Հիմնական տարբերություն – VNTR ընդդեմ STR
ԴՆԹ-ի ուսումնասիրությունները հսկայական օգտակարություն ունեն ֆիլոգենետիկ հարաբերությունները հասկանալու և որոշելու, գենետիկ հիվանդությունների ախտորոշման և օրգանիզմի գենոմների քարտեզագրման գործում: ԴՆԹ-ի վերլուծության հետ կապված մի քանի մեթոդներ օգտագործվում են որոշակի գենի կամ ԴՆԹ-ի հաջորդականության նույնականացման համար անհայտ ԴՆԹ-ի լողավազանում: Նրանք հայտնի են որպես գենետիկ մարկերներ: Գենետիկական մարկերները օգտագործվում են մոլեկուլային կենսաբանության մեջ՝ բացահայտելու անհատների և տեսակների միջև գենետիկական տատանումները: Փոփոխական թվերի տանդեմ կրկնությունը (VNTR) և կարճ տանդեմ կրկնությունը (STR) գենետիկական մարկերների երկու տեսակ են, որոնք ցույց են տալիս անհատների միջև պոլիմորֆիզմ: Երկու տեսակներն էլ չկոդավորվող կրկնվող ԴՆԹ են, որոնք տանդեմի կրկնություններ են:Դրանք դասավորված են քրոմոսոմներում գլխից պոչ ձևով: VNTR-ը գենոմի մի հատված է, որտեղ նուկլեոտիդների կարճ հաջորդականությունը մի քանի անգամ կրկնվում է: STR-ը ԴՆԹ-ի մեկ այլ հատված է գենոմում, որը կազմակերպված է որպես կրկնվող միավորներ, որոնք բաղկացած են հարյուր անգամ երկուսից տասներեք նուկլեոտիդներից: VNTR-ի և STR-ի հիմնական տարբերությունը կրկնվող հաջորդականության մեջ նուկլեոտիդների քանակն է: VNTR-ի կրկնվող միավորները բաղկացած են 10-ից 100 նուկլեոտիդներից, մինչդեռ STR-ի կրկնվող միավորը բաղկացած է 2-ից 13 նուկլեոտիդներից: VNTR-ը և STR-ը լայնորեն օգտագործվում են դատաբժշկական հետազոտություններում:
Ինչ է VNTR?
Տանդեմային կրկնությունը ԴՆԹ-ի կարճ հաջորդականություն է, որը կրկնվում է գլխից պոչ որոշակի քրոմոսոմային տեղանքում: Տանդեմային կրկնության մեջ այլ հաջորդականություն կամ նուկլեոտիդ չկա: Գենոմում կան տանդեմի կրկնությունների մի քանի տեսակներ: VNTR-ը նրանց միջև տանդեմի կրկնության տեսակ է, որն ունի 10-ից 100 նուկլեոտիդից բաղկացած կրկնվող միավորներ: VNTR-ը մինի արբանյակի տեսակ է: Այս տանդեմի կրկնությունները կարելի է գտնել բազմաթիվ քրոմոսոմներում:Դրանք ցրված են մարդու գենոմում և տեղակայված են հիմնականում քրոմոսոմների ենթելոմերային շրջաններում։
VNTR-ները ցույց են տալիս անհատների միջև տանդեմի կրկնվող պոլիմորֆիզմ: VNTR-ի երկարությունը քրոմոսոմի որոշակի վայրում խիստ փոփոխական է անհատների շրջանում՝ կապված այդ ԴՆԹ բաժնում կազմակերպված կրկնվող միավորների քանակի փոփոխության հետ: Հետևաբար, VNTR-ը կարող է օգտագործվել որպես հզոր գործիք անհատների նույնականացման համար, և VNTR վերլուծությունը օգտագործվում է բազմաթիվ ոլորտներում, ներառյալ գենետիկան, կենսաբանական հետազոտությունը, դատաբժշկական փորձաքննությունը և ԴՆԹ մատնահետքերը: VNTR-ները առաջին գենետիկ մարկերներն էին, որոնք օգտագործվում էին ոսկրածուծի փոխպատվաստման պատվաստումը քանակականացնելու համար: VNTR-ները նաև առաջին պոլիմորֆ մարկերներն էին, որոնք օգտագործվում էին դատաբժշկական ԴՆԹ-ի պրոֆիլավորման մեջ:
Նկար 01. VNTR-ների տատանումները վեց անհատներում
VNTR վերլուծությունը կատարվում է սահմանափակող հատվածի երկարության պոլիմորֆիզմի միջոցով, որին հաջորդում է հարավային հիբրիդացումը: Հետևաբար, դրա համար անհրաժեշտ է համեմատաբար մեծ ԴՆԹ նմուշ: VNTR պրոֆիլի մեկնաբանումը նույնպես խնդրահարույց է: Այս սահմանափակումների պատճառով VNTR-ի օգտագործումը դատաբժշկական գենետիկայի մեջ սահմանափակվել է և այն փոխարինվել է STR վերլուծությամբ:
Ինչ է STR?
STR-ը խիստ կրկնվող ԴՆԹ հատված է, որը բաղկացած է երկու-ից տասներեք նուկլեոտիդային կրկնվող միավորներից, որոնք կազմակերպված են տանդեմ ձևով: STR-ը նման է VNTR-ին: Բայց այն տատանվում է VNTR-ից՝ կրկնվող հաջորդականությամբ նուկլեոտիդների քանակից և կրկնությունների քանակից: STR-ը միկրոարբանյակների տեսակ է։
STR վերլուծություն, որը ներառում է կրկնվող միավորների ճշգրիտ թիվը: STR-ները խիստ փոփոխական են անհատների շրջանում, նման են VNT-ներին: STR պրոֆիլները տարբերվում են անձից անձից: Հետևաբար, STR վերլուծությունը օգտագործվում է մոլեկուլային կենսաբանության մեջ՝ համեմատելու երկու կամ ավելի նմուշների ԴՆԹ-ի հատուկ տեղանքները: Հետևաբար STR-ները համարվում են հզոր գենետիկական մարկերներ մոլեկուլային կենսաբանության մեջ:Այն հիանալի գործիք է տրամադրում անհատների նույնականացման համար՝ նրանց պոլիմորֆիզմի բարձր աստիճանի և համեմատաբար կարճ երկարության պատճառով:
Ներկայումս STR-ները դատաբժշկական գենետիկայի մեջ ամենաշատ օգտագործվող վերլուծված գենետիկ պոլիմորֆիզմի գործիքն են: Դատաբժշկական գործերի մեծ մասը ներառում է STR պոլիմորֆ վերլուծություն: STR լոկուսները տարածված են ողջ գենոմում: Կան հազարավոր STR-ներ, որոնք տեղակայված են քրոմոսոմներում, որոնք կարող են օգտագործվել դատաբժշկական վերլուծության մեջ: STR վերլուծությունը չի ներառում սահմանափակումային երկարության պոլիմորֆիզմ, ինչպես VNTR վերլուծությունը: STR վերլուծությունը չի կտրում ԴՆԹ-ն սահմանափակող ֆերմենտներով: Հատուկ զոնդերը օգտագործվում են ԴՆԹ-ի վրա ցանկալի հատվածները միացնելու համար և օգտագործելով PCR տեխնիկան, որոշվում են STR-ի երկարությունները:
Նկար 02. STR տատանումները նմուշների միջև
Որո՞նք են նմանությունները VNTR-ի և STR-ի միջև:
- VNTR-ը և STR-ը չկոդավորող ԴՆԹ են:
- Երկուսն էլ տանդեմ կրկնություններ են։
- Երկուսն էլ ցույց են տալիս պոլիմորֆիզմ անհատների մեջ ԴՆԹ-ի հատվածի երկարության տարբերության պատճառով:
- Երկուսն էլ օգտագործվում են որպես հզոր գենետիկական մարկեր ԴՆԹ-ի մատների տպագրության և դատաբժշկական հետազոտություններում:
Ո՞րն է տարբերությունը VNTR-ի և STR-ի միջև:
VNTR ընդդեմ STR |
|
| VNTR-ը չկոդավորվող կրկնվող ԴՆԹ է, որն ունի կարճ նուկլեոտիդային հաջորդականություն, որը կրկնվում է տանդեմ ձևով: | STR-ը խիստ կրկնվող ԴՆԹ բաժին է, որը բաղկացած է երկու-ից տասներեք նուկլեոտիդային կրկնվող միավորներից, որոնք կազմակերպված են տանդեմ ձևով: |
| Չափ | |
| VNTR-ներն ավելի մեծ են, քան STR-երը: | STR-ներն ավելի փոքր են, քան VNTR-ները: |
| Նուկլեոտիդների քանակը կրկնվող հաջորդականության մեջ | |
| VNTR-ի կրկնվող միավորը բաղկացած է 10-ից 100 նուկլեոտիդից: | STR-ի կրկնվող միավորը բաղկացած է 2-ից 13 նուկլեոտիդից: |
Ամփոփում – VNTR ընդդեմ STR
VNTR-ը և STR-ը երկու հզոր գենետիկ մարկեր են, որոնք օգտագործվում են մոլեկուլային կենսաբանության մեջ, հատկապես դատական գենետիկայի ոլորտում: VNTR-ը մինիարբանյակի տեսակ է, իսկ STR-ը՝ միկրոարբանյակ: VNTR-ը և STR-ը չկոդավորող, խիստ կրկնվող ԴՆԹ են: Դրանք տանդեմ կրկնություններ են։ VNTR-ի և STR-ի ընդհանուր կառուցվածքը նույնն է: Այնուամենայնիվ, կրկնվող հաջորդականության մեջ նուկլեոտիդների քանակը և երկարությունը տարբեր են։ VNTR-ն ունի կրկնվող հաջորդականություն, որը բաղկացած է 10-ից 100 նուկլեոտիդից: STR-ն ունի 2-ից 13 նուկլեոտիդներից բաղկացած կրկնվող հաջորդականություններ: Սա է տարբերությունը VNTR-ի և STR-ի միջև:
Ներբեռնեք VNTR-ի PDF տարբերակը ընդդեմ STR
Դուք կարող եք ներբեռնել այս հոդվածի PDF տարբերակը և օգտագործել այն անցանց նպատակներով՝ ըստ մեջբերումների: Խնդրում ենք ներբեռնել PDF տարբերակը այստեղ VNTR-ի և STR-ի միջև տարբերությունը:
