FISH-ի և CGH-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ FISH-ը մոլեկուլային տեխնիկա է, որը հայտնաբերում է հատուկ ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը քրոմոսոմի վրա՝ օգտագործելով ֆլյուորեսցենտով պիտակավորված զոնդերը, մինչդեռ CGH-ը ևս մեկ մոլեկուլային ցիտոգենետիկ տեխնիկա է, որը հայտնաբերում է գենոմային ԴՆԹ-ի փոփոխությունները:
Ցիտոգենետիկ անալիզը կարևոր դեր է խաղում բժշկության մեջ քրոմոսոմային աննորմալությունների հայտնաբերման ժամանակ, ինչպիսիք են անուպլոիդները, ջնջումները, կրկնօրինակումները և վերադասավորումները և այլն: սինդրոմ, լեյկոզ և այլն: Գոյություն ունեն մոլեկուլային ցիտոգենետիկ տարբեր մեթոդներ վերը նշված արատների և հիվանդությունների հայտնաբերման համար:Դրանցից FISH-ը (ֆլուորեսցենտ in situ հիբրիդացում) և CGH (համեմատական գենոմային հիբրիդացում) հիբրիդացման երկու հզոր տեխնիկա են: Այնուամենայնիվ, երկու մեթոդներն էլ ունեն դրական և բացասական կողմեր:
Ի՞նչ է Ձուկը:
FISH-ը նուկլեինաթթվի հիբրիդացման տեխնիկա է, որն իրականացվում է հյուսվածքի մի մասի կամ հատվածի վրա՝ ամբողջ հյուսվածքում կամ բջիջներում: Դա զոնդի վրա հիմնված մեթոդ է։ Տեխնիկան կախված է Watson Crick-ի կոմպլեմենտար հիմքերի զուգակցման տեսությունից, որի արդյունքում կա՛մ ԴՆԹ-ԴՆԹ հիբրիդներ, կա՛մ ԴՆԹ-ՌՆԹ հիբրիդներ, որոնք այդպիսով կարող են հայտնաբերել մուտացված գեները կամ կարող են նույնականացնել հետաքրքրող գենը: Ավելին, այս տեխնիկան օգտագործում է միաշղթա ԴՆԹ-ի հաջորդականություններ, երկշղթա ԴՆԹ-ի հաջորդականություններ, միաշղթա ՌՆԹ հաջորդականություններ կամ սինթետիկ օլիգոնուկլեոտիդներ, որոնք պատրաստված են նիկ թարգմանության միջոցով, որոնք լրացնում են հետաքրքրող գենային հաջորդականությունները: Բացի այդ, այս տեխնիկայի ամենակարևոր առանձնահատկությունը զոնդերի պիտակավորումն է ֆլուորեսցենտային ներկերով։ Այսպիսով, զոնդերը կապվում են քրոմոսոմի լրացուցիչ մասերի հետ և հեշտացնում դրա հայտնաբերումը։
Ավելին, FISH-ը խիստ զգայուն և հատուկ մեթոդ է: Հետևաբար, այն տարածված տեխնիկա է արյունաբանական չարորակ նորագոյացությունների և պինդ ուռուցքների հետազոտության և ախտորոշման համար: Բայց, FISH-ը ցույց է տալիս ցածր լուծում: Հետազոտման հաջորդականությունները նախագծելու համար անհրաժեշտ է նաև թիրախային աննորմալության նախնական իմացություն:
Նկար 01. FISH
Կան FISH-ի բազմաթիվ կիրառություններ, հիմնականում վարակիչ հիվանդությունների մոլեկուլային ախտորոշման մեջ՝ բացահայտելու պաթոգենների առկայությունը և մոլեկուլային ախտորոշման միջոցով պաթոգենը հաստատելու համար: Ավելին, FISH-ը սովորաբար օգտագործվող տեխնիկա է զարգացման կենսաբանության, կարիոտիպավորման և ֆիլոգենետիկ վերլուծության և քրոմոսոմների ֆիզիկական քարտեզագրման ոլորտներում:
Ի՞նչ է CGH?
Համեմատական գենոմային հիբրիդացումը (CGH) ԴՆԹ-ի վրա հիմնված մոլեկուլային ցիտոգենետիկ մեկ այլ տեխնիկա է, որը կարող է հայտնաբերել գենոմային ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների փոփոխությունները:Մեթոդը առաջադեմ մեթոդ է, որը կարող է վերլուծել քրոմոսոմների և գենային փոփոխությունները՝ հայտնաբերելու գենոմային ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների փոփոխությունները կամ փոփոխությունները: Ավելին, CGH-ը պահանջում է ԴՆԹ-ի մեկուսացում և մասնատում փորձարարական նմուշից և հղման նմուշից: Այնուհետև նմուշները պետք է մակնշվեն՝ օգտագործելով երկու տարբեր լյումինեսցենտ ներկեր (սովորաբար կարմիր և կանաչ): Հետագայում երկու նմուշները խառնվում են և թույլատրվում մրցակցային հիբրիդացման համար: Վերջին քայլը նմուշների վերլուծությունն է ԴՆԹ-ի փոփոխությունների համար, ինչպիսիք են գենի կրկնօրինակումը, գենի կորուստը և այլն: Հատկապես այն չափում է ԴՆԹ-ի պատճենների քանակի տարբերությունները փորձարկման նմուշի և հսկիչ նմուշի միջև:
Նկար 02. CGH
CGH-ի մեկ այլ տարբերակ այժմ հասանելի է. դա ավելի առաջադեմ մեթոդ է, քան սովորական CGH-ը: Դա մի տեխնիկա է, որը կոչվում է զանգվածի վրա հիմնված CGH կամ aCGH: aCGH-ը թույլ է տալիս ճշգրիտ նույնականացնել գենի կամ հաջորդականության ջնջումները հազարավոր հաջորդականություններում մեկ փորձի ընթացքում:
Որո՞նք են նմանությունները FISH-ի և CGH-ի միջև:
- FISH-ը և CGH-ը երկու մոլեկուլային տեխնիկա են:
- Եվ FISH-ը և CGH-ը հիմնված են նուկլեինաթթվի հիբրիդացման վրա:
- Նաև, երկու տեխնիկաներին էլ անհրաժեշտ են նախագծված զոնդեր՝ հատուկ ԴՆԹ թիրախներ հայտնաբերելու համար:
- Մենք դրանք օգտագործում ենք գենետիկ հիվանդությունների նախածննդյան և հետծննդյան ախտորոշման համար։
- Ավելին, և՛ FISH-ը, և՛ CGH-ը շատ հզոր գործիքներ են գենոմային փոփոխություններն ուսումնասիրելու համար:
- Նրանք օգտագործում են լյումինեսցենտային ներկեր զոնդերը պիտակավորելու համար:
Ո՞րն է տարբերությունը FISH-ի և CGH-ի միջև:
FISH-ը in situ հիբրիդացման պրոցեդուրա է, որն օգտագործում է լյումինեսցենտային զոնդեր՝ ԴՆԹ-ի հատուկ հաջորդականությունները հայտնաբերելու համար, մինչդեռ CGH-ը մոլեկուլային հիբրիդացման տեխնիկա է, որը հայտնաբերում է գենոմային ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների փոփոխությունները: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է FISH-ի և CGH-ի միջև:
Ավելին, FISH-ը պահանջում է նախնական իմացություն թիրախային աննորմալության մասին զոնդերի հաջորդականությունները նախագծելու համար, մինչդեռ CGH-ը չի պահանջում նախնական գիտելիքներ: Բացի այդ, FISH-ի և CGH-ի միջև հետագա տարբերությունն այն է, որ FISH-ը ցույց է տալիս սահմանափակ լուծաչափ, մինչդեռ aCGH-ը ցույց է տալիս բարձր լուծաչափ:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ամփոփում է FISH-ի և CGH-ի տարբերությունը:
Ամփոփում – FISH vs CGH
FISH-ը և CGH-ը երկու մոլեկուլային ցիտոգենետիկ տեխնիկա են, որոնք հեշտացնում են հետաքրքրող գենային հաջորդականությունների հայտնաբերումը: FISH-ը հեշտացնում է քրոմոսոմի վրա հատուկ ԴՆԹ-ի հաջորդականության հայտնաբերումը, օգտագործելով լյումինեսցենտային պիտակավորված զոնդերը, մինչդեռ CGH-ն հեշտացնում է գենոմային ԴՆԹ-ում փոփոխությունների հայտնաբերումը: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է FISH-ի և CGH-ի միջև:
