Կոնսենսուս PCR-ի և pan PCR-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ կոնսենսուսային PCR-ը միշտ ուղղված է պահպանված շրջաններին, մինչդեռ Pan PCR-ն ուղղված է փոփոխական շրջաններին՝ խմբի տարբեր շտամները հայտնաբերելու համար:
Պոլիմերազային շղթայական ռեակցիան (PCR) գեների ամպլիֆիկացիայի տեխնիկա է, որը բաղկացած է երեք հիմնական քայլերից՝ դենատուրացիա, կռում և երկարացում: Սա լայնորեն օգտագործվում է ախտորոշման և մոլեկուլային նույնականացման մեջ: Consensus PCR և Pan PCR տեխնիկան հիմնված է պրայմերային թիրախների վրա, որոնք օգտագործում է յուրաքանչյուր PCR տեսակ:
Ի՞նչ է Consensus PCR?
Կոնսենսուս ՊՇՌ-ն ՊՇՌ տեխնիկա է, որն ուղղված է որոշակի տեսակի կամ սեռի պահպանված շրջանին:Ուստի ուժեղացման համար ընտրվում են խիստ պահպանված շրջաններ: Այս մեթոդի միջոցով օրգանիզմներին կարելի է ճանաչել և տարբերակել՝ ելնելով նրանց կոնսենսուսից: Այս մեթոդը սահմանում է որոշակի տեսակի պահպանված տարածք: Օրինակ, բակտերիաների 16s rRNA շրջանը մնում է պահպանված տարածք բակտերիաների մեջ: Հետեւաբար, ուժեղացման համար պահանջվում է միայն մեկ այբբենարանի հավաքածու: Շատ դեպքերում պահպանված տարածքի համար կարող է օգտագործվել ունիվերսալ այբբենարան:
Նկար 01. PCR տեխնիկա
Կոնսենսուս ՊՇՌ մեթոդին հետևելով՝ տեսակների բնութագրումը և էվոլյուցիոն հարաբերությունները կարելի է եզրակացնել: Հիմք ընդունելով որոշակի նմուշի օրգանիզմի ուժեղացման արդյունավետությունը, կարելի է նաև եզրակացնել, որ օրգանիզմի կոնսենսուսը խմբի նկատմամբ: Ավելին, կոնսենսուսային ՊՇՌ-ի անցկացումը կենսական նշանակություն ունի ֆիլոգենետիկ հետազոտություններում:Այն թույլ է տալիս նույնականացնել տեսակը և մեկնաբանում է որոշակի օրգանիզմի շեղումը, որը ցույց է տրված ընդհանուր նախնիների առումով:
Ի՞նչ է Pan PCR?
Pan PCR-ը PCR-ի մուլտիպլեքսավորման եղանակ է: Այս տեխնիկայում տարբեր շտամներ ուժեղացվում են՝ օգտագործելով տարբեր այբբենարանային թիրախներ: Թիրախները, այնուամենայնիվ, կարող են լինել ընդհանուր թիրախներ շտամային խմբերի համար: Այսպիսով, Pan PCR-ում միաժամանակ կարող են օգտագործվել ավելի քան երկու այբբենարաններ: Այն կարող է տեղի ունենալ մեկ խողովակային ռեակցիայի մեթոդով կամ որպես բազմախողովակային ռեակցիայի մեթոդ: Pan PCR-ն ավելի ժամանակատար և ավելի բարդ է՝ համեմատած կոնսենսուսային PCR-ի հետ: Այս պատճառով, PCR-ի արդյունքների մեկնաբանումը կարող է նաև ավելի բարդ լինել Pan PCR-ում:
Pan PCR-ի հիմնական կիրառությունը մոլեկուլային ախտորոշման մեջ է: Այն հնարավորություն է տալիս տարբերակել տեսակների տարբեր շտամները թիրախային ուժեղացման միջոցով: Pan PCR-ը իդեալական մեթոդ է հիվանդություն առաջացնող մեկ տեսակի տարբեր շտամները հայտնաբերելու համար: Շատ դեպքերում, տարբեր առողջական պայմանների համար Pan PCR տեխնիկայի ավտոմատացումը շատ կարևոր է և հուսալի և բարձր արդյունավետ տեխնիկա է:
Որո՞նք են նմանությունները Consensus PCR-ի և Pan PCR-ի միջև:
- Consensus PCR-ը և Pan PCR-ը PCR տեխնիկայի երկու տեսակ են:
- Երկու պրոցեդուրաներն էլ հետևում են ընդհանուր եռաստիճան պրոցեդուրան՝ դենատուրացիա, եռացում և երկարացում:
- Նրանք օգտագործում են թիրախային պրայմերներ։
- Երկու ռեակցիաներն էլ տեղի են ունենում ջերմային ցիկլերի մեջ:
- Այս ռեակցիաները կարող են ավտոմատացված լինել:
- Երկուսն էլ կարող են օգտագործվել մոլեկուլային ախտորոշման և նույնականացման մեջ. այնուամենայնիվ, ճշգրտությունը տատանվում է։
- Այս ընթացակարգերը պահանջում են վավերացում:
Ո՞րն է տարբերությունը Consensus PCR-ի և Pan PCR-ի միջև:
Եվ Consensus-ը և Pan PCR-ն հետևում են նույն սովորական ընթացակարգին: Այնուամենայնիվ, կոնսենսուսային PCR-ի և Pan PCR-ի միջև հիմնական տարբերությունը հիմնված է յուրաքանչյուր ընթացակարգի օգտագործած այբբենարանի թիրախների վրա: Մինչ կոնսենսուսային PCR-ը միշտ ուղղված է պահպանված շրջաններին, Pan PCR-ն ուղղված է փոփոխական շրջաններին՝ խմբի տարբեր շտամները հայտնաբերելու համար:Այս տարբերության պատճառով տատանվում են այբբենարանի նախագծման արձանագրությունները, օգտագործվող այբբենարանների հավաքածուների քանակը և հատուկ կիրառությունները։
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ամփոփում է տարբերությունը Consensus PCR-ի և Pan PCR-ի միջև:
Ամփոփում – Consensus PCR ընդդեմ Pan PCR
Mulli-ի կողմից ներկայացված PCR-ն կարևոր հեղափոխական դեր է խաղում մոլեկուլային կենսաբանության կիրառություններում: Consensus-ը և Pan PCR-ը PCR-ի երկու տեսակ են՝ հիմնված իրենց պրայմերային թիրախային շրջանների վրա: Թեև կոնսենսուսային PCR-ն ուղղված է պահպանված շրջաններին, Pan PCR-ն ուղղված է փոփոխական շրջաններին և կարևոր դեր է խաղում շտամների նույնականացման գործում: Համաձայն PCR-ի և Pan PCR-ի միջև այս հիմնական տարբերության պատճառով PCR-ի յուրաքանչյուր տեսակի հատուկ գործառույթները նույնպես տարբերվում են ֆիլոգենետիկ վերլուծությունից մինչև մոլեկուլային բնութագրում մինչև մոլեկուլային ախտորոշում:
