Հիմնական տարբերություն – Գենոտիպավորում ընդդեմ հաջորդականության
Գենոտիպավորումը և հաջորդականությունը երկու տեխնիկա են, որոնք իրականացվում են նուկլեինաթթուների, հիմնականում օրգանիզմի ԴՆԹ-ի մասին տեղեկություններ ստանալու համար: Գենոտիպավորման և հաջորդականության հիմնական տարբերությունն այն է, որ գենոտիպավորումը մարկերների միջոցով որոշելու, թե որ գենետիկ տարբերակն ունի անհատը, մինչդեռ հաջորդականությունը նուկլեոտիդային հաջորդականության ճիշտ կարգի որոշումն է ԴՆԹ-ի տվյալ հատվածում::
Ի՞նչ է գենոտիպավորումը:
Գենոտիպավորումը անհատի գենետիկական կառուցվածքի որոշումն է՝ օգտագործելով ԴՆԹ-ի և մարկերների հաջորդականությունը և դրա ժառանգության համեմատությունն ու նույնականացումը:Գենոտիպավորումը կարևոր է էվոլյուցիոն կենսաբանության, բնակչության կենսաբանության, տաքսոնոմիայի, էկոլոգիայի և օրգանիզմների գենետիկայի մեջ: Այն կարող է իրականացվել տարբեր մեթոդներով, ներառյալ ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը, պոլիմերազային շղթայական ռեակցիան, սահմանափակող հատվածի երկարության պոլիմորֆիզմը (RFLP), պատահական ուժեղացված պոլիմորֆ հայտնաբերումը, ընդլայնված հատվածի երկարության պոլիմորֆիզմը (AFLP), ԴՆԹ միկրոզանգվածները և այլն:
Գենոտիպավորումը ներառում է ԴՆԹ-ի որոշակի փոքր բեկորների հաջորդականությունը և գենետիկական մարկերների միջոցով գենետիկական կազմի առնչության հայտնաբերումը այլ անհատների հետ: Այն որոշում է առանձին նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմները (SNPs) անհատների կամ հատուկ ալելների միջև: Գենոտիպավորումը կիրառելի է օրգանիզմների լայն շրջանակի համար, ներառյալ մարդկանց: Այն կիրառելի է նաև այնպիսի միկրոօրգանիզմների համար, ինչպիսիք են վիրուսները, սնկերը և այլն, և կարող է օգտագործվել՝ որոշելու դրանց գենետիկ տարբերակները՝ հղումային պրոֆիլներով: Մոլեկուլային համաճարակաբանության և դատաբժշկական մանրէաբանության մեջ պաթոգենների, հատկապես միկրոօրգանիզմների վերահսկումն իրականացվում է գենոտիպավորումից ստացված տեղեկատվության միջոցով:Գենոտիպավորումը շատ կարևոր է տոհմային վերլուծության մեջ: Մարդկանց գենոտիպավորումը հաստատում է մայրությունն ու հայրությունը: Գենոտիպը կբացահայտի գեների գերիշխող և ռեցեսիվ ալելները, որոնք որոշում են հատուկ գծերը:
Գծապատկեր_1. RFLP Genotyping
Ի՞նչ է հաջորդականությունը:
Հերթականությունը ԴՆԹ-ի կամ ՌՆԹ-ի տվյալ հատվածում նուկլեոտիդի ճիշտ կարգի որոշման գործընթացն է: Օրգանիզմի աճի և զարգացման համար անհրաժեշտ բոլոր տեղեկությունները կոդավորված են նրա գենոմում: Մի քանի հարյուր նուկլեոտիդների երկարությամբ նուկլեինաթթուների բեկորներ արտադրելու և առանձնացնելու տեխնիկայի առկայությունը հանգեցրեց ԴՆԹ-ի կամ ՌՆԹ-ի տվյալ հատվածի նուկլեոտիդների ճշգրիտ հաջորդականության որոշման ընթացակարգերի մշակմանը: Այսօրվա դրությամբ տարբեր տեսակի հաջորդականության մեթոդներ կան:Այս հաջորդականացման մեթոդները, օրգանիզմի ամբողջ գենոմը ներկայացնող գենոմային գրադարանների կառուցման տեխնոլոգիաների հետ միասին, հեշտացնում են այդ օրգանիզմի ամբողջ գենոմի հաջորդականացումը՝ կատարելով գենային կառուցվածքների, գենային ֆունկցիաների, գեների տեղակայման, գենային արտահայտությունների խորը վերլուծություն, գեների քարտեզագրում, գեների կարգավորող շրջաններ և այլն:
Բազմաթիվ վիրուսների, մի քանի բակտերիաների, արխեբակտերիաների, խմորիչների և մի քանի այլ օրգանիզմների ընդհանուր գենոմները հաջորդականացվել և քարտեզագրվել են: Մարդու գենոմի նախագիծը հնարավորություն է տվել հաջորդականացնել և քարտեզագրել ամբողջ մարդկային գենոմը և հրապարակել իր առաջին նախագիծը 2003 թվականին: Դա կենսաբանության առաջընթացի կարևորագույն փուլ է: Մարդու գենոմի հաջորդականությունները այժմ օգտագործվում են բժշկական ոլորտում՝ հայտնաբերելու հազվագյուտ հիվանդությունների գենետիկական պատճառները, նորածինների մոտ հիվանդության ռիսկը, տարբեր քաղցկեղների գենետիկական մանրամասները, նոր թերապևտիկ միջոցներ մշակելու և ախտորոշիչ նոր գործիքներ մշակելու և այլն:
Բուսական աշխարհում բրնձի գենոմի և Արաբիդոպսիսի գենոմները հաջորդականացվել են: Այս հաջորդականությունների իմացությունը, անկասկած, կհեղափոխի մեր ընկալումը, թե ինչպես են գործում բջիջները և օրգանիզմները:
Նկար_2. երգիչի հաջորդականության ավտոռադիոգրաֆիա
Ո՞րն է տարբերությունը գենոտիպավորման և հաջորդականության միջև:
Գենոտիպավորում ընդդեմ հաջորդականության |
|
| Գենոտիպավորումը անհատի գենետիկական կազմի որոշման և այդ օրգանիզմի խմբի կամ տաքսոնոմիայի ստուգման գործընթացն է։ | Հաջորդականությունը տվյալ ԴՆԹ-ի կամ ՌՆԹ-ի հատվածի նուկլեոտիդների ճշգրիտ կարգի որոշման գործընթացն է: |
| Տեխնիկա | |
| RFLP, գեների հաջորդականություն, PCR, ԴՆԹ միկրոզանգվածներ, AFLP և այլն: | Sanger հաջորդականություն, Gilbert sequencing, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Shotgun sequencing և այլն: |
| Խոշոր մտահոգություններ | |
| Սա ավելի շատ մտահոգված է նրանով, թե արդյոք գենոտիպային տարբերությունները տալիս են իրական ֆենոտիպային տարբերություններ: | Սա ավելի շատ մտահոգված է նուկլեոտիդների կարգով և դրանց տարբերություններով և փոփոխություններով այլ օրգանիզմների հետ: |
Ամփոփում – Գենոտիպավորում ընդդեմ հաջորդականության
Գենոտիպավորումը և հաջորդականությունը օգտակար են օրգանիզմների գենետիկական տեղեկատվության ուսումնասիրության համար։ Գենոտիպավորումը անհատների միջև գենոտիպային տատանումները որոշելու և նրանց կատեգորիաների հայտնաբերման գործընթացն է: Հերթականությունը հետաքրքրված հատվածում կամ ԴՆԹ-ի տարածաշրջանում նուկլեոտիդների ճիշտ կարգի որոշման գործընթաց է: Երկու տեխնիկան էլ կարևոր տեղեկություններ են տալիս գեների և գենոմների մասին։
