Իզոշիզոմերների և նեոշիզոմերների միջև հիմնական տարբերությունն այն է, որ իզոշիզոմերները սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը և ճեղքում են ԴՆԹ-ն նույն դիրքերում, մինչդեռ նեոշիզոմերները սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը, բայց կտրում են ԴՆԹ-ն տարբեր դիրքերում:.
Սահմանափակող ֆերմենտները կամ սահմանափակող էնդոնուկլեազները ֆերմենտներ են, որոնք ԴՆԹ-ն բաժանում են բեկորների հատուկ ճանաչման վայրերում կամ մոտակայքում: Նրանք կտրում են ԴՆԹ-ն սահմանափակման վայրերում: Սահմանափակող ֆերմենտները սովորաբար դասակարգվում են հինգ խմբի՝ ելնելով կառուցվածքից, թե արդյոք նրանք կտրում են իրենց ԴՆԹ-ի ենթաշերտը իրենց ճանաչման վայրում, և արդյոք ճանաչման և ճեղքման վայրերը միմյանցից անջատ են:Արդեն հայտնաբերվել են ավելի քան 3600 սահմանափակող էնդոնուկլեազներ։ Մոտ 800 սահմանափակող ֆերմենտներ հասանելի են առևտրային շուկայում: Իզոշիզոմերները և նեոշիզոմերները երկու տեսակի սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք հիմնված են ճանաչման վայրի և ճեղքման առանձնահատկությունների վրա:
Ի՞նչ են իզոշիզոմերները:
Իզոշիզոմերները սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը և ճեղքում են ԴՆԹ-ն նույն դիրքերում: Այս սահմանափակող ֆերմենտներն ունեն նույն առանձնահատկությունը: Առաջին հայտնաբերված սահմանափակող ֆերմենտը, որը ճանաչում է տվյալ հաջորդականությունը, հայտնի է որպես նախատիպ, մինչդեռ բոլոր հետագայում հայտնաբերված սահմանափակող ֆերմենտները, որոնք ճանաչում են այդ նույն հաջորդականությունը, կոչվում են իզոշիզոմերներ: Այնուամենայնիվ, իզոշիզոմերները կարող են տարբերվել տեղանքի նախապատվություններով, ռեակցիայի պայմաններով, մեթիլացման զգայունությամբ և աստղերի ակտիվությամբ: Իզոշիզոմերները մեկուսացված են բակտերիաների տարբեր շտամներից։ Հետեւաբար, նրանք կարող են պահանջել տարբեր ռեակցիայի պայմաններ: Որոշ դեպքերում, զույգ իզոշիզոմերներից միայն մեկը կարող է ճանաչել սահմանափակման վայրերի և՛ մեթիլացված, և՛ չմեթիլացված ձևերը:Մյուս կողմից, մյուս սահմանափակումային ֆերմենտը կարող է ճանաչել սահմանափակման վայրի միայն չմեթիլացված ձևը: Իզոշիզոմերների այս առանձնահատուկ առանձնահատկությունն օգնում է սահմանափակման վայրի մեթիլացման վիճակի բացահայտմանը, մինչդեռ այն առանձնացնում է բակտերիալ վիճակից:
Օրինակ, AgeI-ը և BshT1-ը ճանաչում և կտրում են 5'-A↓CCGGT-ը նույն ձևով: HpaII-ը և MSPI-ն իզոշիզոմերների այլ զույգեր են: Նրանք երկուսն էլ ճանաչում են 5'-C↓CGG-3' հաջորդականությունը, երբ այն չմեթիլացված է: Բայց երբ հաջորդականության երկրորդ C-ն մեթիլացված է, միայն MSPI-ն կարող է ճանաչել այս հաջորդականությունը, մինչդեռ HpaII-ը չի կարող ճանաչել այն:
Ի՞նչ են նեոշիզոմերները:
Նեոշիզոմերները սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը, բայց տարբեր դիրքերում կտրում են ԴՆԹ-ն: Որոշ հատուկ մոլեկուլային կենսաբանական կիրառություններում սա շատ օգտակար հատկություն է: Նեոսշիզոմերները իզոշիզոմերների ենթաբազմություն են։ Նեոշիզոմերների հայտնի օրինակներն են SmaI (5'-CCC↓GGG-3') և XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); երկուսն էլ ճանաչում են 5'-CCCGGG-3' հաջորդականությունը, բայց դրանք կտրում են այլ դիրքում:Այսպիսով, այս երկու սահմանափակող ֆերմենտները առաջացնում են տարբեր տեսակի ծայրեր: Այս դեպքում SmaI-ն առաջացնում է բութ ծայրեր, իսկ XmaI-ը՝ 5’ դուրս ցցված ծայրեր:
Նկար 01. Նեոշիզոմերներ
Մեկ այլ օրինակ է MaeII և Tail սահմանափակող ֆերմենտների զույգը: MaeII նախատիպը (A↓CGT) արտադրում է ԴՆԹ-ի բեկորներ 2-հիմք 5' ընդարձակումով, իսկ նեոշիզոմերի պոչը (ACGT↓) արտադրում է ԴՆԹ-ի բեկորներ 4-բազային 3' ընդլայնմամբ:
Որո՞նք են նմանությունները իզոշիզոմերների և նեոշիզոմերների միջև:
- Իզոշիզոմերները և նեոշիզոմերները երկու տեսակի սահմանափակող ֆերմենտներ են:
- Դրանք հիմնականում հանդիպում են պրոկարիոտների մոտ:
- Դրանք սահմանափակման-մոդիֆիկացիայի (RM) համակարգի մի մասն են, որը հայտնաբերված է բակտերիաներում և արխեաներում:
- Երկուսն էլ սպիտակուցի մոլեկուլներ են։
- Երկուսն էլ բաժանում են ԴՆԹ-ն բեկորների։
Ի՞նչ տարբերություն կա իզոշիզոմերների և նեոշիզոմերների միջև:
Իզոշիզոմերները սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը և կտրում են ԴՆԹ-ն նույն դիրքերում, մինչդեռ նեոշիզոմերները սահմանափակող ֆերմենտներ են, որոնք ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը, բայց տրոհում են ԴՆԹ-ն տարբեր դիրքերում: Այսպիսով, սա է իզոշիզոմերների և նեոշիզոմերների հիմնական տարբերությունը: Ավելին, իզոշիզոմերներն ունեն նույն առանձնահատկությունները, մինչդեռ նեոշիզոմերներն ունեն տարբեր առանձնահատկություններ:
Հետևյալ ինֆոգրաֆիկան ցույց է տալիս իզոշիզոմերների և նեոշիզոմերների միջև եղած տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – Isoschizomers vs Neoschizomers
Սահմանափակող ֆերմենտները ԴՆԹ կտրող ֆերմենտներ են: Դրանք նաև կոչվում են մոլեկուլային մկրատ: Կան տարբեր տեսակի սահմանափակող ֆերմենտներ:Ելնելով ճանաչման վայրից և ճեղքման առանձնահատկությունից՝ սահմանափակող ֆերմենտները լինում են երկու տեսակի՝ իզոշիզոմերներ և նեոշիզոմերներ: Իզոշիզոմերներն ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը և կտրում են ԴՆԹ-ն նույն դիրքերում, մինչդեռ նեոշիզոմերներն ունեն նույն ճանաչման հաջորդականությունը, բայց կտրում են ԴՆԹ-ն տարբեր դիրքերում: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է իզոշիզոմերների և նեոշիզոմերների միջև:
