Հիերարխիկ և ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանների հաջորդականության հիմնական տարբերությունն այն է, որ որսորդական հրացանի հիերարխիկ հաջորդականության ժամանակ գենոմը բաժանվում է ավելի մեծ բեկորների մինչև հաջորդականությունը, մինչդեռ ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականության դեպքում ամբողջ գենոմը բաժանվում է փոքր բեկորների՝ հաջորդականության համար:.
Հերթականությունը կարևոր տեխնիկա է մոլեկուլային գործընթացներում, հատկապես տեսակների ճշգրիտ նույնականացման գործում: Իրականում դա գենում կամ գենոմում նուկլեոտիդների ճշգրիտ կարգը որոշելու տեխնիկան է: Կան հաջորդականության բազմաթիվ տեխնիկա: Դրանցից մի քանիսը ներառում են Մաքսամ Գիլբերտի մեթոդը, Սանգերի մեթոդը և ավտոմատացված Սանգերի մեթոդը:
Ի՞նչ է հիերարխիկ որսորդական հրացանի հաջորդականությունը:
Հիերարխիկ որսորդական հրացանների հաջորդականությունը հաջորդականության մեթոդներից մեկն է: Այն նաև կոչվում է «վերևից ներքև հաջորդականություն»: Ավելին, այս մեթոդը բաղկացած է երկու քայլից՝ առաջին քայլը գենոմի ամպլիֆիկացումն է, իսկ երկրորդը՝ գենոմի մասնատումը։ Այս մեթոդով գենոմը նախ կտրվում է մեծ բեկորների: Դրան հաջորդում է այս խոշոր բեկորների կլոնավորումը տարբեր հյուրընկալների մեջ՝ օգտագործելով վեկտորներ կամ արհեստական քրոմոսոմներ: Այնուհետև այս ռեկոմբինանտ վեկտորները դասավորվում են գրադարանի մեջ: Որսորդական հրացանի հաջորդականության ընթացքում ռեկոմբինանտ վեկտորային կլոնները առանձին-առանձին ենթարկվում են հաջորդականության: Կլոնների բեկորները ենթարկվում են սահմանափակման մարսողության՝ գենոմի չափը հետագայում նվազեցնելու համար՝ դրանով իսկ անցնելով հաջորդականության:
Նկար 01. Հիերարխիկ հրացանների հաջորդականություն
Որսորդական հրացանի հիերարխիկ հաջորդականության ժամանակ բեկորների մեծ կտորները պետք է դասավորվեն ըստ հերթականության՝ նախքան որսորդական հրացանի հաջորդականությունը: Այն տեղի է ունենում մոլեկուլային մարկերների օգնությամբ, որոնք ներառված են կլոնավորման գործընթացում:
Հիերարխիկ որսորդական հրացանի հաջորդականությունը ստեղծում է ցածր լուծաչափով գենային քարտեզ: Բայց դա ստեղծում է պատվիրված հաջորդականության քարտեզ: Այսպիսով, այն ավելի երկար տևում է, քան ուղղակի հաջորդականությունը: Ամբողջ գործընթացը հետաձգվում է ռեկոմբինանտ վեկտորային գրադարանի ստեղծման պատճառով: Արդյո՞ք դա նաև աշխատատար տեխնիկա է: Այնուամենայնիվ, ներկայումս տեխնիկան ավտոմատացված է՝ աշխատանքը հեշտացնելու համար։
Ի՞նչ է ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականությունը:
Ողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականությունը մեկ քայլ հաջորդականության գործընթաց է: Այս գործընթացում առաջին հերթին տեղի է ունենում ամբողջ գենոմի կտրումը: Դրանից հետո այս փոքր բեկորներից յուրաքանչյուրը պատահականորեն անցնում է հաջորդականության: Հերթականության ավարտից հետո կատարվում է հաջորդականության վերլուծություն:Հերթական վերլուծության ժամանակ համընկնող հաջորդականությունները հանվում են, և վերլուծությունը պատվիրված գործընթաց չէ: Հետևաբար, հաջորդականությունների հավաքումը ավելի քիչ արդյունավետ գործընթաց է՝ համեմատած հիերարխիկ որսորդական հրացանների հաջորդականության հետ: Այնուամենայնիվ, ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականացման գործընթացը ավելի արագ է ընթանում, և ամբողջ գենոմի վերլուծությունը կարող է տեղի ունենալ մեկ օրինակով:
Որո՞նք են նմանությունները հիերարխիկ և ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանների հաջորդականության միջև:
- Հիերարխիկ և ամբողջ գենոմով որսորդական հրացանի հաջորդականությունը երկու հաջորդական մոտեցում է:
- Երկուսն էլ անցնում են Sanger հաջորդականության կամ ավտոմատացված Sanger հաջորդականության մեթոդներով:
- Նրանք մասնակցում են ԴՆԹ-ի և ՌՆԹ-ի բեկորների հաջորդականացմանը:
- Ավելին, երկու մեթոդներն էլ կարևոր են մոլեկուլային ախտորոշման և հետազոտական նպատակների համար:
- Ներկայումս երկու տեխնիկան էլ ավտոմատացված են կամ համակարգչային:
- Երկու տեխնիկան էլ հիմնված է գենոմի մասնատման վրա։
Ո՞րն է տարբերությունը հիերարխիկ և ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանների հաջորդականության միջև:
Հիերարխիկ որսորդական հրացանի հաջորդականությունը առաջացնում է ավելի մեծ չափերի բեկորներ՝ համեմատած ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականության հետ, որն աշխատում է հաջորդականությունների փոքր հատվածների հետ: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է հիերարխիկ և ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականության միջև: Բացի այդ, որսորդական հրացանի հիերարխիկ հաջորդականությունը բաղկացած է երկու հիմնական փուլից, մինչդեռ ամբողջ գենոմային որսորդական հրացանի հաջորդականությունը հիմնված է մեկ հիմնական քայլի վրա:
Ավելին, որսորդական հրացանների հիերարխիկ և ամբողջական գենոմային հաջորդականության միջև մեկ այլ տարբերություն այն է, որ որսորդական հրացանի հիերարխիկ և ամբողջական գենոմային հաջորդականության լուծաչափն ավելի բարձր է, քան որսորդական հրացանների հիերարխիկ հաջորդականությունը:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ամփոփում է հիերարխիկ և ամբողջական գենոմի որսորդական հրացանների հաջորդականության տարբերությունը:
Ամփոփում – Հիերարխիկ ընդդեմ ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականություն
Հիերարխիկ և ամբողջ գենոմով որսորդական հրացանների հաջորդականությունը մեծ գենոմների հաջորդականացման երկու տեխնիկա է: Որսորդական հրացանի հիերարխիկ հաջորդականությունը հաջորդականության երկքայլ գործընթաց է, որտեղ գենոմը բաժանվում է ավելի մեծ բեկորների: Ի հակադրություն, որսորդական հրացանի ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը մեկ փուլային հաջորդականություն է, որտեղ գենոմը բաժանվում է փոքր բեկորների և ուղղակիորեն հաջորդականացվում: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է հիերարխիկ և ամբողջ գենոմի որսորդական հրացանի հաջորդականության միջև: Ավելին, տեխնիկական ասպեկտները կարող են տարբեր լինել երկու տեխնիկայի միջև:
