Հիմնական տարբերություն – միկրոզանգվածն ընդդեմ հաջորդ սերնդի հաջորդականության
ԴՆԹ-ի հաջորդականացման գործընթացները լայնորեն օգտագործվում են կենսատեխնոլոգիայի, վիրուսաբանության, բժշկական ախտորոշման և դատաբժշկական գիտությունների ոլորտներում: Դա մի գործընթաց է, որը որոշում է ԴՆԹ-ի մոլեկուլում առկա նուկլեոտիդների, ադենինի, գուանինի, թիմինի և ցիտոզինի ճշգրիտ կարգը: ԴՆԹ-ի հաջորդականության ընթացակարգերը դարձել են բժշկական և կենսաբանական հետազոտությունների հրաշք հայտնագործությունների արագացուցիչ: Այս հաջորդականության մեթոդները զարգացել են մինչև առանձին օրգանիզմների ամբողջական գենոմի հաջորդականությունը, ներառյալ մարդկանց և այլ կենդանի տեսակները: Microarrays-ը և Next Generation Sequencing-ը ԴՆԹ-ի հաջորդականացման ժամանակակից պրոցեդուրաներ են:Microarray տեխնիկան հատուկ հիմնված է հիբրիդացման վրա, որը պարունակում է մի շարք հայտնի թիրախներ: Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը հիմնված է սինթեզի վրա (որը օգտագործում է ԴՆԹ պոլիմերազը՝ նուկլեոտիդների մեջ ներառելու համար) և ունի ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը՝ անկախ նախկինում ընտրված թիրախներից: Սա հիմնական տարբերությունն է Microarray-ի և հաջորդ սերնդի հաջորդականության միջև:
Ի՞նչ է Microarray?
ԴՆԹ միկրոզանգվածն օգտագործվում է որպես լաբորատոր գործիք՝ միաժամանակ բացահայտելու հազարավոր տարբեր գեների արտահայտություններ: Այն ամուր մակերես է, այսինքն՝ մանրադիտակի սլայդ, որը պարունակում է դրա վրա տպված մանրադիտակային ԴՆԹ բծերի հավաքածու: Յուրաքանչյուր տպագիր կետ պարունակում է հայտնի գենային հաջորդականություն կամ գեն: Այս հայտնի զոնդերը, որոնք տպված են սլայդի վրա, ծառայում են որպես գեների արտահայտությունը հայտնաբերելու համար: Սա հայտնի է որպես տրանսկրիպտոմ: ԴՆԹ-ի երկու շղթաների միջև հիբրիդացումը հիմնական սկզբունքն է, որի վրա հիմնված են միկրոզանգվածները: Դա նուկլեինաթթուների հաջորդականությունների բազային զուգավորումն է՝ ջրածնային կապերի առաջացմամբ։
Նկար 01. միկրոզանգված
Սկզբում mRNA մոլեկուլները հավաքվում են փորձարարական նմուշից և առողջ անհատից ստացված տեղեկատու նմուշից: Փորձարարական նմուշներ են ստացվում հիվանդ անհատներից. օրինակ՝ քաղցկեղով տառապող անհատ: Ստանալուց հետո mRNA երկու նմուշներն էլ վերածվում են cDNA-ի (լրացուցիչ ԴՆԹ): Հաջորդը, յուրաքանչյուր նմուշ պիտակավորվում է լյումինեսցենտային զոնդի միջոցով: Լյումինեսցենտային զոնդերը տարբեր գույնի են՝ նմուշի cDNA-ն տեղեկատու cDNA-ից տարբերելու համար: Որպեսզի սկսվի cDNA-ի մոլեկուլների միացումը միկրոզանգվածի սլայդին, երկու նմուշները խառնվում են իրար: Հիբրիդացումն այն գործընթացն է, որով cDNA մոլեկուլները միանում են միկրոզանգվածի սլայդի ԴՆԹ-ի զոնդերին: Հիբրիդացումն ավարտվելուց հետո մի շարք ռեակցիաներ են տեղի ունենում՝ պարզելու և չափելու յուրաքանչյուր գենի էքսպրեսիան տարբեր գույների տեսքով՝ ըստ արտահայտված գենի քանակի:Միկրազանգվածի արդյունքներն օգտագործվում են գենային արտահայտման պրոֆիլի ստեղծման համար, որը կարող է օգտագործվել հիվանդության տարբեր պայմանները բացահայտելու համար:
Ի՞նչ է հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը:
Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS) գենետիկական հաջորդականության առաջադեմ մեթոդ է: Դրա սկզբունքը նման է Sanger Sequencing-ի սկզբունքին, որը կախված է մազանոթային էլեկտրոֆորեզից: NGS-ում գենոմային շարանը մասնատված է և միացված է կաղապարի շղթային: Յուրաքանչյուր շղթայի հիմքերը ճանաչվում են արտանետվող ազդանշաններով դրա կապակցման գործընթացում: Սանգերի հաջորդականության մեթոդում ներգրավված են երեք առանձին քայլեր՝ հաջորդականություն, տարանջատում և հայտնաբերում։ Այս առանձին քայլերի շնորհիվ նմուշի պատրաստման ավտոմատացումը սահմանափակ է թողունակությամբ: NGS-ում տեխնիկան մշակվել է՝ օգտագործելով զանգվածների վրա հիմնված հաջորդականությունը՝ Sanger-ի հաջորդականացման ընթացակարգի քայլերի համակցմամբ, ինչը կարող է պատճառ դառնալ, որ միլիոնավոր ռեակցիաների շարքերը միաժամանակ իրականացվեն։ սա հանգեցնում է բարձր արագության և թողունակության ցածր գնով:
Գծապատկեր 02. Զարգացումներ NGS-ում
NGS-ը կազմված է երեք քայլից. գրադարանի պատրաստում (գրադարանների ստեղծում ԴՆԹ-ի պատահական ֆրագմենտացիայի կիրառմամբ), ամպլիֆիկացում (գրադարանի ուժեղացում՝ կլոնային ամպլիֆիկացիայի և ՊՇՌ-ի միջոցով) և հաջորդականացում։ Գենոմի հաջորդականացման գործընթացները, որոնք իրականացվում են չափազանց երկար տևողությամբ Sanger-ի հաջորդականության միջոցով, կարող են ավարտվել մի քանի ժամում NGS-ի միջոցով:
Ո՞րն է նմանությունը միկրոզանգվածի և հաջորդ սերնդի հաջորդականության միջև:
Եվ Microarray, և Next Generation Sequencing մշակվել են զանգվածների վրա հիմնված հաջորդականության միջոցով:
Ո՞րն է տարբերությունը միկրոզանգվածի և հաջորդ սերնդի հաջորդականության միջև:
Միկրոզանգվածն ընդդեմ հաջորդ սերնդի հաջորդականության |
|
| Միկրոզանգվածը պինդ մակերեսին կցված ԴՆԹ-ի մանրադիտակային բծերի հավաքածու է, որն օգտագործվում է միաժամանակ մեծ թվով գեների արտահայտման մակարդակը չափելու համար: | NGS (Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը) ոչ Sanger-ի վրա հիմնված բարձր թողունակությամբ ԴՆԹ-ի հաջորդականության տեխնոլոգիա է, որը հեշտացնում է միլիոնավոր կամ միլիարդավոր ԴՆԹ շղթաների զուգահեռ հաջորդականությունը: |
| Փոխազդեցություն հակագենի հետ | |
| Միկրոզանգվածը հիմնված է հիբրիդացման վրա, որը կազմված է հայտնի թիրախներից: | NGS-ը հիմնված է սինթեզի վրա, որն օգտագործում է ԴՆԹ պոլիմերազը՝ նուկլեոտիդները ներառելու համար և անկախ է նախկինում ընտրված թիրախներից: |
Ամփոփում – Microarray ընդդեմ հաջորդ սերնդի հաջորդականության
Հետազոտության համատեքստում ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը դարձել է կարևոր արագացուցիչ: Այն լայնորեն կիրառվում է կենսատեխնոլոգիայի, բժշկական ախտորոշման և դատաբժշկական հետազոտությունների մեջ։ Այն զարգացել և վերածվել է ավելի արդյունավետ և արագ հաջորդականության ընթացակարգերի: Microarrays-ը և NGS-ը ԴՆԹ-ի հաջորդականության երկու առաջադեմ տեխնիկա են: Երկուսն էլ մշակվել են զանգվածների վրա հիմնված հաջորդականության միջոցով: Microarray տեխնիկան հենվում է հիբրիդացման վրա, մինչդեռ NGS-ը հիմնված է սինթեզի վրա, որն օգտագործում է ԴՆԹ պոլիմերազը՝ նուկլեոտիդներ ներառելու համար: Սա է հիմնական տարբերությունը Microarray-ի և Next Generation Sequencing-ի միջև:
Ներբեռնեք Microarray-ի PDF տարբերակը ընդդեմ հաջորդ սերնդի հաջորդականության
Դուք կարող եք ներբեռնել այս հոդվածի PDF տարբերակը և օգտագործել այն անցանց նպատակներով՝ ըստ մեջբերումների: Խնդրում ենք ներբեռնել PDF տարբերակը այստեղ Տարբերությունը Microarray-ի և հաջորդ սերնդի հաջորդականության միջև
