QTL-ի և GWAS-ի հիմնական տարբերությունը հիմնված է վերլուծության մեջ օգտագործվող հաջորդականությունների տեսակի վրա: QTL-ն օգտագործում է կապող գենային տեղաբաշխումներ՝ վերլուծելու ֆենոտիպային հատկությունները, որոնք կապված են պոլիգենային ժառանգության հետ, մինչդեռ GWAS-ն օգտագործում է ամբողջ գենոմի հաջորդականությունները՝ որոշակի վիճակի մեկ նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմները վերլուծելու համար:
QTL քարտեզները և GWAS-ը կարևոր դեր են խաղում տարբեր հատկությունների գենետիկական վերլուծության մեջ: Ավելին, դրանք կարևոր են անհայտ էթոլոգիայի տարբեր հիվանդությունների պայմանների վերլուծության համար: Բացի այդ, հաջորդականությունը առանցքային դեր է խաղում երկու տեխնիկայում: Այս տեխնիկան կարող է հետագայում զուգակցվել բարձր թողունակության այլ տեխնիկայի հետ՝ բարձր ճշգրտության և ճշգրտության համար:
Ինչ է QTL?
QTL նշանակում է քանակական հատկանիշի տեղանք: Դա ԴՆԹ-ի մի հատված է, որը կապված է ֆենոտիպային հատկանիշի հետ: Ընդհանուր առմամբ, QTL-ն առաջացնում է պոլիգենային էֆեկտներ: QTL-ների բաշխումը տարբերվում է, և QTL-ների թիվը հուշում է որոշակի ֆենոտիպային հատկանիշի տատանումների աստիճանը: Ավելին, դրանք սովորաբար կոդավորում են հիմքում ընկած շարունակական հատկանիշները և ոչ թե առանձին գծերը:
QTL շրջանների նույնականացումից հետո կարևոր է որոշակի QTL տարածքի հաջորդականությունը: Ավելին, հետազոտություններն ու հետազոտությունները հեշտացնելու համար ընդհանուր QTL շրջանների հաջորդականության տվյալների հաջորդականությունը և պահպանումը կատարվում է կենսաինֆորմատիկայի ներգրավմամբ: Մենք այս տեխնիկան անվանում ենք QTL քարտեզագրում: Հետագայում տվյալների բազա է ստեղծվում QTL տարածաշրջանի հաջորդականությամբ:
Նկար 01. QTL սկան
Ավելին, QTL հաջորդականությունների կիրառությունները հիմնականում հիմնված են BLAST գործիքի վրա, որտեղ կարելի է որոշել հաջորդականության նմանությունը: Այն կարևոր է օրգանիզմների միջև փոխհարաբերությունները պարզելու համար: Ավելին, այն կարևոր է որոշակի պոլիգեն ֆենոտիպի բարդությունը որոշելու համար: Այն նաև որոշում է որոշակի հատկանիշի էվոլյուցիան:
Ներկայումս QTL վերլուծությունը համակցված է բարձր թողունակության այլ մեթոդների հետ, ինչպիսիք են ԴՆԹ միկրոզանգվածները: Սա կարևոր է ֆենոտիպի արտահայտչական վերլուծության մեջ: Ներկայումս գիտնականները շատ են հետաքրքրված QTL տվյալների բազայի մշակմամբ, քանի որ QTL շրջանները պատասխանատու են տարբեր տեսակների շատ կարևոր հատկությունների համար:
Ի՞նչ է GWAS-ը:
GWAS-ը նշանակում է Genome Wide Association Study: Այն նաև վերաբերում է ամբողջ գենոմի ասոցիացիայի ուսումնասիրություններին: Այս ուսումնասիրությունները հիմնականում կենտրոնանում են դիտողական ուսումնասիրությունների վրա: Այն վերլուծում է տարբեր անհատների գենետիկական տարբերակները, որոնք սովորաբար կապված են որոշակի հատկանիշի հետ: Ավելին, ամբողջ գենոմը կարևոր է GWAS վերլուծության համար:
Նկար 02. GWAS
GWAS-ը կարևոր գործիք է տարբեր հիվանդությունների հետ կապված մեկ նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմների վերլուծության համար: Սա նաև համեմատական ուսումնասիրություն է տարբեր մեկ նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմների լայն պոպուլյացիայի մեջ: Բացի այդ, GWAS-ի ուսումնասիրության նմուշը շատ բարձր է. հետևաբար, այն նաև վերցնում է խաչաձև կոհորտային ուսումնասիրության ձևաչափ:
Ավելին, առաջին GWAS հետազոտությունը տեղի ունեցավ սրտամկանի ինֆարկտի վերաբերյալ և վերլուծեց սրտամկանի ինֆարկտի հետ կապված գեները: Ներկայումս GWAS-ը կարևոր դեր է խաղում անհայտ էթոլոգիայով բարդ հիվանդությունների գենետիկական ֆոնի որոշման գործում:
Որո՞նք են նմանությունները QTL-ի և GWAS-ի միջև:
- Անալիզի համար նրանք հիմնվում են ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների տվյալների վրա:
- Երկուսն էլ կապված են տարբեր կերպարների գենետիկական ծագման հետ:
- Ավելին, արդյունքները եզրակացնելու և մեկնաբանելու համար նրանք պահանջում են կենսաինֆորմատիկայի գործիքներ:
- Դրանք արվում են մեծ պոպուլյացիաների վրա:
Ո՞րն է տարբերությունը QTL-ի և GWAS-ի միջև:
QTL-ն վերլուծում է պոլիգենային ժառանգության հետ կապված ֆենոտիպային գծերը՝ օգտագործելով կապակցված գենային տեղաբաշխումները, մինչդեռ GWAS-ը վերլուծում է որոշակի վիճակի մեկ նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմները՝ օգտագործելով ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը: Այսպիսով, սա QTL-ի և GWAS-ի հիմնական տարբերությունն է: QTL քարտեզագրումը համեմատաբար ավելի քիչ բարդ տեխնիկա է, քան GWAS-ը, քանի որ այն պահանջում է ամբողջ գենոմի հաջորդականություն:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ամփոփում է QTL-ի և GWAS-ի տարբերությունը աղյուսակային տեսքով:
Ամփոփում – QTL ընդդեմ GWAS
QTL քարտեզագրումը և GWAS-ը մեծ դեր են խաղում տարբեր ֆենոտիպային հատկությունների գենետիկական ֆոնի որոշման գործում: Նրանք նաև օգնում են վերլուծել տարբեր հիվանդությունների գենետիկական ֆոնը։ QTL քարտեզագրումը քարտեզագրում է կապի գեները, որոնք պատասխանատու են շարունակական հատկանիշների համար, ինչպես նաև ներառում է բազմածին ժառանգական գեների քարտեզագրում: GWAS-ը, մյուս կողմից, տեղի է ունենում ամբողջ գենոմի վերլուծությամբ մեկ նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմների համար: Բացի այդ, դա տեղի է ունենում ավելի մեծ բնակչության շրջանում: Այսպիսով, սա QTL-ի և GWAS-ի միջև եղած տարբերության ամփոփումն է։
