Հիմնական տարբերություն – Ֆյուզիոն ընդդեմ Taq պոլիմերազի
ԴՆԹ պոլիմերազները լայնորեն օգտագործվող ֆերմենտներ են մոլեկուլային կենսաբանության տեխնիկայում և բնականաբար առկա են նաև բոլոր օրգանիզմներում, որոնք ենթարկվում են ԴՆԹ-ի վերարտադրության: Դրանք հիմնական պոլիմերացնող ֆերմենտներն են, որոնք ներգրավված են վերարտադրության ժամանակ: ԴՆԹ պոլիմերազն ի վիճակի է նուկլեոտիդներ ավելացնել ԴՆԹ-ի շղթայի ազատ 3' ծայրին՝ դրանով իսկ առաջացնելով նոր շղթայի երկարացում: Ներկայումս հիվանդությունների ախտորոշման և արդյունաբերական կիրառության մեջ մոլեկուլային կենսաբանության զարգացումների շնորհիվ կարևոր է տարբեր օգտակար հատկություններ ունեցող պոլիմերազների արտադրությունը: Սա մեծացնում է մեթոդի ճշգրտությունը և դարձնում այն ավելի արագ տեխնիկա:Phusion-ը և Taq պոլիմերազը երկու կոմերցիոն արտադրված ջերմակայուն պոլիմերազային ֆերմենտներ են, որոնք օգտագործվում են հատուկ մոլեկուլային ծրագրերում: Phusion-ը Pyrococcus furiosus-ից մեկուսացված ԴՆԹ պոլիմերազ է և հիմնականում օգտագործվում է կլոնավորման փորձերում՝ հավատարմությունը բարձրացնելու համար: Taq ԴՆԹ պոլիմերազը ստանդարտ ԴՆԹ պոլիմերազն է, որն օգտագործվում է պոլիմերազային շղթայական ռեակցիայում (PCR), և այն մեկուսացված է ջերմակայուն բակտերիայից. Ջրային թերմուս. Երկու ֆերմենտների հիմնական տարբերությունը աղբյուրի միկրոօրգանիզմն է: Ֆյուզիոնը մեկուսացված է էքստրեմոֆիլից՝ Pyrococcus furiosus-ից, մինչդեռ Taq պոլիմերազը մեկուսացված է թերմոֆիլից՝ Thermus aquaticus-ից:
Ի՞նչ է Phusion-ը:
Phusion ԴՆԹ պոլիմերազը նոր պոլիմերազ է, որն արտադրվում է Pyrococcus furiosus ֆերմենտի մեկուսացման միջոցով, որը էքստրեմոֆիլ Archaea է: Այս մանրէները բնակվում են չափազանց բարձր ջերմաստիճանի պայմաններում՝ դրանով իսկ դարձնելով պոլիմերազը բարձր ջերմակայուն պոլիմերազ։ Ֆյուզիոն պոլիմերազը օգտագործվում է սովորական ջերմակայուն պոլիմերազի նկատմամբ ծայրահեղ հավատարմություն ստանալու համար. Taq պոլիմերազ. Ֆյուզիոն պոլիմերազը կարող է ուժեղացնել երկար կաղապարներ մինչև 7,5 կբ գենոմային ԴՆԹ: Phusion պոլիմերազի պոլիմերացման օպտիմալ հզորությունը 720 C է: Phusion-ը նաև օգտագործվում է կլոնավորման արտադրանքներում հաջորդականության, արտահայտման վերլուծության և մուտացիաների վերլուծության համար:
Ֆյուզիոն ԴՆԹ պոլիմերազն ունի 3'-5' էկզոնուկլեազային ակտիվություն: Սա թույլ է տալիս սրբագրել նոր սինթեզված շարանը սինթեզից հետո: Այսպիսով, նուկլեոտիդների անհամապատասխանությունները հեշտությամբ վերականգնվում են: Այսպիսով, այն ունի ավելի փոքր սխալի մակարդակ: Phusion պոլիմերազի ընդհանուր առավելություններն են՝
- Ծայրահեղ հավատարմություն
- Բարձր արագությամբ և կրճատված երկարաձգման ժամանակ
- Ուժեղ ռեակցիաներ և պահանջում է նվազագույն օպտիմալացում
- Բարձր եկամտաբերություն
Նկար 01. Ֆյուզիոն
Phusion պոլիմերազի հիմնական թերությունն այն է, որ այն արգելակվում է դեզօքսյուրիդին տրիֆոսֆատի (dUTP) առկայության դեպքում: Երբ dUTP-ները կուտակվում են ռեակցիայի խառնուրդում, այն կարող է արգելակել Phusion պոլիմերազի գործողությունները: Դա կանխվում է ռեակցիայի խառնուրդը dUTPase-ով մշակելով՝ նախքան ֆերմենտը ավելացնելը: Ներկայումս Phusion պոլիմերազի dUTP-դիմացկուն տարբերակը, որը հայտնի է որպես Pfu Turbo, օգտագործվում է Phusion պոլիմերազի փոխարեն՝ որպես այս խնդրի լուծում:
Ի՞նչ է Taq Polymerase?
Taq ԴՆԹ պոլիմերազի գյուտը հեղափոխություն է արել մոլեկուլային կենսաբանության ոլորտում: Այն լուծեց ԴՆԹ-ի ուժեղացման հիմնական խնդիր: Taq DNA պոլիմերազը ջերմակայուն պոլիմերազային ֆերմենտ է, որը արդյունահանվում և մեկուսացված է ջերմասեր բակտերիայից՝ Thermus aquaticus-ից: Այս ֆերմենտի հայտնաբերումը հանգեցնում է ՊՇՌ-ի զարգացմանը: Այս ֆերմենտը թույլ է տվել օգտագործել պոլիմերազային շղթայական ռեակցիա ԴՆԹ-ի ամպլիֆիկացման մեջ՝ սովորական կլոնավորման տեխնիկայի փոխարեն:PCR-ն այժմ օգտագործվում է մոլեկուլային ախտորոշման, գյուղատնտեսության և արդյունաբերության ոլորտներում՝ տեխնիկային ավելացված բազմաթիվ նոր տարբերակներով:
Նկար 02. Taq պոլիմերազ
Taq ԴՆԹ պոլիմերազը գործում է օպտիմալ ջերմաստիճանի միջակայքում 720C – 800C: Taq ԴՆԹ պոլիմերազը պահանջում է համագործոն; մագնեզիում իր գործառույթի համար: Taq պոլիմերազը չունի 3'-5' սրբագրման ունակություն, հետևաբար, Taq ԴՆԹ պոլիմերազի սխալի մակարդակը բարձր է ԴՆԹ պոլիմերազների ավելի նոր տեսակների համեմատ, ինչպիսիք են Phusion պոլիմերազը և այլն: Բայց Taq ԴՆԹ պոլիմերազի ժողովրդականությունը մնում է նույնը ողջ գիտության աշխարհում՝ շնորհիվ ֆերմենտի հարմարության և ճկունության:
Որո՞նք են նմանությունները Phusion-ի և Taq պոլիմերազի միջև:
- Եվ Phusion և Taq պոլիմերազային ֆերմենտները պոլիմերացնող ֆերմենտներ են, որոնք ունակ են նուկլեոտիդներ ավելացնել ԴՆԹ-ի շղթայի 3' ազատ ծայրին:
- Եվ Phusion, և Taq պոլիմերազները պահանջում են այբբենարանային հաջորդականություն՝ պոլիմերացումը սկսելու համար:
- Եվ Phusion, և Taq պոլիմերազները ջերմակայուն են:
- Եվ Phusion, և Taq պոլիմերազները օգտագործվում են PCR մեխանիզմներում ԴՆԹ-ի ուժեղացման համար:
- Պոլիմերազը ռեակցիայի խառնուրդին ավելացնելիս և՛ Phusion, և՛ Taq պոլիմերազներն ավելացվում են վերջինը՝ ֆերմենտի արդյունավետությունն ապահովելու համար:
- Եվ Phusion, և Taq պոլիմերազները կոմերցիոնորեն սինթեզվում են մոլեկուլային կենսաբանության փորձարարական նպատակներով:
- Եվ Phusion, և Taq պոլիմերազները պահանջում են կոֆակտոր՝ իր գործառույթն ավարտելու համար:
Ո՞րն է տարբերությունը Phusion-ի և Taq Polymerase-ի միջև:
Phusion vs Taq Polymerase |
|
Phusion-ը Pyrococcus furiosus-ից մեկուսացված ԴՆԹ պոլիմերազ է և հիմնականում օգտագործվում է կլոնավորման փորձերում՝ հավատարմությունը բարձրացնելու համար: | Taq ԴՆԹ պոլիմերազը ստանդարտ ԴՆԹ պոլիմերազն է, որն օգտագործվում է պոլիմերազային շղթայական ռեակցիայում (PCR) և այն մեկուսացված է ջերմակայուն բակտերիայից՝ Thermus aquaticus-ից: |
Աղբյուր Օրգանիզմ | |
Phusion-ը վերցված է էքստրեմոֆիլ արխեայից՝ Pyrococcus furiosus: | Այս գրական ստեղծագործությունները ընդգրկում են գաղութացման շրջանից մինչև ապագաղութացման շրջանը։ |
Ապացույց կարդալու ունակություն | |
3' – 5' ապացույց կարդալու ունակությունը առկա է Phusion-ում: | 3' – 5' ապացույց կարդալու ունակությունը բացակայում է Taq պոլիմերազում: |
Հավատարմություն | |
Բարձր հավատարմությունը կա Phusion-ի հետ: | Taq պոլիմերազը ցույց է տալիս ցածր հավատարմություն: |
ուժեղացում | |
Phusion-ն ի վիճակի է ուժեղացնել ԴՆԹ-ի երկար բեկորները: | Taq պոլիմերազը կարող է ուժեղացնել ԴՆԹ-ի շատ ավելի կարճ բեկորները: |
dUTP թունավորում | |
Phusion-ի գործողությունը արգելակվում է կուտակման տարօրինակով: | Taq պոլիմերազը չի արգելակվում dUPT-ով: |
Ամփոփում – Phusion ընդդեմ Taq պոլիմերազի
Phusion-ը և Taq DNA պոլիմերազը երկու ջերմակայուն պոլիմերազներ են, որոնք օգտագործվում են ՊՇՌ տեխնիկայում: Phusion-ը պոլիմերազ է, որը մեկուսացված է էքստրեմոֆիլից՝ Pyrococcus furiosus-ից, մինչդեռ Taq-ը մեկուսացված է ջերմակայուն բակտերիայից Thermus aquaticus:Taq ԴՆԹ պոլիմերազի հայտնաբերումը հանգեցնում է PCR գյուտի: Phusion-ն ունի բազմաթիվ առավելություններ Taq-ի նկատմամբ, ինչը Phusion-ը դարձրել է ավելի լավ տարբերակ բարձր հավատարմության ԴՆԹ-ի արտադրության համար: Այնուամենայնիվ, Taq պոլիմերազը դեռ օգտագործվում է որպես ստանդարտ պոլիմերազային ֆերմենտ PCR-ում: Սա է տարբերությունը Phusion-ի և Taq պոլիմերազի միջև: