Սիս-ի և տրանս զուգավորման միջև հիմնական տարբերությունն այն է, որ ցիս սփլայսինգը ներմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները և միանում էկզոններին, որոնք գտնվում են նույն ՌՆԹ-ի տառադարձման մեջ, մինչդեռ տրանս-սպլայսինգը միջմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները կամ աուտրոնները և միանում է էկզոններին, որոնք չեն գտնվում նույն ՌՆԹ-ի տառադարձման մեջ։
ՌՆԹ-ի միացումը ՌՆԹ-ի մշակման ձև է մինչև սպիտակուցի սինթեզը: Այս գործընթացում նոր ստացված նախասեսսենջային ՌՆԹ-ի տառադարձումը վերածվում է հասուն սուրհանդակային ՌՆԹ-ի: Հասուն սուրհանդակային ՌՆԹ-ն օգնում է արտադրել սպիտակուցի մոլեկուլ: ՌՆԹ-ի միացման ժամանակ ինտրոնները (ոչ կոդավորող շրջանները) հեռացվում են, իսկ էկզոնները (կոդավորող շրջանները) միանում են՝ հասուն մՌՆԹ-ն ստեղծելու համար։Cis-ը և trans splicing-ը ՌՆԹ-ի միացման մեխանիզմների երկու տեսակ են:
Ի՞նչ է Cis Splicing-ը:
Cis զուգավորումը ներմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները և միանում էկզոններին, որոնք գտնվում են նույն ՌՆԹ-ի տառադարձման մեջ: Նորմալ cis splicing-ը մշակում է մեկ ՌՆԹ մոլեկուլ: Cis splicing-ը պրեմՌՆԹ-ի տիպիկ միացման գործընթացն է, որն իրականացվում է սպլիցեսոմների կողմից: Ինտրոնում դոնոր տեղամասը (ինտրոնի 5' ծայրը), ճյուղային տեղամասը (ինտրոնի 3' ծայրին մոտ) և ընդունող տեղամասը (ինտրոնի 3' ծայրը) խիստ կարևոր են միաձուլման համար: Միաձուլման դոնոր կայքը ներառում է անփոփոխ հաջորդականություն GU ինտրոնի 5' վերջում: Ինտրոնի 3' վերջում միաձուլման ընդունիչ տեղամասն ունի անփոփոխ AG հաջորդականություն: AG հաջորդականությունից վերևում կա մի շրջան, որը կոչվում է պիրիմիդինային շրջան (պոլիպիրիմիդինային տրակտ): Պոլիպիրիմիդինային տրակտից ավելի վերևում կա ճյուղավոր կետ, որը ներառում է ադենոզինի նուկլեոտիդ: Այս նուկլեոտիդը մասնակցում է լարիատի ձևավորմանը:
Նկար 01. Cis և Trans Splicing
Խոշոր սպլայսոսոմներն են՝ U1, U2, U4, U5 և U6: Դրանցից շատ կարևոր են U1-ը և U2-ը։ Cis splicing-ում U1-ը կապվում է 5’ միացման տեղամասին, իսկ U2-ը կապվում է 3’ միացման տեղամասի մոտ գտնվող ճյուղավորման կետին: U5/U4/U6-ը կապում է էկզոնները 5' տեղում, իսկ U6-ը կապում է U2-ին: Ավելի ուշ թողարկվում է U1-ը։ U5-ը էկզոնից տեղափոխվում է ինտրոն, իսկ U6-ը կապվում է 5' միացման տեղում: Բացի այդ, թողարկվել է նաև U4-ը: U6/U2-ը կատալիզացնում է տրանսեսթերիֆիկացումը՝ դարձնելով ինտրոնի 5' ծայրը կապակցելով ինտրոնի վրա գտնվող A նուկլեոտիդին: Սա խթանում է լարիատի ձևավորումը: Լարիատի ձևավորման ժամանակ U5-ը կապում է էկզոնը 3' միացման տեղում, իսկ 5' տեղը ճեղքվում է: Միացման վերջնական փուլում U2/U5/U6-ը մնում է կապված լարիատի հետ, և 3' տեղամասը կտրվում է: Բացի այդ, էկզոնները կապվում են այս փուլում ATP հիդրոլիզի միջոցով:
Ի՞նչ է Trans Splicing?
Trans splicing-ը միջմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները կամ աուտրոնները և միանում էկզոններին, որոնք չեն գտնվում նույն ՌՆԹ-ի տառադարձման մեջ: Տրանս-սփլայսինգի ժամանակ չկա 5' միացման տեղ premRNA մոլեկուլի վրա, որպեսզի U1 սպիտակուցը կապվի: Փոխարենը, կափարիչ միացման առաջնորդը (SL) ՌՆԹ-ն տրանսպլիզացվում է աուտրոնում հաջորդականությամբ:
Գծապատկեր 02. Տրանս միացում
Outron-ը նախնական mRNA-ի շրջան է 5' գլխարկի և տրանս միացման տեղամասի միջև: Այնուամենայնիվ, U2 սպիտակուցը սովորաբար կապվում է 3' միացման վայրին: Աուտրոնը հեռացնելուց հետո միաձուլման առաջնորդը (SL) էկզոնը միացվում է նախնական mRNA-ի առաջին էկզոնին: Ավելին, trans-splicing-ը մեխանիզմ է, որը նկատվում է որոշ միկրոօրգանիզմների մեջ, ինչպիսիք են Kinetoplastae դասի պրոտիստները՝ գեներն արտահայտելու համար:
Որո՞նք են նմանությունները Cis-ի և Trans Splicing-ի միջև:
- Cis և trans splicing-ը ՌՆԹ-ի միացման մեխանիզմների երկու տեսակ են:
- Երկու մեխանիզմներում էլ ինտրոնները հեռացվում են։
- Նաև, երկու մեխանիզմներում էլ էկզոնները միանում են՝ ձևավորելով հասուն mRNA:
- Երկու մեխանիզմներն էլ հայտնաբերվել են էուկարիոտներում:
- Այս մեխանիզմները բացակայում են պրոկարիոտներում:
Ո՞րն է տարբերությունը Cis-ի և Trans Splicing-ի միջև:
Cis զուգավորումը ներմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները և միանում էկզոններին, որոնք գտնվում են նույն ՌՆԹ-ի տառադարձման մեջ, մինչդեռ տրանս-սպլայսինգը միջմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները կամ աուտրոնները և միանում է էկզոններին, որոնք նույն ՌՆԹ-ում չեն։ սղագրություն. Այսպիսով, սա հիմնական տարբերությունն է cis-ի և trans splicing-ի միջև: Ավելին, cis splicing-ում ինտրոնները հեռացվում են՝ ձևավորելու հասուն mRNA: Մյուս կողմից, trans splicing-ում ինտրոնները կամ աուտրոնները հեռացվում են՝ ձևավորելու հասուն mRNA:
Հետևյալ ինֆոգրաֆիկայում թվարկված են cis և trans splicing-ի տարբերությունները աղյուսակային տեսքով՝ կողք կողքի համեմատելու համար:
Ամփոփում – Cis vs Trans Splicing
ՌՆԹ-ի միացումը ՌՆԹ-ի մշակման ձև է մինչև սպիտակուցի սինթեզի գործընթացը: Cis-ը և trans splicing-ը ՌՆԹ-ի միացման մեխանիզմների երկու տեսակ են, որոնք հայտնաբերված են էուկարիոտներում: Cis splicing-ը ներմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները և միանում էկզոններին, որոնք գտնվում են նույն ՌՆԹ-ի տրանսկրիպտում, մինչդեռ տրանս-սպլայսինգը միջմոլեկուլային մեխանիզմ է, որը հեռացնում է ինտրոնները կամ աուտրոնները և միանում էկզոններին, որոնք նույն ՌՆԹ-ի տառադարձման մեջ չեն: Այսպիսով, սա ավարտում է cis-ի և trans splicing-ի տարբերության քննարկումը:
