի բջջային պարունակությունը ազատվի կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման ժամանակ:, անհրաժեշտ չէ իրականացնել այս քայլը, քանի որ կենդանական բջիջները չունեն բջջային պատ։
Գենոմային ԴՆԹ-ն բուսական և կենդանական բջիջների գենետիկ նյութն է: Գենոմային ԴՆԹ-ն եզակի է յուրաքանչյուր բույսի կամ կենդանու համար: Լավ որակի ԴՆԹ-ի արդյունահանումը մոլեկուլային հետազոտության նախապայմանն է: Օրգանիզմների ԴՆԹ-ն արդյունահանվում է նույնականացման, հիվանդությունների ախտորոշման, հատուկ գեների և հաջորդականությունների հայտնաբերման, դատաբժշկական նպատակների, հայրության թեստավորման, գենոմի հաջորդականության և դեղերի մշակման համար և այլն:ԴՆԹ-ի արդյունահանման մեթոդը տատանվում է՝ կախված բջիջների տեսակից՝ դա կենդանական բջիջ է, թե բուսական:
Ի՞նչ է բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանումը:
Բուսական բջիջներում ԴՆԹ-ն արդյունահանվում է տարբեր մոլեկուլային հետազոտությունների համար: Այն պահանջվում է անձեռնմխելի, մաքուր գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանման համար: Հետևաբար, կան ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրությունների տարբեր տեսակներ, որոնք տարբերվում են կենդանիների բջիջներից ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրություններից: Դա պայմանավորված է նրանով, որ բույսերի բջիջները ունեն բջջային պատ, որը պետք է կոտրվի, որպեսզի դուրս հանվի բջջային պարունակությունը:
Արդյունահանումը սովորաբար կատարվում է բույսի հյուսվածքները չոր սառույցի կամ հեղուկ ազոտի մեջ մանրացնելով, օգտագործելով հավանգ և մուրճ: Այնուհետև բջջային մեմբրանները խաթարվում են, և բջջային պարունակությունը դուրս է բերվում արդյունահանման բուֆերի մեջ: Սա սովորաբար արվում է լվացող միջոցի միջոցով. SDS (նատրիումի դոդեցիլ սուլֆատ) կամ CTAB (ցետիլտրիմեթիլամոնիումի բրոմիդ) բուֆեր։ Ազատված ԴՆԹ-ն պաշտպանված է էնդոգեն նուկլեազներից՝ օգտագործելով քելատացնող նյութ, ինչպիսին է EDTA-ն: Ավելին, սպիտակուցներն առանձնացվում են ԴՆԹ-ից՝ օգտագործելով քլորոֆորմ կամ ֆենոլ։
Նկար 01. Բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանում
Բույսերը սինթեզում են պոլիսախարիդներ և պոլիֆենոլներ, ներառյալ ֆլավոնոիդներ և այլ երկրորդական մետաբոլիտներ: Այս միացությունները խանգարում են մաքուր գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանմանը: Հետևաբար, բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրությունների մեծ մասը ներառում է մեկ այլ քայլ, ինչպիսին է ցեզիումի քլորիդի խտության գրադիենտ տեխնիկան՝ վերացնելու այս միացությունները:
ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրությունների մեծ մասը խորհուրդ է տալիս օգտագործել թարմ տերևների նմուշներ ԴՆԹ-ի արդյունահանման համար: Որոշ մեթոդներ չեն ներառում վտանգավոր քիմիական նյութեր, ինչպիսիք են հեղուկ ազոտը և ֆենոլը: CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) արձանագրությունը բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման հայտնի արձանագրություն է, որը հեշտացնում է բարձրորակ բույսերի գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանումը: Դա պարզ, անվտանգ, հուսալի և ծախսարդյունավետ մեթոդ է բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման համար:Մյուս մեթոդների մեծ մասը CTAB մեթոդի փոփոխված տարբերակներն են:
Ի՞նչ է կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանումը:
Կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանումը կենդանիների բջիջներից գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանումն է մոլեկուլային անալիզի համար: Ի տարբերություն բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման, բջջային պատի քայքայումը կենդանական բջիջների համար անհրաժեշտ չէ, քանի որ նրանք չունեն բջջային պատ: Արյան բջիջները կենդանական բջիջների ամենատարածված տեսակն են, որոնք օգտագործվում են տարբեր նպատակներով:
Նկար 02. ԴՆԹ-ի արդյունահանում
Ֆենոլ-քլորոֆորմ մեթոդը արյան բջիջների համար լավագույն տարբերակներից մեկն է: ԴՆԹ-ի բերքատվությունը և որակը բարձր են այս մեթոդից ԴՆԹ-ի արդյունահանման ժամանակ: Այն հեղուկ-հեղուկ ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրություն է, և այս մեթոդը ԴՆԹ-ի մոլեկուլները բաժանում է չխառնվող լուծույթներում նրանց լուծելիության հիման վրա:Ֆենոլը, քլորոֆորմը և իզոամիլ սպիրտն այս մեթոդի առաջին երեք բաղադրիչներն են։
Որո՞նք են նմանությունները բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման միջև:
- Եվ բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման ժամանակ բջջային թաղանթները պետք է խաթարվեն:
- ԴՆԹ-ն պետք է պաշտպանված լինի էնդոգեն նուկլեազներից:
- Ավելին, պետք է կանխել ԴՆԹ-ի կտրումը։
- Առևտրային փաթեթները հասանելի են բույսերի ԴՆԹ-ի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման համար:
- Բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման մեթոդների մեծ մասը կարիք ունի շարունակական փոփոխության և ստանդարտացման:
Ո՞րն է տարբերությունը բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման միջև:
Բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման հիմնական տարբերությունն այն է, որ բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանումը պահանջում է բույսերի հյուսվածքի մանրացումը չոր սառույցի կամ հեղուկ ազոտի մեջ, որպեսզի կոտրվի բջջային պատը, մինչդեռ կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանումը չի պահանջում այս քայլը, քանի որ նրանք կենդանի են: բջիջները չունեն բջջային պատ. CTAB մեթոդը բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման լավագույն մեթոդներից մեկն է, մինչդեռ ֆենոլ-քլորոֆորմ մեթոդը կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման լավագույն մեթոդներից մեկն է:
Ստորև ինֆոգրաֆիկայում ներկայացված են բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման տարբերությունները:
Ամփոփում – Բույսերի ընդդեմ կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանում
Հասանելի են տարբեր բջիջների տեսակներից ԴՆԹ-ի արդյունահանման տարբեր մեթոդներ: Հետևաբար, բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրությունները տարբերվում են կենդանական բջիջների ԴՆԹ-ի արդյունահանման արձանագրություններից: Բույսերի ԴՆԹ-ի արդյունահանումը պահանջում է բջջային պատի, բջջային թաղանթի և միջուկային թաղանթի խախտում, մինչդեռ կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանումը պահանջում է բջջային թաղանթի և միջուկային մեմբրանի քայքայումը: Ավելի կարևոր է, որ կենդանական բջիջների ԴՆԹ-ի արդյունահանումը չի պահանջում բջիջների պատերի խախտում չոր սառույցի կամ հեղուկ ազոտի մեջ մանրացնելու միջոցով:Այսպիսով, սա է հիմնական տարբերությունը բույսերի և կենդանիների ԴՆԹ-ի արդյունահանման միջև:
