ITS1-ի և ITS2-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ ITS1-ը տարածող ԴՆԹ է, որը գտնվում է էուկարիոտների 18S և 5.8S rRNA գեների միջև, մինչդեռ ITS2-ը էուկարիոտների 5.8S և 28S rRNA գեների միջև տեղակայված միջակայքային ԴՆԹ է:
Ներքին տրանսկրիպացված spacer-ը (ITS) տարածող ԴՆԹ-ն է, որը սովորաբար տեղակայված է փոքր ենթամիավորի ռիբոսոմային ՌՆԹ-ի և մեծ ենթամիավորի ռիբոսոմային ՌՆԹ-ի գեների միջև քրոմոսոմում կամ համապատասխան տառադարձված տարածքում՝ պոլիցիստրոնիկ rRNA պրեկուրսորի տառադարձման մոլեկուլում: Բակտերիաներում և արխեաներում կա միայն մեկ ITS 16S և 23S rRNA գեների միջև: Բայց էուկարիոտների մեջ կա երկու ITS տարածող ԴՆԹ՝ ITS1 (18S-ի և 5-ի միջև:8S rRNA գեներ) և ITS2 (5.8S-ի և 28S rRNA-ի միջև): Հետևաբար, ITS1-ը և ITS2-ը երկու տարածական ԴՆԹ են, որոնք հայտնաբերվել են էուկարիոտների rRNA գեների միջև:
Ի՞նչ է ITS1?
ITS1-ը տարածող ԴՆԹ է, որը գտնվում է էուկարիոտների 18S և 5.8S rRNA գեների միջև: ITS-ը վերաբերում է ոչ ֆունկցիոնալ spacer ԴՆԹ-ի մի կտորին, որը գտնվում է rRNA գեների միջև: ITS1-ն ունի երկարության ավելի մեծ տատանումներ, քան ITS2-ը: ITS1-ի երկարության տատանումները մոտավորապես (200-300bp) են: ITS մարկերները, ինչպիսիք են ITS1-ը, ապացուցել են իրենց արդյունավետությունը տարբեր տաքսոնների միջև ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների պարզաբանման գործում: Ավելին, ITS1 spacer ԴՆԹ-ն ավելի քիչ պահպանված է, քան ITS2 spacer ԴՆԹ-ն: ITS1 կառուցվածքները պահպանվում են միայն շատ ավելի փոքր տաքսոնոմիկ միավորներում: Յուրաքանչյուր էուկարիոտիկ ռիբոսոմային կլաստեր պարունակում է նաև տարածքներ, որոնք կոչվում են արտաքին տառադարձված միջատներ (5' և 3' ETS):
Նկար 01. ITS1 տարածաշրջան
ITS1 spacer ԴՆԹ-ն շատ մոտ է 5'արտաքին արտագրված spacer-ին (5' ETS): Ավելին, եթե որևէ մեկը ցանկանում է ուժեղացնել ITS1 տարածաշրջանը ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների ուսումնասիրության համար, նա պետք է օգտագործի հատուկ այբբենարան զույգ (հակադարձ և առաջնային այբբենարաններ) այդ նպատակով: ITS1 շրջանը ուժեղացնելու համար լաբորատորիաների PCR արձանագրություններում սովորաբար օգտագործվում են երկու այբբենարաններ: Դրանք ITS1 առաջ և ITS2 հակադարձ կամ ITS1 առաջ և ITS4 հակադարձ են:
Ի՞նչ է ITS2?
ITS2-ը տարածող ԴՆԹ է, որը գտնվում է էուկարիոտների 5.8S և 28S rRNA գեների միջև: ITS2 տարածաշրջանն ունի ավելի կարճ երկարության տատանումներ, քան ITS1 տարածաշրջանը: ITS2-ի երկարության տատանումները մոտավորապես (180-240bp) են: Այնուամենայնիվ, ITS2 շրջանն ավելի պահպանված է, քան ITS1 շրջանը շատ տաքսոնոմիկ միավորներում: Այն բացահայտում է, որ բոլոր ITS2 հաջորդականությունները կիսում են երկրորդական կառուցվածքի ընդհանուր միջուկը: Ավելին, ITS2 շրջանի 40%-ը պահպանված է բոլոր անգիոսպերմերի մեջ, մինչդեռ հնարավոր է ITS2 շրջանի 50%-ը հավասարեցնել ընտանիքի և ավելի բարձր մակարդակի վրա:
Նկար 02. ITS2 տարածաշրջան
Անկախ պահպանման շրջանակից, ITS2 շրջանի օգտագործումը նույնպես շատ տարածված է, ինչպիսին է ITS1 շրջանը ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների ուսումնասիրություններում, հատկապես սնկային ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորման մեջ: ITS2 շրջանը ուժեղացնելու համար լաբորատորիաների PCR արձանագրություններում սովորաբար օգտագործվում է հատուկ պրայմերների հավաքածու: Դա ITS1-ն է, իսկ ITS4-ը` հակառակը: Բայց երբ PCR արձանագրությունն օգտագործում է այս այբբենարանի հավաքածուն, այն նաև ուժեղացնում է ITS1 շրջանը ITS2 շրջանի հետ միասին: Ավելին, ITS2 spacer ԴՆԹ-ն շատ մոտ է 3'արտաքին արտագրված spacer-ին (3' ETS):
Նմանություններ ITS1-ի և ITS2-ի միջև
- ITS1 և ITS2 երկու տարածական ԴՆԹ են, որոնք տեղակայված են rRNA գեների միջև:
- Նրանք առկա են միայն էուկարիոտներում:
- Երկուսն էլ կարելի է ուժեղացնել՝ օգտագործելով հատուկ այբբենարաններ:
- Նրանք երկուսն էլ հեռացվում են rRNA-ի հասունացման ժամանակ որպես ոչ ֆունկցիոնալ կողմնակի արտադրանք:
- Երկուսն էլ շատ կարևոր են ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների ուսումնասիրության համար, հատկապես սնկային ԴՆԹ-ի շտրիխ կոդավորման համար:
Տարբերությունը ITS1-ի և ITS2-ի միջև
ITS1-ը տարածող ԴՆԹ է, որը առկա է էուկարիոտների 18S և 5.8S rRNA գեների միջև, մինչդեռ ITS2-ը տարածող ԴՆԹ է, որը գտնվում է էուկարիոտներում 5.8S և 28S rRNA գեների միջև: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է ITS1-ի և ITS2-ի միջև: Ավելին, ITS1-ն ունի ավելի մեծ երկարության տատանումներ՝ համեմատած ITS2-ի հետ: Մյուս կողմից, ITS2-ն ունի ավելի կարճ երկարության տատանումներ՝ համեմատած ITS1-ի հետ: Սա ևս մեկ տարբերություն է ITS1-ի և ITS2-ի միջև:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ցույց է տալիս ITS1-ի և ITS2-ի տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – ITS1 vs ITS2
Ներքին տրանսկրիպացված շրջանը (ITS) տարածող ԴՆԹ-ի ոչ ֆունկցիոնալ կտոր է, որը գտնվում է rRNA գեների միջև: Բակտերիաներում և արխեաներում կա միայն մեկ ITS շրջան:Բայց էուկարիոտների մեջ կան երկու ITS շրջաններ՝ ITS1 և ITS2: ITS1-ը տիեզերական ԴՆԹ է, որը գտնվում է էուկարիոտների 18S և 5.8S rRNA գեների միջև, մինչդեռ ITS2-ը տարածող ԴՆԹ է, որը գտնվում է էուկարիոտների 5.8S և 28S rRNA գեների միջև։ Այսպիսով, սա ITS1-ի և ITS2-ի միջև եղած տարբերության ամփոփումն է։
