dNTP-ի և ddNTP-ի հիմնական տարբերությունն այն է, որ dNTP-ն կամ դեզօքսիռիբոնուկլեոտիդները ԴՆԹ-ի կառուցման բլոկներն են և ունեն 3ʹ-OH խումբ պենտոզայի շաքարի կառուցվածքի վրա, մինչդեռ ddNTP կամ դիդեօքսինուկլեոզիդ տրիֆոսֆատները նուկլեոտիդներ են, որոնք չունեն 3ʹ-OH խումբ և օգտագործվում են Sanger դիդեօքսի ԴՆԹ-ի հաջորդականության տեխնիկայում՝ տարբեր երկարությամբ ԴՆԹ-ի հաջորդականություններ արտադրելու համար:
dNTP և ddNTP նուկլեոտիդներ են: dNTP-ն վերաբերում է դեզօքսիրիբոզային նուկլեոտիդներին: Դրանք ԴՆԹ-ի շինանյութերն են: dNTP-ները օգտագործվում են ԴՆԹ սինթեզելու համար: dNTP-ն, մյուս կողմից, վերաբերում է դիդեօքսինուկլեոզիդ տրիֆոսֆատներին: Դրանք օգտագործվում են Sanger հաջորդականության մեջ՝ դադարեցնելու ԴՆԹ սինթեզը տարբեր երկարություններով:Նրանք չունեն OH խումբ 3' դիրքում: 3ʹ դիրքում OH խմբի փոխարեն առկա է ջրածին: Հետևաբար, ddNTP-ները չեն կարողանում ֆոսֆոդիստերային կապ ստեղծել հաջորդ նուկլեոտիդի հետ։ dNTP-ն ի վիճակի է իրականացնել ԴՆԹ-ի սինթեզ, մինչդեռ ddNTP-ն կարող է դադարեցնել ԴՆԹ-ի պոլիմերացումը։
Ինչ է dNTP?
dNTP նշանակում է դեզօքսիրիբոզ նուկլեոտիդ կամ դեզօքսիռիբոնուկլեոտիդ: Դա ԴՆԹ-ի շինանյութն է: Կան չորս տեսակի dNTP: Դրանք են՝ dATP, dTTP, dCTP և dGTP։ Դրանք անվանվել են ըստ պուրինային կամ պիրիմիդինային ազոտային հիմքերի՝ ադենին (A), գուանին (G), թիմին (T) և ցիտոզին (C):
Նկար 01. dNTP
Ադենինը և գուանինը պուրինային հիմքեր են, մինչդեռ թիմինը և ցիտոզինը պիրիմիդինային հիմքեր են: dNTP-ի պենտոզային շաքարը դեզօքսիռիբոզ է:Կա նաև ֆոսֆատային խումբ։ Հետևաբար, dNTP-ն կազմված է երեք բաղադրիչներից՝ ազոտային հիմքից, դեզօքսիրիբոզային շաքարից և ֆոսֆատային խմբից: Այս dNTP-ները միանում են միմյանց հետ ֆոսֆոդիստերային կապերի միջոցով: dNTP-ներում կա OH խումբ, որը կցված է պենտոզա շաքարի 3ʹ դիրքին, որը անհրաժեշտ է կապ ստեղծելու ֆոսֆատային խմբի հետ, որը կցված է հաջորդ նուկլեոտիդի շաքարի 5' ածխածինին: Քանի որ բոլոր dNTP-ներն ունեն այս 3ʹ-OH խումբը, նրանք ունակ են սինթեզելու և ընդլայնելու ԴՆԹ-ի շղթաները: Հետևաբար, dNTP-ն գործում է որպես ԴՆԹ-ի և գեների քիմիական նյութի հիմնական կրկնվող միավոր: ԴՆԹ-ի սինթեզը միշտ ընթանում է 5ʹ-ից մինչև 3ʹ:
Ի՞նչ է DdNTP?
Սանգերի հաջորդականությունը ԴՆԹ-ի հաջորդականացման առաջին սերնդի մեթոդ է, որը մշակվել է Ֆրեդերիկ Սանգերի և նրա քոլեջների կողմից 1977 թվականին: Այն նաև հայտնի է որպես շղթայի ավարտման հաջորդականություն կամ դիդեօքսի հաջորդականություն, քանի որ այս մեթոդի հիմնական սկզբունքն է շղթայի ավարտը դիօքսինուկլեոզիդ եռաֆոսֆատների միջոցով: (ddNTPs): ddNTP-ները նուկլեոտիդներ են, որոնք օգտագործվում են Sanger հաջորդականության մեջ:Sanger-ի հաջորդականությունը հիմնված է ddNTP-ների ընտրովի ընդգրկման և ԴՆԹ-ի սինթեզի դադարեցման վրա in vitro ԴՆԹ-ի վերարտադրման ընթացքում: ddNTP-ների առանձնահատկությունն այն է, որ նրանց պակասում է 3ʹ-OH խումբ պենտոզայի շաքարի վրա, որպեսզի շարունակեն ֆոսֆոդիստերային կապի ձևավորումը հարակից նուկլեոտիդում 5ʹ ֆոսֆատային խմբի միջև: Հետևաբար, երբ ddNTP-ը կցվում է ձգվող շղթային, շղթայի երկարացումը դադարում է և ավարտվում այդ կետից: ddNTP-ները գործում են որպես ԴՆԹ պոլիմերազի շղթայի երկարացնող արգելիչներ Sanger հաջորդականության մեթոդի ժամանակ:
Նկար 02. ddNTP
Կա չորս ddNTP՝ ddATP, ddCTP, ddGTP և ddTTP, որոնք օգտագործվում են Sanger հաջորդականության մեջ: Այս նուկլեոտիդները դադարեցնում են ԴՆԹ-ի վերարտադրության գործընթացը, երբ դրանք ներառվում են ԴՆԹ-ի աճող շղթայի մեջ: Արդյունքում, Sanger հաջորդականությունը առաջացնում է տարբեր երկարությունների կարճ ԴՆԹ:Մազանոթային գելային էլեկտրոֆորեզը օգտագործվում է ԴՆԹ-ի այս կարճ շղթաները գելի վրա իրենց չափերով կազմակերպելու համար: ddNTP-ները ռադիոակտիվ կամ լյումինեսցենտային կերպով պիտակավորված են տարբեր գույներով՝ ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը վերլուծելու համար: Գելը վերլուծելով՝ կարելի է որոշել ԴՆԹ-ի անհայտ շղթայի նուկլեոտիդային հաջորդականությունը։
Որո՞նք են նմանությունները dNTP-ի և DdNTP-ի միջև:
- Եվ dNTP-ն և ddNTP-ն օգտագործվում են Sanger հաջորդականության մեջ:
- Կա չորս տեսակի dNTP-ներ և ddNTP-ներ:
- Դրանք կազմված են երեք բաղադրիչներից՝ ազոտային հիմք, դեզօքսիռիբոզ շաքար և ֆոսֆատ խմբեր։
Ո՞րն է տարբերությունը dNTP-ի և DdNTP-ի միջև:
dNTP-ն դեզօքսիռիբոնուկլեոտիդների չորս տեսակներից մեկն է, որոնք ԴՆԹ-ի կառուցման բլոկներ են: ddNTP-ն դիդեօքսիռիբոնուկլեոզիդ տրիֆոսֆատների չորս տեսակներից մեկն է, որն օգտագործվում է Սանգերի հաջորդականացման տեխնիկայում։ dNTP-ն ունի 3ʹ-OH խումբ պենտոզայի շաքարի վրա, մինչդեռ ddNTP-ն չունի 3ʹ-OH խումբ պենտոզայի շաքարի վրա:Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է dNTP-ի և ddNTP-ի միջև: Ավելին, dNTP-ները իրականացնում են ԴՆԹ պոլիմերացում, մինչդեռ ddNTP-ները դադարեցնում են ԴՆԹ պոլիմերացումը: Հետևաբար, սա ևս մեկ հիմնական տարբերություն է dNTP-ի և ddNTP-ի միջև:
Ստորև բերված ինֆոգրաֆիկան ցույց է տալիս dNTP-ի և ddNTP-ի տարբերությունները աղյուսակային տեսքով:
Ամփոփում – dNTP vs DdNTP
Նորմալ dNTP-ները ԴՆԹ-ի կառուցողական բլոկներ են, մինչդեռ ddNTP-ները նուկլեոտիդներ են, որոնք օգտագործվում են Sanger-ի հաջորդականացման տեխնիկայում: dNTP-ն ունի 3ʹ-OH, մինչդեռ ddNTP-ն չունի 3ʹ-OH: Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է dNTP-ի և ddNTP-ի միջև: Ավելին, dNTP-ն կարող է սինթեզել ԴՆԹ-ի շղթան, մինչդեռ ddNTP-ն կարող է դադարեցնել ԴՆԹ-ի պոլիմերացումը: Հետևաբար, ddNTP-ները օգտագործվում են Sanger հաջորդականության մեջ՝ տարբեր երկարություններով ԴՆԹ-ի տարբեր շղթաներ արտադրելու համար: Sanger-ի հաջորդականության ընթացքում ներառված են և՛ dNTP, և՛ ddNTP:
