CGH-ի և զանգվածի CGH-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ CGH-ը ավանդական մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ փորձարկման նմուշի ԴՆԹ-ի կրկնօրինակների թվի փոփոխությունը վերլուծելու համար, որն ունի ավելի ցածր լուծաչափություն, մինչդեռ զանգվածը CGH-ը լիովին ավտոմատացված մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է։ ավելի բարձր լուծաչափ ունեցող փորձանմուշի ԴՆԹ-ի պատճենների թվի փոփոխության վերլուծություն:
CGH-ը և զանգվածի CGH-ն անհատների մոտ պատճենների թվի տատանումները հայտնաբերելու երկու տեխնիկա են: Պատճենների թվի փոփոխությունը վերաբերում է գենոմի այն հատվածներին, որոնք կրկնվում են: Պատճենների թիվը տատանվում է անհատների միջև: Պատճենների թվի տատանումները սովորաբար դասակարգվում են երկու խմբի՝ կարճ կրկնություններ և երկար կրկնություններ:Կրճատ օրինակների թվի փոփոխության ամենահայտնի օրինակներից մեկը Հանթինգտինի գենում CAG տրինուկլեոտիդի կրկնությունն է: Սա առաջացնում է նյարդաբանական խանգարում, որը կոչվում է Huntingtin: Երկար կրկնվող կրկնօրինակների թվի փոփոխության լավագույն օրինակը ալֆա ամիլազի գենն է, որն առաջացնում է ինսուլինի դիմադրություն: Պատճենների թվի տատանումները կարող են հայտնաբերվել այնպիսի մեթոդներով, ինչպիսիք են FISH, CGH և զանգվածի CGH:
Ի՞նչ է CGH?
CGH-ը ավանդական մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ փորձարկվող նմուշի ԴՆԹ-ի կրկնօրինակների քանակի փոփոխության վերլուծության համար՝ համեմատած տեղեկատու նմուշի հետ: Այն ունի ավելի ցածր լուծաչափ, համեմատած ավտոմատացված տեխնիկայի հետ: Այս տեխնիկայի նպատակն է արագ և արդյունավետ կերպով համեմատել գենոմային ԴՆԹ-ի երկու նմուշները, որոնք առաջացել են տարբեր աղբյուրներից:
Նկար 01. CGH
Պրոցեդուրան ներառում է ԴՆԹ-ի մեկուսացում երկու աղբյուրից՝ թեստից և հղումից: Այնուհետև հաջորդ քայլը փորձարկման և տեղեկատու ԴՆԹ-ի նմուշների անկախ պիտակավորումն է տարբեր գույների ֆտորոֆորներով: Հետագայում ԴՆԹ-ի երկու նմուշներն այլասերվել են՝ միաշղթա ԴՆԹ-ի նմուշները ստանալու համար։ Ի վերջո, կատարվել է ստացված ԴՆԹ-ի երկու նմուշների հիբրիդացումը 1:1 հարաբերակցությամբ քրոմոսոմների նորմալ մետաֆազային տարածմանը: Քրոմոսոմային տարբերությունները կարելի է բացահայտել երկու աղբյուրների միջև՝ օգտագործելով ֆլուորեսցենտային մանրադիտակ և համակարգչային ծրագրակազմ: Ավելին, CGH տեխնիկան ի վիճակի է միայն հայտնաբերել անհավասարակշռված քրոմոսոմային աննորմալություններ:
Ի՞նչ է Array CGH:
Array CGH-ը լիովին ավտոմատացված մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ փորձարկվող նմուշի ԴՆԹ-ում կրկնօրինակների թվի փոփոխության վերլուծության համար՝ համեմատած տեղեկատու նմուշի հետ: Այն ունի ավելի բարձր լուծաչափ, և այն մշակվել է ավանդական CGH-ի սահմանափակումները նվազագույնի հասցնելու համար: Array CGH-ը համատեղում է CGH-ի սկզբունքները միկրոզանգվածների օգտագործման հետ:Մետաֆազային քրոմոսոմների տարածումը օգտագործելու փոխարեն այս մեթոդը որպես թիրախ օգտագործում է ԴՆԹ-ի փոքր հատվածներով դասավորված սլայդներ: Այս միկրոզանգվածները պատրաստվել են պինդ ապակե հենարանի վրա փոքր քանակությամբ ԴՆԹ (զոնդեր) տեղադրելու և անշարժացնելու միջոցով: Զոնդերի չափերը կարող են տարբեր լինել՝ օլիգոնուկլեոտիդից մինչև բակտերիալ արհեստական քրոմոսոմ:
Նկար 02. զանգված CGH
Անկախ զոնդերից, զանգվածի CGH-ի հիմնական մեթոդը նման է CGH-ին: Միկրոզանգված պարունակող զոնդերը պատրաստելուց հետո, տարբեր գույների ֆտորոֆորներով պիտակավորված ԴՆԹ-ի երկու նմուշները (թեստ և տեղեկանք) խառնվում են իրար և ավելացվում միկրոզանգվածին: Քանի որ նմուշների ԴՆԹ-ն միաշղթա է` դենատուրացիայի պատճառով, այս ԴՆԹ-ն հիբրիդացվում է դասավորված միաշղթա զոնդերով: Օգտագործելով թվային պատկերային համակարգ՝ հնարավոր է բացահայտել երկու աղբյուրների քրոմոսոմային տարբերությունները:
Որո՞նք են նմանությունները CGH-ի և Array CGH-ի միջև:
- CGH-ը և զանգվածի CGH-ը կրկնօրինակների թվերի տատանումները հայտնաբերելու երկու տեխնիկա են:
- Դրանք մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդներ են։
- Երկու մեթոդներն էլ ախտորոշում են անհավասարակշիռ քրոմոսոմային շեղումներ։
- Ֆտորոֆորները ներգրավված են երկու մեթոդներում էլ:
- Երկու մեթոդներն էլ կարող են օգտագործվել գենետիկական խանգարումների հայտնաբերման համար՝ կապված պատճենների թվի տատանումների հետ:
- Դրանք լայնորեն օգտագործվում են համեմատական գենոմային վերլուծության մեջ:
Ո՞րն է տարբերությունը CGH-ի և Array CGH-ի միջև:
CGH-ը ավանդական մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ փորձարկվող նմուշի ԴՆԹ-ի կրկնօրինակների թվի փոփոխությունը վերլուծելու համար, որն ունի ավելի ցածր լուծաչափ, մինչդեռ զանգվածը CGH-ը լիովին ավտոմատացված մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ փորձարկման նմուշի ԴՆԹ-ի կրկնօրինակների թվի փոփոխությունը վերլուծելու համար: որն ունի ավելի բարձր լուծաչափ: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է CGH-ի և զանգվածի CGH-ի միջև:Ավելին, CGH-ում թեստային և տեղեկատու ԴՆԹ-ի նմուշները հիբրիդացվում են քրոմոսոմների նորմալ մետաֆազային տարածման հետ, իսկ զանգվածի CGH-ում թեստային և տեղեկատու ԴՆԹ-ի նմուշները հիբրիդացվում են միկրոզանգված պարունակող անշարժացված ԴՆԹ-ի հետ::
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ցույց է տալիս CGH-ի և զանգվածի CGH-ի միջև եղած տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – CGH vs Array CGH
CGH-ը և զանգվածի CGH-ը երկու մոլեկուլային ցիտոգենետիկ տեխնիկա են՝ անհավասարակշիռ քրոմոսոմային աննորմալությունները հայտնաբերելու համար: Նրանք լայնորեն կիրառվում են համեմատական գենոմային վերլուծության մեջ։ CGH-ը ավանդական մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ փորձարկման նմուշի ԴՆԹ-ի կրկնօրինակների թվի փոփոխության վերլուծության համար, որն ունի ավելի ցածր լուծաչափ: Ի հակադրություն, զանգվածի CGH-ը լիովին ավտոմատացված մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեթոդ է՝ ավելի բարձր լուծաչափ ունեցող փորձանմուշի ԴՆԹ-ի կրկնօրինակների թվի փոփոխությունը վերլուծելու համար: Այսպիսով, սա ամփոփում է CGH-ի և զանգվածի CGH-ի միջև եղած տարբերությունը:
