Հիմնական տարբերություն – YAC ընդդեմ BAC վեկտորների
Վեկտորները օգտագործվում են մոլեկուլային կլոնավորման մեջ: Վեկտորը կարող է սահմանվել որպես ԴՆԹ-ի մոլեկուլ, որն իրեն պահում է որպես օտար գենետիկ նյութ այլ բջիջ տեղափոխելու փոխադրամիջոց: Օտար ԴՆԹ պարունակող վեկտորը հայտնի է որպես ռեկոմբինանտ ԴՆԹ, և այն պետք է ունենա այն հյուրընկալող օրգանիզմում վերարտադրելու և արտահայտելու հնարավորություն: Խմորիչ արհեստական քրոմոսոմը (YAC) և բակտերիալ արհեստական քրոմոսոմը (BAC) երկու տեսակի վեկտորներ են, որոնք ներգրավված են կլոնավորման մեջ: YAC-ի և BAC-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ YAC-ը արհեստականորեն կառուցված վեկտորային համակարգ է, որն օգտագործում է խմորիչ քրոմոսոմի որոշակի շրջան՝ գենետիկական նյութերի մեծ հատվածներ խմորիչ բջիջներում ներդնելու համար, մինչդեռ BAC-ը արհեստականորեն կառուցված վեկտորային համակարգ է՝ օգտագործելով E-ի հատուկ շրջան:coli քրոմոսոմ՝ ԴՆԹ-ի մեծ հատվածներ E. coli բջիջների մեջ մտցնելու համար:
Ի՞նչ են YAC վեկտորները:
YAC (խմորիչ արհեստական քրոմոսոմ) արհեստականորեն կառուցված քրոմոսոմ է, որն ունի օտար ԴՆԹ-ի մեծ հատված կրելու և խմորիչ բջիջների մեջ բազմանալու հատկություն: Այն ունի ցենտրոմեր, տելոմերներ, ինչպես նաև ինքնավար վերարտադրվող հաջորդականություններ, որոնք էական նշանակություն ունեն վերարտադրության և կայունության համար: YAC-ը պետք է նաև ունենա ընտրովի մարկեր կամ մարկերներ և սահմանափակող վայրեր՝ այն արդյունավետ կլոնավորման վեկտոր դարձնելու համար: 1000 kb-ից մինչև 2000 kb տատանվող մեծ հաջորդականություն կարող է տեղադրվել YAC-ում և փոխանցվել խմորիչի մեջ: YAC-ի փոխակերպման արդյունավետությունը շատ ցածր է:
Նկար 01. YAC վեկտոր
Ի՞նչ են BAC վեկտորները:
Բակտերիալ արհեստական քրոմոսոմը (BAC) արհեստականորեն կառուցված քրոմոսոմ է մոլեկուլային կլոնավորման համար:Այն ունի E. coli F պլազմիդի հատուկ շրջաններ և շրջանաձև է և գերոլորված: BAC-ը մշակվել է ԴՆԹ-ի բեկորները բակտերիաների, հատկապես E. coli-ի կլոնավորման համար: Այն կարող է կրել ԴՆԹ-ի բեկորներ, որոնք ունեն մինչև 300 կբ չափսեր: YAC-ի համեմատ, BAC կլոնավորման ներդիրները չափսերով ավելի փոքր են: BAC-ները մշակվել են 1992 թվականին, և այն դեռ հայտնի է իր կայունության և շինարարության հեշտության շնորհիվ: BAC-ները նաև օգտակար են պատվաստանյութերի մշակման համար:
Նկար 02. BAC վեկտոր մոլեկուլային կլոնավորման մեջ
Ո՞րն է տարբերությունը YAC և BAC վեկտորների միջև:
YAC ընդդեմ BAC վեկտորների |
|
| YAC-ը գենետիկորեն մշակված քրոմոսոմ է, որն օգտագործում է խմորիչ ԴՆԹ՝ կլոնավորման նպատակով: | BAC-ը գենետիկորեն մշակված ԴՆԹ մոլեկուլ է, որն օգտագործում է E. coli ԴՆԹ կլոնավորման նպատակով: |
| Սեռ | |
| YAC-ները նախագծված էին գենոմային ԴՆԹ-ի մեծ բեկորները խմորիչի մեջ կլոնավորելու համար: | BAC-ները մշակվել են գենոմի մեծ բեկորները Escherichia coli-ի մեջ կլոնավորելու համար: |
| Տեղադրել երկարությունը | |
| YAC-ները կարող են պարունակել մեգաբազայի չափի գենոմային ներդիրներ: (1000 kb – 2000 kb): | BAC-ները կարող են կրել 200–300 կբ կամ պակաս ներդիրներ։ |
| Շինարարություն | |
| YAC ԴՆԹ-ն դժվար է մաքրել անձեռնմխելի և պահանջում է բարձր կենտրոնացում YAC վեկտորային համակարգ ստեղծելու համար: | BAC-ը հեշտ է մաքրել անձեռնմխելի և կարող է հեշտությամբ կառուցվել: |
| քիմերիզմ | |
| YAC-ները հաճախ քիմերիկ են: | BAC-ները հազվադեպ են քիմերային: |
| Կայունություն | |
| YAC-ն անկայուն է: | BAC-ը կայուն է։ |
| Փոփոխություններ | |
| Խմորիչի վերահամակցումը շատ իրագործելի է և միշտ ակտիվ է մնում: Հետևաբար այն կարող է առաջացնել ջնջումներ և այլ վերադասավորումներ YAC-ում: | E. coli-ի վերահամակցումը կանխվում է և անհրաժեշտության դեպքում միանում է: Հետևաբար, այն նվազեցնում է BAC-ների անցանկալի վերադասավորումները: |
| Maintenance | |
| Ռեկոմբինանտ YAC-ների մանիպուլյացիա սովորաբար պահանջում է YAC-ը տեղափոխել E. coli՝ հետագա մանիպուլյացիայի համար: Հետևաբար, դա աշխատատար գործընթաց է։ | BAC փոփոխությունը տեղի է ունենում անմիջապես E. coli-ում: Այսպիսով, ԴՆԹ-ի փոխանցման կարիք չկա: Հետևաբար, գործընթացը աշխատատար չէ։ |
Ամփոփում – YAC vs BAC վեկտորներ
YAC-ը դարձել է էական հետազոտական գործիք կլոնավորման գործընթացներում՝ շնորհիվ հյուրընկալող օրգանիզմում ԴՆԹ-ի մեծ բեկորները կլոնավորելու իր ունակության: Այնուամենայնիվ, YAC-ները ունեն մի քանի թերություններ, որպես վեկտորներ, ինչպիսիք են շինարարական դժվարությունները, քիմերիզմը, անկայունությունը և այլն: Հետևաբար, այս խնդիրները հաղթահարելու համար գիտնականները մշակել են BAC վեկտորներ: BAC-ը կառուցվել է՝ օգտագործելով E. coli քրոմոսոմի հատուկ շրջաններ: Այն կայուն վեկտոր է և հեշտությամբ կարելի է կառուցել: Այնուամենայնիվ, ԴՆԹ-ի երկարությունը, որը կարող է կարգավորել BAC-ը, մինչև 20 անգամ պակաս է, քան YAC-ը: Սա է տարբերությունը YAC և BAC վեկտորային համակարգերի միջև: Մեր օրերում BAC-ն ավելի նախընտրելի է, քան YAC-ը լաբորատորիաներում:
