Հիմնական տարբերություն – Բակտերիալ տրանսպոզազներ ընդդեմ ռետրովիրուսային ինտեգրազների
Տեղափոխվող գենետիկական նյութը զարգացել է երկու հիմնական ռազմավարությամբ՝ տեղափոխելու մի շրջանից մյուս շրջան՝ գենոմների ներսում և միջև: Մեթոդներից մեկը ՌՆԹ մոլեկուլի միջով տեղաշարժվելն է մինչև ԴՆԹ մոլեկուլի ձևավորումը, մինչդեռ մյուս ճանապարհը ներառում է ԴՆԹ միջանկյալներ: Տրանսպոզազները և վիրուսային ինտեգրազները նման տեղափոխվող գենետիկական նյութի օրինակներ են: Բակտերիալ տրանսպոզազները կապվում են տրանսպոզոնների ծայրին և տարբեր մեխանիզմների միջոցով հեշտացնում են տրանսպոզոնների շարժման կատալիզացումը դեպի գենոմի մեկ այլ մաս։Ռետրովիրուսային ինտեգրազները ֆերմենտներ են, որոնք օգնում են ռետրովիրուսի գենետիկական նյութի ինտեգրմանը, ինչպիսին է ՄԻԱՎ-ը հյուրընկալող բջջի գենետիկ նյութին (ԴՆԹ), որը այն վարակում է: Սա հիմնական տարբերությունն է բակտերիալ տրանսպոզազների և ռետրովիրուսային ինտեգրազների միջև:
Ի՞նչ են բակտերիալ տրանսպոզազները:
Տրանսպոզազը կարող է սահմանվել որպես տրանսպոզոնների ծայրին կապված ֆերմենտ, որը տարբեր մեխանիզմների միջոցով հեշտացնում է տրանսպոզոնների շարժման կատալիզացումը դեպի գենոմի մեկ այլ մաս: Նման մեխանիզմները ներառում են «կտրել և կպցնել մեխանիզմը» և «վերարտադրող փոխադրման մեխանիզմը»: Տրանսպոզազը առաջին անգամ ներմուծվել է այն ֆերմենտի կլոնավորման միջոցով, որն անհրաժեշտ է Tn3 տրանսպոզոնի փոխադրման համար: Փոխադրվող գենետիկական տարրերի կողմից կիրառվել են երկու կարևոր ռազմավարություններ՝ գենոմների միջև կամ մի տեղամասից մյուսը տեղափոխելու համար: Փոխադրումը ՌՆԹ-ի միջանկյալ միջով մինչև ԴՆԹ-ի պատճենի սինթեզը մի ռազմավարություն է, մինչդեռ մյուսը կապված է միայն ԴՆԹ-ի միջանկյալ նյութերի հետ:Ռեկոմբինացիոն ռեակցիաները, որոնք ներգրավված են երկու տարրերի ինտեգրման մեջ, տեղի են ունենում տարրական հատուկ ֆերմենտների շնորհիվ: Այսպիսով, ԴՆԹ-ի տարրերի դեպքում այս ֆերմենտները հայտնի են որպես տրանսպոզազներ, մինչդեռ ՌՆԹ-ի տարրերի դեպքում դրանք հայտնի են որպես ինտեգրազներ:
Երկու տրանսպոզիցիոն ռազմավարությունների միջև տարբերությունները համեմատելիս, ներդրման գործընթացը քիմիապես նույնական է թվում: Սակայն վերջին ապացույցները ցույց են տալիս, որ ինտեգրման մեխանիզմի որոշակի նմանություններ նկատվում են ամինաթթուների հաջորդականությունների այն հատվածներում, որոնք կազմում են ակտիվ տեղամաս. DDE մոտիվը. Ներկայումս դասակարգվում են տրանսպոզազների հինգ ընտանիքներ, սակայն տրանսպոզազային նոր նիշերով ընտանիքների թիվը դեռ պետք է ավելանա: Ընտանիքները ներառում են DDE transposase, Tyrosine (Y) transposase, Serine (S) transposase, Rolling round transposase, Reverse transcriptases/endonucleases (RT/En) և այլն։DDE transposase-ն ներառում է սկզբնական տրանսպոզոնի կտրման և կպցնելու մեխանիզմը և կրում է պահպանված ամինաթթուների երեք խումբ, մասնավորապես. ասպարտատ (D), ասպարտատ (D) և գլուտամատ (E): Թիրոզինի տրանսպոզազները նաև ներգրավված են կտրման և մածուկի մեխանիզմում՝ օգտագործելով տիրոզինի մնացորդը, որը հատուկ է տեղանքին:
Նկար 01. Բակտերիալ տրանսպոզազներ
Սերինային տրանսպոզազները ներառում են շրջանաձև ԴՆԹ-ի միջանկյալ նյութ և իրականացնում են կտրման և կպցնելու մեխանիզմը ճիշտ այնպես, ինչպես վերը նշված ընտանիքներում: Գլորվող շրջանի տրանսպոզազը ներգրավված է պատճենահանման մեխանիզմի մեջ, որտեղ մեկ շղթան ուղղակիորեն պատճենվում է թիրախային վայր՝ ԴՆԹ-ի վերարտադրության միջոցով: Սա ապահովում է, որ կաղապարի շարանը և պատճենված շարանը ունենան նոր սինթեզված թել:Հակադարձ տրանսկրիպտազներ/էնդոնուկլեազներ տրանսպոզազն ունի փոխադրման տարբեր մեխանիզմներ:
Ի՞նչ են ռետրովիրուսային ինտեգրազները:
Ռետրովիրուսային ինտեգրազի համատեքստում այն համարվում է որպես ռետրովիրուսային ֆերմենտ, որն օգնում է ռետրովիրուսի գենետիկական նյութի ինտեգրմանը, ինչպիսին է ՄԻԱՎ-ը վարակված բջջի գենետիկ նյութին (ԴՆԹ): Այս ռետրովիրուսային ինտեգրազները ամենից հաճախ շփոթվում են ֆագային ինտեգրազների հետ: Ֆագային ինտեգրազների օրինակներ են λ ֆագային ինտեգրազը։ Բայց սրանք բոլորովին այլ ֆերմենտներ են, որոնց հետ չպետք է շփոթել: Ռետրովիրուսային նախաինտեգրացիոն համալիրի ձևավորման առումով մեծ դեր է խաղում ռետրովիրուսային ինտեգրազը: Ռետրովիրուսային ինտեգրազային սպիտակուցները սովորաբար բաղկացած են երեք (03) կանոնական տիրույթներից: Այս տիրույթները միացված են ճկուն կապակցիչներով։
Երեք տիրույթները ներառում են N տերմինալ ցինկ կապող տիրույթ, որտեղ երեք պարուրաձև կապոցներ միացված և կայունացվում են համակարգման միջոցով Zn2+ կատիոնի, RNase H ծալքի ներգրավմամբ: կատալիտիկ միջուկային տիրույթ և C տերմինալ ԴՆԹ կապող տիրույթ, որը SH3 ծալք է:Հետազոտության և կենսաքիմիական և կառուցվածքային տեղեկատվության միջոցով այն ենթադրում է, որ ռետրովիրուսային ինտեգրազը կարող է գործել որպես դիմերների դիմեր (տետրամեր): Մուլտիմերացման և վիրուսային ԴՆԹ-ի կապի համատեքստում ռետրովիրուսային ինտեգրազային սպիտակուցի բոլոր երեք տիրույթները: Ռետրովիրուսային ինտեգրազի հիմնական գործառույթը իր գենետիկ նյութը հյուրընկալող ԴՆԹ-ի մեջ մտցնելն է: Այս քայլն ամենակարևոր քայլն է ՄԻԱՎ-ի վիրուսային վերարտադրության գործում: Հաջողությամբ ինտեգրվելուց հետո այն այնտեղ կմնա բջիջի քրոմոսոմային ԴՆԹ-ում իր կյանքի մնացած ժամանակահատվածում:
Գծապատկեր 02. Ռետրովիրուսային ինտեգրազներ
Հետևաբար, ինտեգրվելուց հետո բջիջի համար վերադարձ չկա: Այս ռետրովիրուսային ինտեգրազները ներառում են երկու հիմնական ռեակցիաների կատալիզացում, ներառյալ 3' վերջի մշակումը և կովալենտային կապումը:3' վերջի մշակման ժամանակ վիրուսային ԴՆԹ-ի երկու 3' ծայրերից 2-3 նուկլեոտիդներ են հեռացվում՝ վիրուսի ԴՆԹ-ի 3' ծայրերի CA դինուկլեոտիդները բացահայտելու նպատակով, իսկ կովալենտային կապակցման ժամանակ՝ մշակված 3' ծայրերը: վիրուսային ԴՆԹ-ն կովալենտորեն կապվում է հյուրընկալող քրոմոսոմային ԴՆԹ-ի մեջ։
Ո՞րն է նմանությունը բակտերիալ տրանսպոզազների և ռետրովիրուսային ինտեգրազների միջև:
Եվ բակտերիալ տրանսպոզազները և ռետրովիրուսային ինտեգրազները ունեն նմանատիպ ամինաթթուների հաջորդականություն:
Ո՞րն է տարբերությունը բակտերիալ տրանսպոզազների և ռետրովիրուսային ինտեգրազների միջև:
Բակտերիալ տրանսպոզազներ ընդդեմ ռետրովիրուսային ինտեգրազների |
|
| Բակտերիալ տրանսպոզազը ֆերմենտ է, որը կապված է տրանսպոզոնների ծայրին, մինչդեռ հեշտացնում է տրանսպոզոնների շարժման կատալիզացումը դեպի գենոմի մեկ այլ մաս տարբեր մեխանիզմների միջոցով: | Ռետրովիրուսային ինտեգրազները համարվում են որպես ռետրովիրուսային ֆերմենտ, որն օգնում է ռետրովիրուսի գենետիկական նյութի ինտեգրմանը, ինչպիսին է ՄԻԱՎ-ը վարակված բջջի գենետիկ նյութին (ԴՆԹ):: |
| Պարտադիր շրջաններ | |
| Բակտերիալ տրանսպոզազների համար անհրաժեշտ են բարձր հատուկ կապող շրջաններ: | Կապելու համար անհրաժեշտ է նուկլեոտիդային հաջորդականության պակաս կամ ընդհանրապես բացակայում: |
Ամփոփում – Բակտերիալ տրանսպոզազներ ընդդեմ ռետրովիրուսային ինտեգրազների
Բակտերիալ տրանսպոզազները համարվում են որպես ռետրովիրուսային ֆերմենտ, որն օգնում է ռետրովիրուսի գենետիկական նյութի ինտեգրմանը, ինչպիսին է ՄԻԱՎ-ը վարակված բջջի գենետիկ նյութին (ԴՆԹ): Փոխադրվող գենետիկական տարրերի կողմից կիրառվել են երկու կարևոր ռազմավարություններ՝ գենոմների միջև կամ մի տեղամասից մյուսը տեղափոխելու համար:Ներկայումս դասակարգվում են տրանսպոզազների հինգ ընտանիքներ, սակայն տրանսպոզազային նոր նիշերով ընտանիքների թիվը դեռ պետք է ավելանա: Retroviral Integrase, այն համարվում է որպես ռետրովիրուսային ֆերմենտ, որն օգնում է ռետրովիրուսի գենետիկական նյութի ինտեգրմանը, ինչպիսին է ՄԻԱՎ-ը վարակված բջջի գենետիկ նյութին (ԴՆԹ): Ռետրովիրուսային ինտեգրազային սպիտակուցները սովորաբար բաղկացած են երեք (03) կանոնական տիրույթներից: Ռետրովիրուսային ինտեգրազի հիմնական գործառույթը իր գենետիկ նյութը հյուրընկալող ԴՆԹ-ի մեջ մտցնելն է: Այս քայլն ամենակարևոր քայլն է ՄԻԱՎ-ի վիրուսային վերարտադրության գործում: Հետևաբար, ինտեգրվելուց հետո բջիջի համար վերադարձ չկա: Սա է տարբերությունը բակտերիալ տրանսպոզազների և ռետրովիրուսային ինտեգրազի միջև:
Ներբեռնեք բակտերիալ տրանսպոզազների PDF-ն ընդդեմ ռետրովիրուսային ինտեգրազների
Դուք կարող եք ներբեռնել այս հոդվածի PDF տարբերակը և օգտագործել այն անցանց նպատակներով՝ ըստ մեջբերումների: Խնդրում ենք ներբեռնել PDF տարբերակը այստեղ. Տարբերությունը բակտերիալ տրանսպոզազների և ռետրովիրուսային ինտեգրազների միջև
