Հիմնական տարբերություն – Proteomics ընդդեմ Transcriptomics
Օմիկ տեխնոլոգիան արդի միտում է, որտեղ օրգանիզմի տարբեր բիոմոլեկուլները դիտարկվում են որպես ամբողջ հավաքածու՝ կապված նրա հատկությունների և գործառույթների հետ: Omic տեխնոլոգիան ունի կիրառությունների լայն շրջանակ: Կենսաբանական նմուշի տարբեր օմիկան ներառում է գենոմիկա, պրոտեոմիկա, տրանսկրիպտոմիկա և նյութափոխանակություն: Proteomics-ը ներառում է կենդանի օրգանիզմի բոլոր սպիտակուցների ամբողջական ուսումնասիրությունը: Այն սահմանվում է որպես օրգանիզմի բոլոր արտահայտված սպիտակուցների ամբողջություն, նրա կառուցվածքային և ֆունկցիոնալ հատկություններ: Այսպիսով, սպիտակուցների ամբողջական փաթեթը կազմում է պրոտեոմը:Տրանսկրիպտոմիկան կենդանի օրգանիզմում առկա բոլոր սուրհանդակային ՌՆԹ-ի (mRNA) մոլեկուլների ամբողջական ուսումնասիրությունն է: Այսպիսով, տրանսկրիպտոմիկան զբաղվում է գեներով, որոնք ակտիվորեն արտահայտվում են կենդանի օրգանիզմում։ Կենդանի օրգանիզմում mRNA-ի ընդհանուր հավաքածուն կոչվում է տրանսկրիպտոմ: Proteomics-ի և Transcriptomics-ի հիմնական տարբերությունը հիմնված է բիոմոլեկուլի տեսակի վրա: Պրոտեոմիկայի մեջ ուսումնասիրվում է կենդանի օրգանիզմում արտահայտված սպիտակուցների ընդհանուր հավաքածուն, մինչդեռ տրանսկրիպտոմիկայի մեջ ուսումնասիրվում է կենդանի օրգանիզմի ընդհանուր mRNA-ն:
Ի՞նչ է Proteomics?
Պրոտեոմիկա տերմինը ստեղծվել է 1995 թվականին և ի սկզբանե սահմանվել է որպես բջջի, հյուսվածքի կամ օրգանիզմի ընդհանուր սպիտակուցային հավելում: Պրոտեոմիական ուսումնասիրությունների առաջընթացով այն այնուհետև փոփոխվեց, որպեսզի այն դիտարկվի որպես համապարփակ տերմին, որտեղ ներառված էին բազմաթիվ ուսումնասիրությունների ոլորտներ: Ներկայումս պրոտեոմիկա թեմայով ուսումնասիրվում են կառուցվածքը, կողմնորոշումը, ֆունկցիաները, փոխազդեցությունները, փոփոխությունները, կիրառությունները և սպիտակուցների կարևորությունը։Հետևաբար, ներկայումս շատ հետազոտություններ են իրականացվում պրոտեոմիկայի ոլորտում։
Առաջին պրոտեոմիական ուսումնասիրությունները կատարվել են Escherichia coli-ում սպիտակուցի պարունակությունը պարզելու համար: Ընդհանուր սպիտակուցի պարունակության քարտեզագրումը կատարվել է երկչափ (2D) գելերի միջոցով: Հաջողությունից հետո գիտնականները սկսեցին բնութագրել ընդհանուր սպիտակուցի պարունակությունը կենդանիների մեջ, ինչպիսիք են ծովախոզուկները և մկները: Ներկայումս մարդու սպիտակուցի քարտեզագրումը կատարվում է գելային 2D էլեկտրոֆորեզի միջոցով:
Proteomics-ի կիրառությունները
Կան պրոտեոմիկայի ուսումնասիրության բազմաթիվ առավելություններ, քանի որ սպիտակուցները ակտիվության մեծ մասի կառավարող մոլեկուլներն են՝ շնորհիվ սպիտակուցների կատալիզատորի հատկության: Այսպիսով, ամբողջական սպիտակուցների ուսումնասիրությունը կարող է տեղեկատվություն տրամադրել օրգանիզմի առողջական վիճակի վերաբերյալ: Որոշ հավելվածներ են;
- Գենոմի անոտացիա. Ուսումնասիրելով օրգանիզմի սպիտակուցի պարունակությունը՝ կարելի է որոշել ակտիվ սպիտակուցային միացության համար պատասխանատու ճշգրիտ գենոմները: Այս սցենարում բոլոր գենոմիկայի արդյունքները, տրանսկրիպտոմիկան և պրոտեոմիկան կարևոր են:
- Հիվանդության նույնականացում / Ախտորոշում. Proteomics-ը օգտագործվում է հիվանդության վիճակի նույնականացման համար՝ համեմատելով առողջներին և հիվանդներին
- Փորձերի ընթացքում ուսումնասիրված սպիտակուցային արտահայտություն իրականացնելու համար:
- Սպիտակուցների մոդիֆիկացիաներ և փոխազդեցության ուսումնասիրություններ. սպիտակուցներ in vitro կամ in vivo պայմաններում օգտագործելու համար, որոշելու այս արդյունահանվող սպիտակուցների պահպանման պայմանները և ուսումնասիրելու սպիտակուցի վարքագիծը in vitro, in vivo և in – սիլիկո մեթոդներ։
Նկար 01. Proteomics
Գոյություն ունեն պրոտեոմիկայի մեջ ներգրավված տարբեր տեխնիկա
- Ընդհանուր սպիտակուցի արդյունահանում և սպիտակուցների բաժանում 2D գելային էլեկտրոֆորեզի միջոցով: Սպիտակուցները կարող են նաև առանձնացվել բարձր արդյունավետության հեղուկ քրոմատագրման միջոցով (HPLC):
- Արդյունահանված սպիտակուցների հաջորդականություն՝ օգտագործելով այնպիսի մեթոդներ, ինչպիսիք են Էդմունդի հաջորդականության մեթոդը կամ զանգվածային սպեկտրոմետրիան:
- Հերթականությունները նույնականացնելուց հետո սպիտակուցի պարունակության կառուցվածքային և ֆունկցիոնալ հատկությունները վերլուծվում են համակարգչային ծրագրերի և կենսաինֆորմատիկայի գործիքների միջոցով:
Ի՞նչ է Տրանսկրիպտոմիկան:
Տրանսկրիպտոմային տերմինը ստեղծվել է վերջերս: Տրանսկրիպտոմիկան օրգանիզմի ընդհանուր mRNA պարունակության ուսումնասիրությունն է։ Ընդհանուր mRNA-ն կենդանի օրգանիզմի կամ բջջի արտահայտված ԴՆԹ-ն է: mRNA-ի ամբողջական հավաքածուն կոչվում է տրանսկրիպտոմ:
Տրանսկրիպտոմի վերլուծությանն ուղղված քայլերը ներառում են՝
- ՌՆԹ-ի արդյունահանում, mRNA-ի առանձնացում՝ օգտագործելով սյունակային գելային քրոմատոգրաֆիա պոլի DT ուլունքներով:
- MRNA-ի հաջորդականությունը կատարված է:
Միկրոզանգվածի տեխնոլոգիան օրգանիզմի տրանսկրիպտոմի նույնականացման սովորական եղանակներից մեկն է: Microarray տեխնիկան ներառում է զոնդային ափսե տրանսկրիպտոմի լրացուցիչ շղթաներով: Հիբրիդացումից հետո օրգանիզմում կամ բջիջներում առկա mRNA-ն կարող է բնութագրվել:
Նկար 02. Տրանսկրիպտոմիական տեխնիկա
Տրանսկրիպտոմիկան այժմ լայնորեն կիրառվում է բժշկական ոլորտում: Հիվանդությունների ախտորոշումը և հիվանդության պրոֆիլավորումը հիմնական ոլորտներն են, որոնցում օգտագործվում է Տրանսկրիպտոմիկան: Օրգանիզմի տրանսկրիպտոմի վերլուծությամբ կարելի է ճանաչել օտար մՌՆԹ-ն, իսկ վարակների առկայության դեպքում՝ այն: Ոչ կոդավորող ՌՆԹ-ն կարելի է առանձնացնել տրանսկրիպտոմիկ տեխնոլոգիաների միջոցով: Եվ նաև գեների արտահայտվածությունը շրջակա միջավայրի տարբեր սթրեսների ներքո կարող է վերահսկվել:
Որո՞նք են նմանությունները պրոտեոմիկայի և տրանսկրիպտոմիկայի միջև:
- Երկուսն էլ կազմում են omic տեխնոլոգիայի հայեցակարգի մի մասը:
- Երկուսն էլ օգտագործվում են հիվանդությունների ախտորոշման և օրգանիզմի հիվանդությունների բնութագրման մեջ:
- Ուսումնասիրված երկու ոլորտներն էլ ներառում էին բիոմոլեկուլի արդյունահանումը, բիոմոլեկուլի առանձնացումը և հաջորդականության փուլերը:
Ո՞րն է տարբերությունը պրոտեոմիկայի և տրանսկրիպտոմիկայի միջև:
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Պրոտեոմիքս ներառում է կենդանի օրգանիզմի բոլոր սպիտակուցների ամբողջական ուսումնասիրությունը: | Transcriptomics-ը կենդանի օրգանիզմում առկա բոլոր սուրհանդակային ՌՆԹ (mRNA) մոլեկուլների ամբողջական ուսումնասիրությունն է: |
| Ուսումնասիրված կենսամոլեկուլի տեսակը | |
| Սպիտակուցներն ուսումնասիրվում են պրոտեոմիկայի մեջ: | mRNA-ն ուսումնասիրվում է տրանսկրիպտոմիկայի մեջ: |
| Ուսումնասիրված գործոններ | |
| Սպիտակուցների կառուցվածքը, գործառույթը, փոխազդեցությունները, փոփոխությունները և կիրառությունները ուսումնասիրվում են պրոտեոմիկայի մեջ: | Հաջորդականության կառուցվածքը, միջավայրի հետ փոխազդեցությունը և mRNA-ի կիրառությունները ուսումնասիրվում են տրանսկրիպտոմիկայի մեջ: |
Ամփոփում – Proteomics vs Transcriptomics
Օմիքսները կարևոր դեր են խաղում կենսագիտության ոլորտում: Proteomics-ը վերաբերում է պրոտեոմի ուսումնասիրությանը, որը կազմում է բջջի կամ օրգանիզմի սպիտակուցների ամբողջական հավաքածուն: Տրանսկրիպտոմիկան վերաբերում է տրանսկրիպտոմի ուսումնասիրությանը, որը արտահայտված ԴՆԹ-ի ամբողջական հավաքածուն է, որը mRNA-ի տեսքով է: Ուսումնասիրության երկու ոլորտները՝ պրոտեոմիկան և տրանսկրիպտոմիկան, ստացվել են գենոմիկայի ներդրումից հետո և ներկայումս լայնորեն օգտագործվում են բժշկական ախտորոշման և օրգանիզմների բնութագրման և զննման մեջ: Սա է տարբերությունը պրոտեոմիկայի և տրանսկրիպտոմիկայի միջև։
Ներբեռնեք Proteomics vs Transcriptomics-ի PDF-ը
Դուք կարող եք ներբեռնել այս հոդվածի PDF տարբերակը և օգտագործել այն անցանց նպատակներով՝ ըստ մեջբերումների: Խնդրում ենք ներբեռնել PDF տարբերակը այստեղ. Տարբերությունը պրոտեոմիկայի և տրանսկրիպտոմիկայի միջև
