Սինթենիայի և կոլինայնության հիմնական տարբերությունն այն է, որ սինթենիան գենետիկական տեղաբաշխման ֆիզիկական տեղայնացումն է նույն քրոմոսոմի վրա, մինչդեռ համակցվածությունը գենետիկական տեղաբաշխման ֆիզիկական համատեղ տեղայնացումն է նույն քրոմոսոմի վրա տարբեր տեսակների պահպանմամբ: նույն կարգը։
Synteny և collinearity երկու տերմիններ են, որոնք օգտագործվում են գենոմիկայի մեջ փոխադարձաբար: Երկու տերմիններն էլ նկարագրում են տարբեր տեսակների քրոմոսոմների վրա գեների տեղայնացման օրինաչափությունները: Այս առնչվող գենային պայմանավորվածությունները տաքսոնների միջև արժեքավոր տեղեկատվություն են գեների ընդհանուր ծագումը ենթադրելիս: Synteny-ն վերաբերում է տեսակների նույն քրոմոսոմի վրա գենետիկական տեղանքների ֆիզիկական համատեղ տեղայնացմանը:Կոլինայնությունը վերաբերում է գենետիկական տեղանքների ֆիզիկական համատեղ տեղայնացմանը նույն քրոմոսոմում տարբեր տեսակների մեջ, որոնք պահպանում են նույն կարգը: Հետևաբար, դա սինթենիայի ձև է։
Ի՞նչ է Synteny?
Տարբեր տեսակների մեջ կա գեների մի շարք, որոնք տեղակայված են նույն քրոմոսոմում: Եվ, տարբեր տեսակների նույն քրոմոսոմի վրա գեների այս ֆիզիկական համատեղ տեղայնացումը հայտնի է որպես սինթենիա: Բացի այդ, այս գեները գտնվում են միմյանց շատ մոտ մեկ քրոմոսոմում: Պարտադիր չէ, որ գեների հերթականությունը նույնը լինի: Սակայն գեների տեղայնացումը միմյանց մոտ միևնույն քրոմոսոմում տեղի է ունենում սինթենիայում։ Հետևաբար, synteny-ն հիմնականում նկարագրում է գեների բաշխման ձևը քրոմոսոմի վրա։ Գենի համատեղայնացման այս օրինաչափությունները ցույց են տալիս տարբեր տեսակների և դրանց էվոլյուցիայի միջև փոխհարաբերությունները: Այնուամենայնիվ, սինթենիան կարող է խաթարվել քրոմոսոմային վերադասավորումների պատճառով, ինչպիսիք են տրանսլոկացիաները, ինվերսիոն և քրոմոսոմների միաձուլումը և այլն, կրկնապատկումներ, կորուստներ և անհավասար հոմոլոգ ռեկոմբինացիա:
Նկար 01. Synteny
Ենթադրվում է, որ բոլոր կապված գեները սինթենիկ են: Այնուամենայնիվ, ոչ բոլոր սինթենիկ գեներն են անպայման կապված: Նրանք ունեն ընդհանուր քրոմոսոմային հաջորդականություն: Մարդիկ շատ սինթենիկ գեներ ունեն այլ կաթնասունների հետ: Ավելին, շատ հացահատիկներ ունեն սինթենիկ գեներ։
Ի՞նչ է համակցվածությունը:
Colinearity-ը սինթենիայի ավելի կոնկրետ ձև է, որի դեպքում գեների մի շարք գտնվում են տարբեր տեսակների միևնույն քրոմոսոմի վրա նույն կարգով, ինչ նախնիների տեսակներում: Հետևաբար, եթե առկա է կոլինայնությունից շեղում, դա կլինի ավելի հուսալի ֆիլոգենետիկ բնույթ, քանի որ կոլինայնությունը բացատրում է գեների ընդհանուր ծագումը:
Գծապատկեր 02. Համագծայինություն
Բազմուղիների համակցվածության վերլուծությունը շատ ավելի հուսալի տեղեկատվություն է տալիս հարակից տեսակների և նրանց ֆիլոգենության մասին:
Որո՞նք են նմանությունները Synteny-ի և Collinearity-ի միջև:
- Ե՛վ սինթենիայում, և՛ համակցվածության մեջ երկու տարբեր տեսակների տեղորոշիչների մի շարք գտնվում է նույն քրոմոսոմում:
- Այս տերմինները նկարագրում են նույն քրոմոսոմում գենետիկական տեղանքների ֆիզիկական համատեղ տեղայնացումը:
- Colinearity-ը սինթենիայի ավելի կոնկրետ ձև է:
- Երբեմն երկու տերմիններն էլ փոխադարձաբար օգտագործվում են գենոմիկայի մեջ:
- Եթե երկու շրջաններ ունեն համակցվածություն, ապա դրանք ակնհայտորեն սինթեն են:
- Օգտակար են ֆիլոգենիայի եզրակացության մեջ:
Ո՞րն է տարբերությունը Synteny-ի և Collinearity-ի միջև:
Synteny և collinearity երկու տերմիններ են, որոնք օգտագործվում են գենոմիկայի մեջ փոխադարձաբար: Synteny-ն վերաբերում է տարբեր տեսակների միևնույն քրոմոսոմում մի շարք գեների ֆիզիկական համատեղ տեղայնացմանը: Collinearity-ը սինթենիայի ձև է, որի դեպքում գեների հավաքածուն համատեղայնացվում է նույն կարգով տարբեր տեսակների միջև: Հետևաբար, սա հիմնական տարբերությունն է synteny-ի և collinearity-ի միջև:
Ամփոփում – Synteny vs Collinearity
Սինթենիա և կոլինայնություն տերմինները վերաբերում են մի շարք գեների, որոնք գտնվում են տարբեր տեսակների միևնույն քրոմոսոմում: Փաստորեն, այս գեները համատեղայնացված են նույն քրոմոսոմում տարբեր տեսակների մեջ: Synteny-ը նկարագրում է բազմատեսակ գեների ֆիզիկական համատեղ տեղայնացումը նույն քրոմոսոմի վրա տարբեր տեսակների մեջ, մինչդեռ կոլինայնությունը սինթենիայի ավելի հատուկ ձև է, որում գեների բազմությունը համատեղայնացվում է նույն կարգով:Այսպիսով, սա ամփոփում է սինթենիայի և համակցվածության միջև եղած տարբերությունը:
