Գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման հիմնական տարբերությունն այն է, որ գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացումն ուղղված է գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանմանը, մինչդեռ պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը ուղղված է բակտերիաների պլազմիդային ԴՆԹ-ի արդյունահանմանը::
ԴՆԹ-ի մեկուսացումը քիմիական գործընթաց է, որն օգտագործվում է տարբեր տեսակներից կամ տարբեր նմուշներից ԴՆԹ-ի մեկուսացման համար: ԴՆԹ-ի մեկուսացումը կարևոր է մոլեկուլային կենսաբանության ներքևի տեխնոլոգիաներում, ինչպիսիք են գելային էլեկտրոֆորեզը, պոլիմերազային շղթայական ռեակցիան և ԴՆԹ-ի հաջորդականության տեխնիկան: Հետևաբար, ԴՆԹ-ի մեկուսացումը կարևոր քիմիական գործընթաց է մոլեկուլային կենսաբանական հետազոտություններում: Ելնելով հետազոտության նպատակից՝ երբեմն անհրաժեշտ է լինում առանձնացնել գենոմային ԴՆԹ։Բացի այդ, որոշ ուսումնասիրություններ կենտրոնանում են բակտերիայից պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման վրա: Գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը պրոկարիոտ կամ էուկարիոտ նմուշից գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացման գործընթաց է: Մեկուսացման քայլերը տարբերվում են՝ կախված այն բջջի տեսակից, որում մեկուսացվում է ԴՆԹ-ն։ Պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը բակտերիալ բջիջից պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման գործընթացն է: Գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացման համեմատ, ընդհանուր գործընթացը բարդ է պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման մեջ:
Ի՞նչ է գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը:
Գենոմիկ ԴՆԹ-ի մեկուսացումը օրգանիզմի ամբողջական գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանման գործընթացն է: Այս կոնկրետ գործընթացը ներառում է երեք հիմնական իրադարձություն. Դրանք են՝ բջիջների լիզը կամ միջուկային լիզը, սպիտակուցի քայքայումը կամ պրոտեոլիզը և գենոմային ԴՆԹ-ի նստեցումը: Լիզի փուլը կարող է տարբերվել՝ կախված բջջի տեսակից: Պրոկարիոտների մոտ, քանի որ կա պեպտիդոգլիկան բջջային պատ, առաջին քայլը պետք է լինի բջջային պատի քայքայումը: Մյուս կողմից, էուկարիոտներում լիզի փուլը ներառում է պլազմային թաղանթի և միջուկային թաղանթի քայքայումը՝ ԴՆԹ-ն դեպի արտաքին դուրս հանելու համար:Ի հակադրություն, հատուկ քայլեր են անհրաժեշտ բույսերի և սնկային բջիջների պատերը լուծարելու համար:
Նկար 01. Գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացում
Հետևաբար, երբ լիզի փուլն ավարտվի, ի վերջո ԴՆԹ-ն կգա վերին նյութ: Միաժամանակ, լուծույթում տեղի է ունենում նաև սպիտակուցի դեգրադացիա՝ պրոտեինազ K-ի ավելացման շնորհիվ: Հաջորդ քայլը գենոմային ԴՆԹ-ի և քայքայված սպիտակուցների առանձնացումն է միմյանցից: Հետևաբար, քայքայված սպիտակուցներն առանձնանում են տեղումների միջոցով, ինչը թույլ է տալիս գենոմային ԴՆԹ-ին մնալ վերին նյութում: Սպիտակուցների նստեցումից հետո գենոմային ԴՆԹ-ն կարող է նստեցվել և նորից կասեցվել համապատասխան բուֆերի մեջ, մինչև այն պահանջվի փորձի համար:
Գենոմիկ ԴՆԹ-ն, որը գծային ԴՆԹ է, պարունակում է օրգանիզմի ողջ գենետիկական տեղեկատվությունը:Այլ կերպ ասած, գենոմը կենդանի օրգանիզմի ժառանգական նյութն է, որը պատասխանատու է բջջի բոլոր կառուցվածքային և ֆունկցիոնալ գործունեության համար: Այն բաղկացած է ինչպես կոդավորող, այնպես էլ ոչ կոդավորող ԴՆԹ-ի հաջորդականություններից: Գենոմային ԴՆԹ-ն մեկուսացնելիս այն ներառում է օրգանիզմի ողջ գենոմը։
Ի՞նչ է պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը:
Պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը ԴՆԹ-ի մեկուսացման հատուկ և ավելի բարդ գործընթաց է: Պլազմիդները արտաքրոմոսոմային ԴՆԹ են, որոնք առկա են բակտերիալ բջիջների մեծ մասում: Դրանք քնած շրջանաձև ԴՆԹ են, որն օգնում է բակտերիաներին գոյատևել շրջակա միջավայրի ծանր պայմաններում: Պլազմիդային ԴՆԹ-ն բաղկացած է հատուկ դիմացկուն գեներից, որոնք լրացուցիչ առավելություններ են տալիս բակտերիաներին, ինչպիսիք են հակաբիոտիկների դիմադրությունը, վիրուսային հատկությունները և թունավոր հատկությունները:
Նկար 02. Պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացում
Պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը ներառում է նաև երեք հիմնական գործընթաց. բջիջների լիզ, պրոտեինոլիզ և ԴՆԹ տեղումներ: Թեև մեկուսացման կենսաքիմիական մեխանիզմը նման է գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացման մեխանիզմին, գործընթացն ավելի բարդ է, քան դա: Բջիջների լիզի պրոցեսն այս պրոցեդուրաների ամենակարևոր գործընթացն է: Ամենակարևորը՝ գենոմային ԴՆԹ-ն և պլազմիդային ԴՆԹ-ն չպետք է խառնվեն միմյանց հետ։ Հետևաբար, շատ ավելի մեղմ լիզի գործընթացը ներառում է պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման ընթացակարգը: Հետևաբար, պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման ընթացակարգերի մեծ մասում օգտագործեք լվացող միջոց. նատրիումի դոդեցիլ սուլֆատ բջիջների լիզի համար:
Որո՞նք են նմանությունները գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման միջև:
- Գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը կենտրոնանում է օրգանիզմի ԴՆԹ-ի արդյունահանման վրա:
- Նաև, երկուսն էլ հետևում են նույն ընդհանուր գործընթացին, որը ներառում է բջիջների լիզը, սպիտակուցի քայքայումը և ԴՆԹ-ի տեղումները:
- Ավելին, երկու գործընթացների արդյունքում ստացված ԴՆԹ-ն կարևոր է ներքևի գործընթացների համար:
- Ավելին, մեկուսացման երկու գործընթացներն էլ ներառում են ԴՆԹ-ի մաքրման և պահպանման քայլերը հատուկ պահպանման պայմաններում:
- Բացի այդ, պրոտեինազ K-ն օգտագործվում է սպիտակուցների քայքայման երկու մեթոդներում էլ:
Ո՞րն է տարբերությունը գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման միջև:
Գենոմիկ ԴՆԹ-ի մեկուսացումը կենտրոնանում է թիրախային օրգանիզմի ողջ գենոմային ԴՆԹ-ի արդյունահանման վրա, մինչդեռ պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը կենտրոնանում է որոշակի բակտերիաների տեսակներից միայն պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման վրա: Հետևաբար, սա գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման հիմնական տարբերությունն է: Ավելին, գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման միջև մեկ այլ տարբերություն կա ընթացակարգի մեջ: Գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացումը ավելի քիչ բարդ ընթացակարգ է՝ համեմատած պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման հետ: Հետևաբար, պլազմիդային ԴՆԹ-ն մեկուսացնելիս անհրաժեշտ է նախազգուշական միջոցներ ձեռնարկել՝ կանխելու գենոմային և պլազմիդային ԴՆԹ-ի խառնումը միմյանց հետ:
Ստորև բերված ինֆոգրաոհիկը լրացուցիչ մանրամասներ է տալիս գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման տարբերության վերաբերյալ:
Ամփոփում – Գենոմային ԴՆԹ-ն ընդդեմ պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման
ԴՆԹ-ի մեկուսացումը կարևոր գործընթաց է մոլեկուլային կենսաբանության տեխնիկայում: Գոյություն ունի ԴՆԹ-ի երկու տեսակ՝ գենոմային ԴՆԹ և պլազմիդային ԴՆԹ (արտաքրոմոսոմային ԴՆԹ): Ելնելով պահանջից՝ որոշ ընթացակարգեր իրականացվում են գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացման համար, մինչդեռ որոշ ընթացակարգեր կենտրոնանում են բակտերիայից միայն պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման վրա: Հետևաբար, երկու գործընթացներում ներգրավված քայլերը մի փոքր տարբերվում են միմյանցից: Այնուամենայնիվ, ընդհանուր գործընթացը նույնն է երկու մեկուսացման մեջ: Երկու գործընթացների մեկուսացված ԴՆԹ-ն հսկայական կիրառություն ունի ներքևում գտնվող գործընթացներում, ինչպիսիք են կլոնավորումը, գելային էլեկտրոֆորեզը և պոլիմերազային շղթայական ռեակցիաները:Գենոմային ԴՆԹ-ի մեկուսացման արձանագրության վերջում օրգանիզմի ողջ գենոմային ԴՆԹ-ն կարող է մեկուսացվել որպես վերջնական արտադրանք, մինչդեռ պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման արձանագրության վերջում համապատասխան մանրէի պլազմիդային ԴՆԹ-ն կարող է մեկուսացվել որպես վերջնական արտադրանք: Հետևաբար, սա է տարբերությունը գենոմային ԴՆԹ-ի և պլազմիդային ԴՆԹ-ի մեկուսացման միջև։
